Энтеротип

Энтеротип кишечной — это классификация живых организмов, основанная на бактериологическом составе их микробиоты . Об открытии трёх энтеротипов человека было объявлено в апрельском выпуске журнала Nature за 2011 год Пером Борком и его коллегами. ^{[ 1 ]} Они обнаружили, что энтеротипы не зависят от возраста, пола, массы тела или национальной принадлежности. ^{[ 2 ]} Есть признаки того, что длительная диета влияет на энтеротип. ^{[ 3 ]} Тип 1 характеризуется высоким уровнем Bacteroides , тип 2 имеет небольшое количество Bacteroides , но Prevotella распространены , а тип 3 имеет высокий уровень Ruminococcus . ^{[ 1 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Ценность классификации по энтеротипам подвергается сомнению. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

В исследовании кишечных бактерий детей в Буркина-Фасо (в Африке) Prevotella составляла 53% кишечных бактерий, но отсутствовала у европейских детей того же возраста. ^{[ 8 ]}

Исследования также показывают, что долгосрочная диета тесно связана с составом микробиома кишечника : у тех, кто ест много белков и животных жиров, типичных для западной диеты, преобладают бактерии Bacteroides , а у тех, кто потребляет больше углеводов, особенно клетчатки, Prevotella. доминируют виды . ^{[ 9 ]}

У шимпанзе есть энтеротипы, по составу аналогичные энтеротипам человека. Используя продольные выборки, исследователи обнаружили, что энтеротип отдельных шимпанзе со временем менялся. ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Циммер, Карл (20 апреля 2011 г.). «Бактерии делят людей на 3 типа, говорят ученые» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 21 апреля 2011 г. группа ученых теперь сообщает только о трех различных экосистемах в кишечнике людей, которых они изучали.
^ Арумугам М., Раес Дж. и др. (апрель 2011 г.). «Энтеротипы микробиома кишечника человека» . Природа . 473 (7346): 174–80. Бибкод : 2011Natur.473..174. . дои : 10.1038/nature09944 . ПМЦ 3728647 . ПМИД 21508958 . Наши знания о видах и функциональном составе микробиома кишечника человека быстро растут, но они по-прежнему основаны на очень небольшом количестве когорт, и мало что известно о вариациях по всему миру. Объединив 22 недавно секвенированных фекальных метагенома людей из четырех стран с ранее опубликованными наборами данных, здесь мы идентифицируем три надежных кластера (далее называемых энтеротипами), которые не являются специфичными для страны или континента.
^ Ву Г.Д., Чен Дж., Хоффманн С., Биттингер К., Чен Ю.И. и др. (2011). «Связь долгосрочного режима питания с энтеротипами кишечных микробов» . Наука . 334 (6052): 105–108. Бибкод : 2011Sci...334..105W . дои : 10.1126/science.1208344 . ПМЦ 3368382 . ПМИД 21885731 .
^ Кейм, Брэндон (20 апреля 2011 г.). «Картирование кишечных бактерий выявило три глобальные разновидности» . Проводной журнал . Проверено 21 апреля 2011 г.
^ Коглан, Энди (20 апреля 2011 г.). «У каждого человека есть одна из трех кишечных экосистем» . Новый учёный . Проверено 21 апреля 2011 г.
^ Найтс, Дэн; Уорд, Тоня; МакКинли, Кристофер; Миллер, Ханна; Гонсалес, Антонио; Макдональд, Дэниел; Найт, Роб (8 октября 2014 г.). «Переосмысление «Энтеротипов» » . Клетка-хозяин и микроб . 16 (4): 433–437. дои : 10.1016/j.chom.2014.09.013 . ПМК 5558460 . ПМИД 25299329 .
^ Горвитовская, Анастасия; Холмс, Сьюзен П.; Хьюз, Сьюзен М. (12 апреля 2016 г.). «Интерпретация Prevotella и Bacteroides как биомаркеров диеты и образа жизни» . Микробиом . 15 (4): 15. дои : 10.1186/s40168-016-0160-7 . ПМЦ 4828855 . ПМИД 27068581 .
^ Де Филиппо, К.; Кавальери, Д.; Ди Паола, М.; Рамазотти, М.; Пулле, Дж.Б.; Массарт, С.; Коллини, С.; Пьераччини, Г.; Лионетти, П. (2010). «Влияние диеты на формирование микробиоты кишечника выявлено в ходе сравнительного исследования у детей из Европы и сельской Африки» . Труды Национальной академии наук . 107 (33): 14691–6. Бибкод : 2010PNAS..10714691D . дои : 10.1073/pnas.1005963107 . ПМК 2930426 . ПМИД 20679230 .
^ Ву Г.Д., Чен Дж., Хоффманн С., Биттингер К., Чен Ю.И., Кейлбо С.А., Бьютра М., Найтс Д., Уолтерс В.А., Найт Р., Синха Р., Гилрой Э., Гупта К., Бальдассано Р., Нессель Л., Ли Х., Бушман Ф.Д. , Льюис Джей Ди (7 октября 2011 г.). «Связь долгосрочного режима питания с энтеротипами кишечных микробов» . Наука . 334 (6052): 105–8. Бибкод : 2011Sci...334..105W . дои : 10.1126/science.1208344 . ПМЦ 3368382 . ПМИД 21885731 .
^ Эндрю Х. Мёллер; Патрик Х. Дегнан; Энн Э. Пьюзи; Майкл Л. Уилсон; Беатрис Х. Хан; Говард Охман (13 ноября 2012 г.). «Шимпанзе и люди имеют схожие по составу энтеротипы кишечника» . Природные коммуникации . 3 (1179): 1179. Бибкод : 2012NatCo...3.1179M . дои : 10.1038/ncomms2159 . ПМК 3520023 . ПМИД 23149725 .

