База данных генов рака шейки матки
 | |
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | гены, участвующие в развитии рака шейки матки . |
| Дата выпуска | 2010 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | http://crdd.osdd.net/raghava/ccdb |
| Инструменты | |
| Интернет | ВЗРЫВ |
База данных генов рака шейки матки (CCDB) представляет собой базу данных генов, участвующих в канцерогенезе шейки матки . [1] База данных по раку шейки матки — первая база данных, созданная вручную. [2] База данных служит для клиницистов и исследователей возможностью изучения базовой, а также расширенной информации о генах, которые дифференцируются в рак шейки матки. [3] В CCBD занесено 537 генов. Гены, которые были каталогизированы на основе полиморфизма, метилирования, амплификации генов и изменения способа экспрессии гена. Научные исследователи изучили данные, сравнивающие нормальные клетки шейки матки со злокачественными клетками шейки матки, которые использовались для изучения различных экспрессий генов, которые приводят к раку шейки матки. Из 500 000 женщин, заболевших шейкой матки, большинство — из развивающихся стран, а также из развитых стран с низким социально-экономическим уровнем. CCBD предназначен для предоставления информации о новых терапевтических методах лечения основной причины рака среди женщин. [4]
Компоненты
[ редактировать ]- микроРНК гена
- отчет PubMed о гене
- ген-хозяин и мишень
- расположение, а также изменение кратности белка
- экспрессия или изменение гена.
Использование
[ редактировать ]База данных рака шейки матки состоит из данных, которые пользователи (исследователи и врачи) системы могут узнать, приводит ли тот или иной ген к проявлению рака шейки матки. Врачи и исследователи также смогут собирать данные о генах, которые могут дифференцироваться в рак шейки матки. Существует несколько форм рака шейки матки, которые гиперметилируются. [5] CCDB предоставляет соответствующие данные о том, какой ген-супрессор опухолей подавляет экспрессию генов рака шейки матки. [ нужна ссылка ]
Доступ
[ редактировать ]Клиницисты или исследователи могут искать ген, используя номер хромосомы гена, идентификатор гена или название гена. [6] Исследователи могут добавлять информацию о генах, кодирующих рак шейки матки, но прежде чем данные будут добавлены в базу данных, они должны быть проверены научным сообществом. [7]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Агарвал, Субхаш М; Рагхав Дхвани; Сингх Хариндер; Рагхава GPS (январь 2011 г.). «CCDB: тщательно подобранная база данных генов, участвующих в развитии рака шейки матки» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных). Англия: D975–9. дои : 10.1093/нар/gkq1024 . ПМК 3013652 . ПМИД 21045064 .
- ^ Агарвал, С.М.; Агарвал, С.М.; Рагхав, Д.; Сингх, Х.; Рагхава, GPS (2010). «CCDB: тщательно подобранная база данных генов, участвующих в формировании нуклеиновых кислот рака шейки матки». GPS .
- ^ Хаким, А.А.; Лин ПС; Вильчинский С; Нгуен К; Лайнс Б; Вакабаяси MT. (2010). «Показания и эффективность вакцины против вируса папилломы человека». Курс. Лечите варианты Онкол . 8 (6): 393–401. дои : 10.1007/s11864-007-0050-0 . ПМИД 18172770 . S2CID 207322276 .
- ^ Фонгсаван, Кеокедтонг; Пхенгсаван, Алонгконе; Вальстрем, Рольф; Марионс, Лена (июнь 2010 г.). «Восприятие женщинами рака шейки матки и его профилактика в сельском Лаосе». Международный журнал гинекологического рака . 20 (5): 821–826. doi : 10.1111/IGC.0b013e3181daaefb . ПМИД 20606529 . S2CID 27963086 .
- ^ Хагеманн Т, Т.; Бозанович, Т; Хупер, С; Любич, А; Слеттенаар, VI; Уилсон, Дж.Л.; Сингх, Н; Гейтер, ЮАР; и др. (2007). «Молекулярное профилирование прогрессирования рака шейки матки» . Бр. Дж. Рак . 96 (2): 321–328. дои : 10.1038/sj.bjc.6603543 . ПМК 2360010 . ПМИД 17242701 .
- ^ Сэйерс, EW; Барретт Т; Бенсон Д.А.; Болтон Э; Брайант Ш.; Канезе К; Четвернин В; Церковь ДМ; Дикуччо М; и др. (2010). «Ресурсы базы данных Национального центра биотехнологической информации» . Нуклеиновые кислоты Рез . 38 (Проблема с базой данных): D5–D16. дои : 10.1093/nar/gkp967 . ПМЦ 2808881 . ПМИД 19910364 .
- ^ Онгенарт, М; Ван Несте Л; Де Мейер Т; Меншерт Г; Бекарт С; Ван Крикинг В. (2008). «PubMeth: база данных метилирования рака, сочетающая анализ текста и экспертные аннотации» . Нуклеиновые кислоты Рез . 36 (Проблема с базой данных): D842–D846. дои : 10.1093/нар/gkm788 . ПМК 2238841 . ПМИД 17932060 .