Энтатическое состояние
В бионеорганической химии энтатическое состояние — это «состояние атома или группы, геометрическое или электронное состояние которого благодаря связыванию с белком адаптировано для функционирования». [ 1 ] Этот термин был придуман Бертом Валле и Р.Дж.П. Уильямсом . [ 2 ] следующие работы по каталитической активности карбоангидразы. [ 3 ] Считается, что эти состояния усиливают химию ионов металлов в биологическом катализе. [ 4 ]
Примером энтатического состояния является медный центр в пластоцианине , окислительно-восстановительном ферменте. В этом белке медь перемещается между окисленным и восстановленным состояниями, Cu 2+ и Cu + , соответственно. Каждая степень окисления предпочитает определенную координационную геометрию : тогда как медь (II) обычно имеет плоскую квадратную форму и предпочитает твердые основания, такие как кислород и азотные лиганды, медь (I) обычно является тетраэдрической и предпочтительно связывается с мягкими основаниями, такими как серные лиганды. Поскольку скорость переноса электронов зависит от энергии реорганизации , идеальная скорость будет получена для центров Cu, имеющих промежуточную геометрию между требованиями каждой степени окисления. Фактически, сайт Cu не является ни плоским, ни тетраэдрическим, он считается искаженным тетраэдром с двумя азотистыми лигандами из остатков гистидина и двумя серными лигандами из остатков метионина и цистеина, и поэтому его можно считать энтатическим состоянием. Согласно гипотезе энтатического состояния, искажение возникает в результате деформации, вызванной связыванием с лигандами с относительной ориентацией, заранее заданной белком.
Некоторые теоретические расчеты показывают, что модельная система может иметь геометрию, аналогичную той, которая наблюдается в белке без какой-либо деформации; эти результаты, однако, остаются спорными. [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ ИЮПАК , Сборник химической терминологии , 2-е изд. («Золотая книга») (1997). Онлайн исправленная версия: (1997) " Энтатическое состояние ". дои : 10.1351/goldbook.ET06763
- ^ Валле, БЛ; Уильямс, RJP (1968). «Металлоферменты: энтатическая природа их активных центров» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 59 (2): 498–505. дои : 10.1073/pnas.59.2.498 . ПМК 224700 .
- ^ Линдског, Свен; Мальмстрем, Бо Г. (1962). «Металлосвязывание и каталитическая активность бычьей карбоангидразы». Ж. Биол. Хим . 237 (4): 1129–1137.
- ^ Перри А. Фрей; Адриан Д. Хегеман. Механизмы ферментативных реакций . Издательство Оксфордского университета. п. 210. ИСБН 0-19-512258-5 .
- ^ Николас Кальцояннис; Джон Э. МакГрэйди; Йохен Аутшбах (2004). Принципы и приложения теории функционала плотности в неорганической химии . Спрингер. стр. 47–49 . ISBN 3-540-21861-0 .