Геномный отбор

Геномная селекция (GS) позволяет предсказать племенную ценность потомства в популяции путем связывания его признаков (например, устойчивости к вредителям) с показателями генетических маркеров высокой плотности. ^{[ 1 ]} GS — это метод, предложенный для устранения недостатков отбора с помощью маркеров (MAS) в программах селекции. Однако GS представляет собой форму MAS, которая отличается от него тем, что одновременно оценивает все генетические маркеры, гаплотипы или маркерные эффекты по всему геному для расчета значений геномной расчетной племенной ценности (GEBV). ^{[ 1 ]} Потенциал GS состоит в том, чтобы объяснить генетическое разнообразие программы разведения посредством широкого охвата полногеномных маркеров и оценить влияние этих маркеров на прогнозирование племенной ценности. ^{[ 2 ]}

Ограничения MAS

В отличие от MAS, который фокусируется на нескольких значимых маркерах, GS исследует вместе все маркеры в популяции. Поскольку первоначальное предложение GS ^{[ 1 ]} для применения в племенных популяциях он стал решением недостатков MAS. ^{[ 2 ]}

MAS выявил два основных ограничения в области селекции. используются популяции картирования двух родителей Во-первых, для большинства анализов QTL , что ограничивает их точность. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Это представляет собой проблему, поскольку одна популяция с двумя родителями не может отражать аллельное разнообразие и эффекты генетического фона в размножающейся популяции.

Более того, полигенные признаки (или сложные признаки), контролируемые несколькими маркерами с малым эффектом, стали невероятной проблемой для MAS. Статистические методы, примененные для идентификации целевых маркеров и внедрения MAS для улучшения полигенных признаков, оказались безуспешными. ^{[ 2 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с де Конинг DJ (май 2016 г.). «Мьювиссен и др. О геномной селекции» . Генетика . 203 (1): 5–7. дои : 10.1534/genetics.116.189795 . ПМЦ 4858795 . ПМИД 27183561 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Хеффнер Э.Л., Сорреллс М.Э., Яннинк Дж.Л. (январь 2009 г.). «Геномная селекция для улучшения сельскохозяйственных культур». Растениеводство . 49 (1): 1–12. дои : 10.2135/cropsci2008.08.0512 . {{cite journal}}: CS1 maint: дата и год ( ссылка )
^ Деккерс Дж. К., Больница F (январь 2002 г.). «Использование молекулярной генетики в улучшении сельскохозяйственных популяций». Обзоры природы. Генетика . 3 (1): 22–32. дои : 10.1038/nrg701 . ПМИД 11823788 . S2CID 32216266 .
^
- • Шен К.С., Утц Х.Ф., Гро С., Труберг Б., Опеншоу С., Мельчингер А.Е. (май 2004 г.). «Количественное картирование локуса признаков, основанное на повторной выборке в обширном эксперименте по тестовому скрещиванию кукурузы, и его значимость для количественной генетики сложных признаков» . Генетика . 167 (1): 485–498. дои : 10.1534/генетика.167.1.485 . ПМК 1470842 . ПМИД 15166171 .
- • Малуф, Джулин (2004). «Рекомендации профессорско-преподавательского состава по картированию локуса количественных признаков, основанному на повторной выборке в обширном эксперименте по тестированию кукурузы, и его актуальность для количественной генетики сложных признаков» . ООО Факультет Мнение . дои : 10.3410/f.1020376.234444 . S2CID 224103363 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
- • Яннинк, Жан-Люк; Лоренц, Эй Джей; Ивата, Х. (2010). «Геномная селекция в селекции растений: от теории к практике». Брифинги по функциональной геномике . 9 (2). Издательство Оксфордского университета (OUP): 166–177. дои : 10.1093/bfgp/elq001 . ISSN 2041-2649 . ПМИД 20156985 . S2CID 3379276 .
- • Варшней, РК; Руркивал, Маниш; Сорреллс, Марк Э. (2017). Геномная селекция для улучшения сельскохозяйственных культур: новые стратегии молекулярной селекции для улучшения сельскохозяйственных культур (1-е изд.). Чам, Швейцария : Springer International Publishing AG . стр. xii+258. дои : 10.1007/978-3-319-63170-7 . ISBN 978-3-319-63170-7 . OCLC 1015215250 . S2CID 6537864 . ISBN 978-3-319-63168-4 . ISBN 978-3-319-87489-0 . ^: 16

[de_Koning_2018-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с де Конинг DJ (май 2016 г.). «Мьювиссен и др. О геномной селекции» . Генетика . 203 (1): 5–7. дои : 10.1534/genetics.116.189795 . ПМЦ 4858795 . ПМИД 27183561 .

