Элемент стабильности с высоким содержанием углерода
 | Эта статья может сбивать с толку или быть непонятной читателям . ( Август 2008 г. ) |
Элемент стабильности Not M, -ND, богатый C, представляет собой короткую часть последовательности гена, важную для правильного синтеза глобина и некоторых других белков человека.
Различия в стабильности отдельных мРНК могут существенно повлиять на общий уровень экспрессии генов . Эукариотические мРНК могут иметь период полураспада от нескольких минут до нескольких дней. При дифференцировке эритроидных клеток человека отложение высоких уровней белка альфа- глобина зависит от необычно длительного периода полураспада мРНК альфа-глобина (более 24 часов). Детерминант стабильности мРНК альфа-глобина был картирован в богатом пиримидином сегменте его 3'-UTR . Эта область обеспечивает стабильность, направляя сборку специфического комплекса альфа -рибонуклеопротеина в этом сайте. Впоследствии Хольчик и Либхабер идентифицировали три другие высокостабильные эукариотические мРНК, которые собирают белковый комплекс альфа-глобина в гомологичных богатых пиримидином областях в пределах своих 3'-UTR (липоксигеназа кролика, тирозингидроксилаза крысы и альфа(I)-коллаген человека).
ErEN cleavage site V -cccaacgggcccu—ccucccc—ucc/u alpha globin (HBA1 or HBA2, NM_000517.1) cccca-----cccu—cuuccccaa lipoxygenase (ALOX15, NM_001140) -ccca----gcccacuuuuccccaa alpha(I)-collagen (COL1A1, NM_000088) cucca---uccccu----ucuccaa tyroilsmochie hydroxylase (TH, NM_000360)
ycca 1–5 cccw 1–4 ucycc : consensus (Holcik and Liebhaber, 1997)
Существуют некоторые споры относительно количества и идентичности транс-действующих факторов, рекрутированных на элемент, богатый С. Однако считается, что альфа-глобин-поли(С)-связывающий белок (альфаСР) является основным компонентом так называемого альфа-комплекса. Было показано, что белок альфаСР массой 39 кДа напрямую связывается с сигналом РНК, богатой С. Существует два альфаCP: альфаCP1 и альфаCP2. Исследования показывают [ который? ] комплекс может защищать участок рядом с C-богатым элементом мРНК альфа-глобина от эритроидной эндонуклеазы (ErEN). Поскольку многие белковые компоненты, необходимые для комплекса стабильности альфа-глобина, по-видимому, широко экспрессируются у разных видов и типов клеток, этот механизм стабилизации мРНК, вероятно, является общим. Однако у мышей цис- и транс-детерминанты в некоторой степени разошлись. Требования к мышиной последовательности в равной степени богаты C и U по сравнению с человеческим элементом, преимущественно богатым C. Несмотря на этот сдвиг, мРНК альфа-глобина мыши по-прежнему остается стабильной из-за комплементарного изменения специфичности поли(С)-связывающего белка.
Ссылки
[ редактировать ]- Дж. Конг и С. А. Либхабер (2007). «Путь надзора за мРНК, ограниченный типом клеток, запускаемый расширением рибосомы в 3'-нетранслируемую область». Структурная природа и молекулярная биология . 14 (7): 670–676. дои : 10.1038/nsmb1256 . ПМИД 17572684 .