Джонатан Марчини
Джонатан Марчини | |
|---|---|
 | |
| Рожденный | Джонатан Лоуренс Марчини Чичестер |
| Национальность | Британский |
| Альма-матер |
|
| Награды |
|
| Научная карьера | |
| Учреждения | |
| Диссертация | Статистический анализ изображений мозга (2002) |
| Докторантура | Брайан Рипли [ 2 ] |
| Веб-сайт | Джмарчини |
Джонатан Лоуренс Марчини (родился 19 мая 1973 г.) [ 3 ] — байесовский статистик и профессор статистической геномики. [ 4 ] на факультете статистики Оксфордского университета , научный сотрудник по статистике в Сомервиллском колледже , [ 5 ] Оксфорд, а также соучредитель и директор Gensci Ltd. [ 6 ] Он является соруководителем Консорциума по изучению гаплотипов. [ 7 ]
Образование
[ редактировать ]Он получил степень бакалавра наук в области чистой математики и математической статистики в Эксетерском университете (1991–94). [ 8 ] Затем он получил степень PGCE по математическому образованию в Институте высшего образования Западного Суссекса (1994–95). Он получил докторскую степень на факультете статистики Оксфордского университета под руководством профессора Брайана Рипли (1998–2002). [ 9 ]
Карьера и исследования
[ редактировать ]С сентября 1995 по сентябрь 1998 года Марчини три года работал волонтером VSO, преподавая математику A-level в средней школе Тосамаганга, недалеко от Иринги, Танзания. [ 10 ]
С 2002 по 2005 год он проходил стажировку Wellcome Trust по математической биологии под руководством профессора Лона Кардона и профессора Питера Доннелли.
В 2006 году он был назначен университетским преподавателем (доцентом) по статистической геномике на факультете статистики Оксфордского университета и старшим научным сотрудником Мэнсфилд-колледжа. В 2007 году он стал руководителем дочерней группы в Центре генетики человека Wellcome Trust. [ 11 ] в Оксфордском университете. В 2010 году его переназначили до выхода на пенсию. [ 12 ]
В 2015 году ему присвоено звание профессора статистической геномики. [ 13 ] [ 14 ]
Исследования Марчини сосредоточены на статистической генетике и популяционной генетике , с особым упором на разработку методов полногеномных ассоциативных исследований . Он работал над оценкой гаплотипов . [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] вменение генотипа, [ 19 ] вызов генотипов из массивов и секвенирование, разреженная тензорная декомпозиция для наборов данных RNA-seq, [ 20 ] структура населения, [ 21 ] предсказание фенотипа и смешанные модели, [ 22 ] ген-генные взаимодействия [ 23 ] и генетика визуализации мозга. [ 24 ]
Он был членом аналитической группы Международного проекта HapMap , Консорциума по контролю случаев заболевания Wellcome Trust, проекта «1000 геномов» и проекта UK10K. Его исследовательская группа отвечала за оценку гаплотипов и вменение генотипов для набора данных Британского биобанка. Он является соруководителем Консорциума по изучению гаплотипов. [ 25 ]
Он был высоко цитируемым исследователем ISI в 2014–2018 гг. [ 26 ]
Выступал в качестве свидетеля-эксперта в патентном процессе. [ 27 ]
Награды
[ редактировать ]В 2012 году он был удостоен премии Филипа Леверхалма. [ 28 ] за «лидерство в разработке мощной и гениальной новой статистической методологии популяционной и медицинской генетики, а также связанных с ней быстрых методов». вычислительные алгоритмы и программное обеспечение».
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Веб-сайт Леверхалма» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 02 апреля 2018 г. Проверено 1 апреля 2018 г.
- ^ Марчини, Дж.; Рипли, Б. (2000). «Новый статистический подход к обнаружению значительной активации при функциональной МРТ. Молекулярная эволюция». НейроИмидж . 12 (4): 366–80. дои : 10.1006/нимг.2000.0628 . ПМИД 10988031 . S2CID 54375337 .
- ^ «Домашняя запись компании» .
- ^ «Сайт Марчини» .
- ^ «Сайт Сомервилля» .
- ^ «Домашняя запись компании» .
- ^ «Сайт СПЧ» .
- ^ «Отчет Сомервиллского колледжа» (PDF) .
- ^ Марчини, Джонатан Л.; Рипли, Брайан Д. (октябрь 2000 г.). «Новый статистический подход к обнаружению значительной активации при функциональной МРТ». НейроИмидж . 12 (4): 366–380. дои : 10.1006/нимг.2000.0628 . ПМИД 10988031 . S2CID 54375337 .
- ^ «Фотоальбом» .
- ^ «Сайт WTCHG» .
- ^ «Ссылка на Оксфордскую газету» .
- ^ «Ссылка на Оксфордскую газету» . Архивировано из оригинала 16 сентября 2015 г. Проверено 1 апреля 2018 г.
- ^ «Ссылка на Оксфордскую газету» .
