ЛигД
| Многофункциональный негомологичный белок LigD, соединяющий концы | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Организм | |||
| Символ | ligD | ||
| ЮниПрот | А0R3R7 | ||
| |||
LigD представляет собой многофункциональную лигазу / полимеразу / нуклеазу ( 3'-фосфоэстераза ), обнаруженную в бактериальных с негомологичным соединением концов (NHEJ) системах репарации ДНК . [ 1 ] Она гораздо более подвержена ошибкам, чем более сложная эукариотическая система NHEJ, которая для выполнения своей роли использует множество ферментов. [ 2 ] Полимераза предпочтительно использует rNTP (нуклеотиды РНК), что, возможно, выгодно в спящих клетках. [ 3 ]
Фактическая архитектура LigD варьируется.
- Гомолог LigD в Bacillus subtilis не имеет нуклеазного домена.
- LigD с искусственно удаленным лигазным доменом может выполнять свою функцию (с потерей точности) с отдельным LigC, действующим в качестве лигазы. [ 2 ]
- Гомолог LigD у археи Methanocella paludicola разбит на три однодоменных белка, имеющих общий оперон. [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Делла М., Палмбос П.Л., Ценг Х.М. и др. (октябрь 2004 г.). «Микобактериальные белки Ku и лигазы представляют собой двухкомпонентную машину восстановления NHEJ». Наука . 306 (5696): 683–5. Бибкод : 2004Sci...306..683D . дои : 10.1126/science.1099824 . ПМИД 15499016 . S2CID 38823696 .
- ^ Jump up to: а б Гонг С., Бонджорно П., Мартинс А. и др. (апрель 2005 г.). «Механизм негомологичного соединения концов у микобактерий: система восстановления с низкой точностью, управляемая Ku, лигазой D и лигазой C». Нат. Структура. Мол. Биол . 12 (4): 304–12. дои : 10.1038/nsmb915 . ПМИД 15778718 . S2CID 6879518 .
- ^ Питчер Р.С., Грин А.Дж., Бжостек А., Корицка-Мачала М., Дзядек Дж., Доэрти А.Дж. (сентябрь 2007 г.). «NHEJ защищает микобактерии в стационарной фазе от вредного воздействия высыхания» (PDF) . Восстановление ДНК (Амст.) . 6 (9): 1271–6. дои : 10.1016/j.dnarep.2007.02.009 . ПМИД 17360246 .
- ^ Бартлетт, Э.Дж.; Бриссетт, Северная Каролина; Доэрти, Эй Джей (28 мая 2013 г.). «Рибонуклеолитическая резекция необходима для восстановления смещенных негомологичных промежуточных соединений концов цепи» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (22): E1984-91. Бибкод : 2013PNAS..110E1984B . дои : 10.1073/pnas.1302616110 . ПМК 3670387 . ПМИД 23671117 .