Манхэттенский сюжет

Манхэттенский график — это тип графика , обычно используемый для отображения данных с большим количеством точек данных, многие из которых имеют ненулевую амплитуду и с распределением значений более высокой величины. Этот график обычно используется в полногеномных исследованиях ассоциаций (GWAS) для отображения значимых SNP . ^[1]

Он получил свое название из-за сходства такого участка с Манхэттена горизонтом : профиль небоскребов, возвышающихся над «зданиями» нижнего уровня, высота которых варьируется в пределах меньшей.

ГВАС

На манхэттенских графиках GWAS координаты генома отображаются вдоль оси x , а отрицательный логарифм ассоциации значения p - для каждого однонуклеотидного полиморфизма (SNP) отображается на оси y , что означает, что каждая точка на манхэттенском графике означает СНП. Поскольку самые сильные ассоциации имеют наименьшие значения p (например, 10 ⁻¹⁵), их отрицательные логарифмы будут наибольшими (например, 15). Различные цвета каждого блока обычно показывают размер каждой хромосомы.

Ссылки

^ Гибсон, Грег (2010). «Намёки на скрытую наследственность в GWAS». Природная генетика . 42 (7): 558–560. дои : 10.1038/ng0710-558 . ПМИД 20581876 . S2CID 34546516 .

Эта статистике статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[East-1] Гибсон, Грег (2010). «Намёки на скрытую наследственность в GWAS». Природная генетика . 42 (7): 558–560. дои : 10.1038/ng0710-558 . ПМИД 20581876 . S2CID 34546516 .

[1]