- ^ О'Коннелл, Джаред; Шарп, Кевин; Храм, Ник; Уэйн, Луиза ; Холл, Ян; Тобин, Мартин; Загури, Жан-Франсуа; Делано, Оливье; Марчини, Джонатан (6 июня 2016 г.). «Оценка гаплотипов для наборов данных в масштабах биобанка» . Природная генетика . 48 (7): 817–820. дои : 10.1038/ng.3583 . ПМЦ 4926957 . ПМИД 27270105 .
- ^ О'Коннелл, Джаред; Гурдасани, Дипти; Делано, Оливер; Пирасту, Никола; Уливи, Шейла; Кокка, Массимилиано; Тралья, Микела; Хуан, Цзе; Хаффман, Дженнифер Э.; Рудан, Игорь; Маккуиллан, Рут; Фрейзер, Росс М.; Кэмпбелл, Гарри; Поласек, Озрен; Смейся, Гершим; Экору, Кеннет; Хейворд, Кэролайн; Райт, Алан Ф.; Витарт, Вероника; Наварро, Пау; Загури, Жан-Франсуа; Уилсон, Джеймс Ф.; Тониоло, Даниэла; Гаспарини, Паоло; Сорансо, Николь; Сандху, Манджиндер С.; Марчини, Джонатан; Гибсон, Грег (17 апреля 2014 г.). «Общий подход к фазированию гаплотипов по всему спектру родства» . ПЛОС Генетика . 10 (4): e1004234. дои : 10.1371/journal.pgen.1004234 . ПМЦ 3990520 . ПМИД 24743097 .
- ^ Делано, Оливье; Хауи, Брайан; Кокс, Энтони Дж.; Загури, Жан-Франсуа; Марчини, Джонатан (октябрь 2013 г.). «Оценка гаплотипа с использованием считываний секвенирования» . Американский журнал генетики человека . 93 (4): 687–696. дои : 10.1016/j.ajhg.2013.09.002 . ПМЦ 3791270 . ПМИД 24094745 .
- ^ Делано, Оливье; Загури, Жан-Франсуа; Марчини, Джонатан (1 января 2013 г.). «Улучшенная полнохромосомная фазировка для исследований заболеваний и популяционной генетики». Природные методы . 10 (1): 5–6. дои : 10.1038/nmeth.2307 . ПМИД 23269371 . S2CID 205421216 .
- ^ Хауи, Брайан Н.; Доннелли, Питер; Марчини, Джонатан; Шорк, Николас Дж. (19 июня 2009 г.). «Гибкий и точный метод вменения генотипа для следующего поколения исследований полногеномных ассоциаций» . ПЛОС Генетика . 5 (6): e1000529. дои : 10.1371/journal.pgen.1000529 . ПМЦ 2689936 . ПМИД 19543373 .
- ^ Хор, Виктория; Виньуэла, Ана; Буил, Альфонсо; Найт, Джулиан; Маккарти, Марк I; Смолл, Керрин; Марчини, Джонатан (1 августа 2016 г.). «Тензорное разложение для экспериментов по экспрессии генов в нескольких тканях» . Природная генетика . 48 (9): 1094–1100. дои : 10.1038/ng.3624 . ПМК 5010142 . ПМИД 27479908 .
- ^ Марчини, Джонатан; Кардон, Лон Р.; Филлипс, Майкл С; Доннелли, Питер (28 марта 2004 г.). «Влияние структуры человеческой популяции на крупные исследования генетических ассоциаций» . Природная генетика . 36 (5): 512–517. дои : 10.1038/ng1337 . ПМИД 15052271 .
- ^ Даль, Эндрю; Иотчкова Валентина; Бод, Амели; Йоханссон, Оса; Гилленстен, Ульф; Сорансо, Николь; Мотт, Ричард; Кранис, Андреас; Марчини, Джонатан (22 февраля 2016 г.). «Метод вменения множественных фенотипов для генетических исследований» . Природная генетика . 48 (4): 466–472. дои : 10.1038/ng.3513 . ПМЦ 4817234 . ПМИД 26901065 .
- ^ Марчини, Джонатан; Доннелли, Питер; Кардон, Лон Р. (27 марта 2005 г.). «Общегеномные стратегии обнаружения множественных локусов, влияющих на сложные заболевания». Природная генетика . 37 (4): 413–417. дои : 10.1038/ng1537 . ПМИД 15793588 . S2CID 5922358 .
- ^ Эллиотт, Ллойд Т.; Шарп, Кевин; Альфаро-Альмагро, Фидель; Он, Там; Миллер, Карла; Дуо, Гвенаэль; Марчини, Джонатан; Смит, Стивен (2018). «Бумага BioRxiv» . дои : 10.1101/178806 .
{{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется|journal=( помощь ) - ^ «Сайт СПЧ» .
- ^ «Высоко цитируемые исследователи ISI» .
- ^ «Иллюмина против Премайты» .
- ^ «Веб-сайт Леверхалма» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 02 апреля 2018 г. Проверено 1 апреля 2018 г.
