МиРТарБаза
![]() | |
Содержание | |
---|---|
Описание | Экспериментально подтвержденные взаимодействия микроРНК с мишенью (MTI). |
Типы данных захвачен | Взаимодействия микроРНК-мишени |
Контакт | |
Исследовательский центр | Национальный университет Цзяо Дун |
Лаборатория | Институт биоинформатики и системной биологии |
Авторы | Шэн-Да Сюй |
Первичное цитирование | Сюй и др. (2011) [1] |
Дата выпуска | 2013 |
Доступ | |
Веб-сайт | http://mirtarbase.cuhk.edu.cn |
URL-адрес загрузки | http://mirtarbase.cuhk.edu.cn/php/download.php |
Разнообразный | |
Версия | 4.5 |
миРТарБаза [1] представляет собой курируемую базу данных взаимодействий микроРНК-мишени . В качестве базы данных miRTarBase накопила более пятидесяти тысяч взаимодействий микроРНК-мишень (MTI), которые собираются путем ручного просмотра соответствующей литературы после систематического анализа данных текста для фильтрации исследовательских статей, связанных с функциональными исследованиями микроРНК. Как правило, собранные MTI проверяются экспериментально с помощью репортерного анализа, вестерн-блоттинга, микрочипов и экспериментов по секвенированию следующего поколения. Содержащая наибольшее количество проверенных MTI, miRTarBase обеспечивает наиболее обновленную коллекцию по сравнению с другими аналогичными, ранее разработанными базами данных.

См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Сюй С.Д., Линь ФМ, Ву Вай, Лян С., Хуан В.К., Чан В.Л., Цай В.Т., Чен ГЗ, Ли СиДжей, Чиу СМ, Чиен Ч., Ву MC, Хуан С.И., Цоу А.П., Хуан HD (2011). «miRTarBase: база данных курирует экспериментально подтвержденные взаимодействия микроРНК и мишени» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (Проблема с базой данных): D163-9. дои : 10.1093/нар/gkq1107 . ПМК 3013699 . ПМИД 21071411 .