Критическая оценка прогнозирования взаимодействий

Критическая оценка прогнозирования взаимодействий (CAPRI) — это эксперимент всего сообщества по моделированию молекулярной структуры белковых комплексов , также известный как стыковка белок-белок .

КАПРИ ^{[ 1 ]} представляет собой непрерывную серию мероприятий, в которых исследователи всего сообщества пытаются стыковать одни и те же белки, предоставленные экспертами. Раунды проходят примерно раз в полгода. Каждый раунд содержит от одного до шести целевых белок-белковых комплексов, структура которых недавно определена экспериментально. Координаты и хранятся в частном порядке у экспертов при содействии структурных биологов, которые их определили. Эксперимент CAPRI является двойным слепым , в том смысле, что отправители не знают решенной структуры, а эксперты не знают соответствия между представлением и личностью его создателя.

См. также

Критическая оценка методов прогнозирования структуры белка (CASP) - аналогичное упражнение в области прогнозирования структуры белка.
Критическая оценка функциональной аннотации (CAFA)

Ссылки

^ Жоэль Жанен; Ким Хенрик; Джон Моулт; Линн Тен Эйк; Майкл Дж. Э. Штернберг; Шандор Вайда; Илья Ваксер; Шошана Водак (1 июля 2003 г.). «CAPRI: критическая оценка предсказанных взаимодействий». Белки . 52 (1): 2–9. CiteSeerX 10.1.1.461.3355 . дои : 10.1002/PROT.10381 . ISSN 1097-0134 . ПМИД 12784359 . S2CID 31489448 . Викиданные Q28208450 .

Внешние ссылки

Официальный сайт
CAPRI или: Каково состояние белок-белкового стыковки? Архивировано 12 ноября 2011 г. в Wayback Machine.

Список серверов прогнозов, участвующих в CAPRI

КлусПро
ГРАМ-Х
FireDock
ХЕДДОК. Архивировано 29 января 2020 г. в Wayback Machine - ДОКИРОВАНИЕ белков с белками, основанное на высокой неоднозначности.
pyDockWEB — Структурное предсказание белок-белковых взаимодействий
ПатчДок
SmoothDock
3D-Garden — глобальная и ограниченная связь между исследованиями стыковок
SwarmDock. Архивировано 19 апреля 2021 г. на Wayback Machine.
ДОК/ПИРОГ
SPIDER - Оценка белок-белковых взаимодействий

Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

Эта молекулярному моделированию, статья, посвященная незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid12784359-1] Жоэль Жанен; Ким Хенрик; Джон Моулт; Линн Тен Эйк; Майкл Дж. Э. Штернберг; Шандор Вайда; Илья Ваксер; Шошана Водак (1 июля 2003 г.). «CAPRI: критическая оценка предсказанных взаимодействий». Белки . 52 (1): 2–9. CiteSeerX 10.1.1.461.3355 . дои : 10.1002/PROT.10381 . ISSN 1097-0134 . ПМИД 12784359 . S2CID 31489448 . Викиданные Q28208450 .

[ 1 ]