Эта микробиологии, статья, посвященная незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[NYT-1] Jump up to: ^а ^б Циммер, Карл (20 апреля 2011 г.). «Бактерии делят людей на 3 типа, говорят ученые» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 21 апреля 2011 г. группа ученых теперь сообщает только о трех различных экосистемах в кишечнике людей, которых они изучали.

[Nature-2] Арумугам М., Раес Дж. и др. (апрель 2011 г.). «Энтеротипы микробиома кишечника человека» . Природа . 473 (7346): 174–80. Бибкод : 2011Natur.473..174. . дои : 10.1038/nature09944 . ПМЦ 3728647 . ПМИД 21508958 . Наши знания о видах и функциональном составе микробиома кишечника человека быстро растут, но они по-прежнему основаны на очень небольшом количестве когорт, и мало что известно о вариациях по всему миру. Объединив 22 недавно секвенированных фекальных метагенома людей из четырех стран с ранее опубликованными наборами данных, здесь мы идентифицируем три надежных кластера (далее называемых энтеротипами), которые не являются специфичными для страны или континента.

[Wu_et_al-3] Ву Г.Д., Чен Дж., Хоффманн С., Биттингер К., Чен Ю.И. и др. (2011). «Связь долгосрочного режима питания с энтеротипами кишечных микробов» . Наука . 334 (6052): 105–108. Бибкод : 2011Sci...334..105W . дои : 10.1126/science.1208344 . ПМЦ 3368382 . ПМИД 21885731 .

[Wired-4] Кейм, Брэндон (20 апреля 2011 г.). «Картирование кишечных бактерий выявило три глобальные разновидности» . Проводной журнал . Проверено 21 апреля 2011 г.

[NewScientist-5] Коглан, Энди (20 апреля 2011 г.). «У каждого человека есть одна из трех кишечных экосистем» . Новый учёный . Проверено 21 апреля 2011 г.

[2014cellhostandmicrobentero-6] Найтс, Дэн; Уорд, Тоня; МакКинли, Кристофер; Миллер, Ханна; Гонсалес, Антонио; Макдональд, Дэниел; Найт, Роб (8 октября 2014 г.). «Переосмысление «Энтеротипов» » . Клетка-хозяин и микроб . 16 (4): 433–437. дои : 10.1016/j.chom.2014.09.013 . ПМК 5558460 . ПМИД 25299329 .

[2016microbiomejournalentero-7] Горвитовская, Анастасия; Холмс, Сьюзен П.; Хьюз, Сьюзен М. (12 апреля 2016 г.). «Интерпретация Prevotella и Bacteroides как биомаркеров диеты и образа жизни» . Микробиом . 15 (4): 15. дои : 10.1186/s40168-016-0160-7 . ПМЦ 4828855 . ПМИД 27068581 .

[8] Де Филиппо, К.; Кавальери, Д.; Ди Паола, М.; Рамазотти, М.; Пулле, Дж.Б.; Массарт, С.; Коллини, С.; Пьераччини, Г.; Лионетти, П. (2010). «Влияние диеты на формирование микробиоты кишечника выявлено в ходе сравнительного исследования у детей из Европы и сельской Африки» . Труды Национальной академии наук . 107 (33): 14691–6. Бибкод : 2010PNAS..10714691D . дои : 10.1073/pnas.1005963107 . ПМК 2930426 . ПМИД 20679230 .

[9] Ву Г.Д., Чен Дж., Хоффманн С., Биттингер К., Чен Ю.И., Кейлбо С.А., Бьютра М., Найтс Д., Уолтерс В.А., Найт Р., Синха Р., Гилрой Э., Гупта К., Бальдассано Р., Нессель Л., Ли Х., Бушман Ф.Д. , Льюис Джей Ди (7 октября 2011 г.). «Связь долгосрочного режима питания с энтеротипами кишечных микробов» . Наука . 334 (6052): 105–8. Бибкод : 2011Sci...334..105W . дои : 10.1126/science.1208344 . ПМЦ 3368382 . ПМИД 21885731 .

[10] Эндрю Х. Мёллер; Патрик Х. Дегнан; Энн Э. Пьюзи; Майкл Л. Уилсон; Беатрис Х. Хан; Говард Охман (13 ноября 2012 г.). «Шимпанзе и люди имеют схожие по составу энтеротипы кишечника» . Природные коммуникации . 3 (1179): 1179. Бибкод : 2012NatCo...3.1179M . дои : 10.1038/ncomms2159 . ПМК 3520023 . ПМИД 23149725 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]