Хеликс 69
Спираль 69 представляет собой шпильку РНК, содержащую 19 нуклеотидов в большой субъединице рибосомы . [ 1 ] Рибосома состоит из больших и малых субъединиц, соединенных между собой мостиками. Спираль 69 взаимодействует со спиралью 44 (h44) малой субъединицы, образуя самую большую границу раздела двух субъединиц, называемую межсубъединичным мостиком B2a, одну из наиболее консервативных областей рибосомы. [ 2 ] Предполагается, что Helix 69 может стать хорошей мишенью для антибактериальных препаратов. Многие из недавних кристаллических структур показали участие этой шпильки на разных стадиях процесса трансляции белка. Нацеливаясь конкретно на бактериальную спираль 69, можно остановить синтез белка в бактериях, тем самым убивая бактерии. [ 3 ]
Helix 69 демонстрирует высокую степень консервативности как последовательности, так и вторичной структуры на протяжении всей филогении. Дополнительной консервативной особенностью H69 является существование множества сайтов псевдоуридилирования ( нумерация E. coli , позиции 1911, 1915 и 1917), которые были картированы в E. coli , человеке и некоторых других организмах. [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Цзян Дж, Харел Д.Н., Чоу К.С. (2015). «Модуляция конформационных изменений мутантов спирали 69 с помощью модификаций псевдоуридина» . Биофизическая химия . 200–201: 48–55. дои : 10.1016/j.bpc.2015.03.001 . ПМЦ 4414897 . ПМИД 25800680 .
- ^ Jump up to: а б Цзян Дж., Адури Р., Чоу К.С., СантаЛюсия Дж. (апрель 2014 г.). «Модуляция структуры спирали 69 из 23S рибосомальной РНК Escherichia coli путем псевдоуридилирования» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (6): 3971–81. дои : 10.1093/nar/gkt1329 . ПМЦ 3973299 . ПМИД 24371282 .
- ^ Балкли Д., Джонсон Ф., Стейц Т.А. (март 2012 г.). «Антибиотик терморубин ингибирует синтез белка, связываясь с межсубъединичным мостиком B2a рибосомы» . Журнал молекулярной биологии . 416 (4): 571–8. дои : 10.1016/j.jmb.2011.12.055 . ПМК 3336878 . ПМИД 22240456 .