[Heffner_2019-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с Хеффнер Э.Л., Сорреллс М.Э., Яннинк Дж.Л. (январь 2009 г.). «Геномная селекция для улучшения сельскохозяйственных культур». Растениеводство . 49 (1): 1–12. дои : 10.2135/cropsci2008.08.0512 . {{cite journal}}: CS1 maint: дата и год ( ссылка )

[3] Деккерс Дж. К., Больница F (январь 2002 г.). «Использование молекулярной генетики в улучшении сельскохозяйственных популяций». Обзоры природы. Генетика . 3 (1): 22–32. дои : 10.1038/nrg701 . ПМИД 11823788 . S2CID 32216266 .

[Schon-4] 
• Шен К.С., Утц Х.Ф., Гро С., Труберг Б., Опеншоу С., Мельчингер А.Е. (май 2004 г.). «Количественное картирование локуса признаков, основанное на повторной выборке в обширном эксперименте по тестовому скрещиванию кукурузы, и его значимость для количественной генетики сложных признаков» . Генетика . 167 (1): 485–498. дои : 10.1534/генетика.167.1.485 . ПМК 1470842 . ПМИД 15166171 .
• Малуф, Джулин (2004). «Рекомендации профессорско-преподавательского состава по картированию локуса количественных признаков, основанному на повторной выборке в обширном эксперименте по тестированию кукурузы, и его актуальность для количественной генетики сложных признаков» . ООО Факультет Мнение . дои : 10.3410/f.1020376.234444 . S2CID 224103363 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
• Яннинк, Жан-Люк; Лоренц, Эй Джей; Ивата, Х. (2010). «Геномная селекция в селекции растений: от теории к практике». Брифинги по функциональной геномике . 9 (2). Издательство Оксфордского университета (OUP): 166–177. дои : 10.1093/bfgp/elq001 . ISSN 2041-2649 . ПМИД 20156985 . S2CID 3379276 .
• Варшней, РК; Руркивал, Маниш; Сорреллс, Марк Э. (2017). Геномная селекция для улучшения сельскохозяйственных культур: новые стратегии молекулярной селекции для улучшения сельскохозяйственных культур (1-е изд.). Чам, Швейцария : Springer International Publishing AG . стр. xii+258. дои : 10.1007/978-3-319-63170-7 . ISBN 978-3-319-63170-7 . OCLC 1015215250 . S2CID 6537864 . ISBN 978-3-319-63168-4 . ISBN 978-3-319-87489-0 . ^: 16

[5] • Шен К.С., Утц Х.Ф., Гро С., Труберг Б., Опеншоу С., Мельчингер А.Е. (май 2004 г.). «Количественное картирование локуса признаков, основанное на повторной выборке в обширном эксперименте по тестовому скрещиванию кукурузы, и его значимость для количественной генетики сложных признаков» . Генетика . 167 (1): 485–498. дои : 10.1534/генетика.167.1.485 . ПМК 1470842 . ПМИД 15166171 .

[6] • Малуф, Джулин (2004). «Рекомендации профессорско-преподавательского состава по картированию локуса количественных признаков, основанному на повторной выборке в обширном эксперименте по тестированию кукурузы, и его актуальность для количественной генетики сложных признаков» . ООО Факультет Мнение . дои : 10.3410/f.1020376.234444 . S2CID 224103363 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )

[7] • Яннинк, Жан-Люк; Лоренц, Эй Джей; Ивата, Х. (2010). «Геномная селекция в селекции растений: от теории к практике». Брифинги по функциональной геномике . 9 (2). Издательство Оксфордского университета (OUP): 166–177. дои : 10.1093/bfgp/elq001 . ISSN 2041-2649 . ПМИД 20156985 . S2CID 3379276 .

[8] • Варшней, РК; Руркивал, Маниш; Сорреллс, Марк Э. (2017). Геномная селекция для улучшения сельскохозяйственных культур: новые стратегии молекулярной селекции для улучшения сельскохозяйственных культур (1-е изд.). Чам, Швейцария : Springer International Publishing AG . стр. xii+258. дои : 10.1007/978-3-319-63170-7 . ISBN 978-3-319-63170-7 . OCLC 1015215250 . S2CID 6537864 . ISBN 978-3-319-63168-4 . ISBN 978-3-319-87489-0 . ^: 16

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]