EggNOG (база данных)
 | |
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | База данных ортологичных белков и функциональных аннотаций на нескольких таксономических уровнях. |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Европейская лаборатория молекулярной биологии |
| Авторы | Уэрта-Сепас и др. |
| Первичное цитирование | Уэрта-Сепас и др. (2015) [1] |
| Дата выпуска | 2015 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | http://eggnogdb.embl.de |
База данных eggNOG — это база данных биологической информации, размещенная на сервере EMBL . Он основан на оригинальной идее COG (кластеров ортологичных групп). [2] [3] и распространяет эту идею на неконтролируемые ортологические группы, созданные из многочисленных организмов. [4] База данных создана в 2007 году. [5] и обновлен до версии 4.5 в 2015 году. [1] означает эволюционную генеалогию генов : N под ортологических групп наблюдением eggNOG .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Уэрта-Сепас Дж., Шклярчик Д., Форслунд К., Кук Х., Хеллер Д., Уолтер М.К., Раттей Т., Менде Д.Р., Сунагава С., Кун М., Йенсен Л.Дж., фон Меринг С., Борк П. (2016). «eggNOG 4.5: структура иерархической ортологии с улучшенными функциональными аннотациями для эукариотических, прокариотических и вирусных последовательностей» . Нуклеиновые кислоты Рез . 44 (Д1): Д286–93. дои : 10.1093/nar/gkv1248 . ПМК 4702882 . ПМИД 26582926 .
- ^ Татусов Р.Л., Кунин Е.В., Липман Д.Д. (1997). «Геномный взгляд на семейства белков» . Наука . 278 (5338): 631–7. Бибкод : 1997Sci...278..631T . дои : 10.1126/science.278.5338.631 . ПМИД 9381173 .
- ^ Татусов Р.Л., Гальперин М.Ю., Натале Д.А., Кунин Е.В. (2000). «База данных COG: инструмент для анализа функций и эволюции белков в масштабе генома» . Нуклеиновые кислоты Рез . 28 (1): 33–6. дои : 10.1093/нар/28.1.33 . ПМК 102395 . ПМИД 10592175 .
- ^ Пауэлл, Шон; Шклярчик, Дамиан; Трачана, Каллиопи; Рот, Александр; Кун, Майкл; Мюллер, Жан; Арнольд, Роланд; Раттей, Томас; Летунич, Ивица; Доркс, Тобиас; Дженсен, Ларс Дж; фон Меринг, Кристиан; Борк, Пер (январь 2012 г.). «eggNOG v3.0: ортологичные группы, охватывающие 1133 организма в 41 различном таксономическом диапазоне» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (Д1): Д284–Д289. дои : 10.1093/nar/gkr1060 . ПМЦ 3245133 . ПМИД 22096231 .
- ^ Йенсен Л.Дж., Жюльен П., Кун М., фон Меринг С., Мюллер Дж., Доркс Т., Борк П. (2008). «eggNOG: автоматизированное построение и аннотация ортологичных групп генов» . Нуклеиновые кислоты Рез . 36 (Проблема с базой данных): D250–4. дои : 10.1093/нар/gkm796 . ПМК 2238944 . ПМИД 17942413 .
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта биологическим базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |