Уберон
Содержание | |
---|---|
Описание | Уберон, интегративная онтология анатомии многих видов. |
Типы данных захвачен | Анатомические структуры |
Организмы | Многоклеточные животные |
Контакт | |
Первичное цитирование | Мунгалл и др. (2012) [1] |
Дата выпуска | 2012 |
Доступ | |
Формат данных | СОВА и ОБО |
Веб-сайт | http://obophenotype.github.io/uberon/ |
URL-адрес загрузки | http://purl.obolibrary.org/obo/uberon/merged.owl |
Sparql Конечная точка | http://sparql.hegroup.org/sparql |
Разнообразный | |
Лицензия | открыть |
Онтология Убер-анатомии (Уберон) — это сравнительной анатомии, онтология представляющая различные структуры, встречающиеся у животных , такие как легкие , мышцы , кости , перья и плавники . Эти структуры связаны с другими структурами такими отношениями, как «часть» и «развивается из». [1] Одним из применений этой онтологии является интеграция данных из различных биологических баз данных и других видоспецифичных онтологий, таких как фундаментальная модель анатомии . [2] [3] [4]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Мангалл, Кристофер Дж; Торниай Карло; Гкутос Георгиос V; Льюис Сюзанна Э; Гендель Мелисса А (2012). «Уберон, интегративная онтология анатомии многих видов» . Геном Биол . 13 (1). Англия: R5. дои : 10.1186/gb-2012-13-1-r5 . ПМЦ 3334586 . ПМИД 22293552 .
- ^ Вашингтон, Нидерланды; Гендель, Массачусетс ; Мунгалл, CJ; Эшбернер, М.; Вестерфилд, М.; Льюис, SE (2009). Бьютоу, Кеннет Х (ред.). «Связывание болезней человека с моделями животных с использованием аннотации фенотипов на основе онтологий» . ПЛОС Биология . 7 (11): e1000247. дои : 10.1371/journal.pbio.1000247 . ПМК 2774506 . ПМИД 19956802 .
- ^ Хендорф, Р.; Шофилд, Пенсильвания; Гкутос, Г.В. (2011). «PhenomeNET: целостный подход к открытию генов болезней» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (18): е119. дои : 10.1093/nar/gkr538 . ПМЦ 3185433 . ПМИД 21737429 .
- ^ Чен, СК; Мунгалл, CJ; Гкутос, Г.В.; Дёлкен, Южная Каролина; Кёлер, С.; Рюф, Би Джей; Смит, К.; Вестерфилд, М.; Робинсон, Пенсильвания; Льюис, SE; Шофилд, Пенсильвания; Смедли, Д. (2012). «MouseFinder: Гены-кандидаты болезней на основе данных фенотипа мышей» . Человеческая мутация . 33 (5): 858–866. дои : 10.1002/humu.22051 . ПМЦ 3327758 . ПМИД 22331800 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]Викиданные обладают свойством:
- UBERON ID (P1554) (см. использование )