БЛУПФ90

Семейство программ BLUPF90 представляет собой пакет статистического программного обеспечения, используемый в количественной генетике для животных и селекции растений . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Он может соответствовать смешанным моделям, используя ограниченное максимальное правдоподобие , а также выборку Гиббса для оценки компонентов дисперсии и прогнозировать племенную ценность с помощью наилучшего линейного несмещенного прогнозирования (BLUP).

Закодированный на Фортране , он может выполнять геномную селекцию сотен тысяч генотипированных людей. ^{[ 3 ]}

Скомпилированные версии BLUPF90 бесплатно доступны для исследования и могут использоваться в Linux, Microsoft Windows и Mac OS X. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Также существует надстройка к R (языку программирования) . ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Мишталь, Игнаций (1999). «Сложные модели, больше данных: более простое программирование?». Бюллетень Интербулла . 20 : 33–42.
^ Мишталь, Я; Цурута, С; Штрабель, Т; Овре, Б; Дрюэ, Т; Ли, Д.Х. (2002). BLUPF90 и связанные с ним программы (BGF90) . 7-й Всемирный конгресс по генетике, применяемой в животноводстве. Монпелье, Франция.
^ Агилар, я; Мишталь, Я; Цурута, С; Легарра, А; Ван, Х (2014). PREGSF90 – POSTGSF90: Вычислительные инструменты для реализации одноэтапной геномной селекции и полногеномной ассоциации с негенотипированными особями в программах BLUPF90 (PDF) . 10-й Всемирный конгресс по генетике, применяемой в животноводстве. Американское общество зоотехники, Шампейн, Иллинойс.
^ http://nce.ads.uga.edu/software/
^ http://nce.ads.uga.edu/wiki/doku.php?id=start
^ https://famuvie.github.io/breedR/

Внешние ссылки

Домашняя страница BLUPF90

Эта научная статья о программном обеспечении незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Мишталь, Игнаций (1999). «Сложные модели, больше данных: более простое программирование?». Бюллетень Интербулла . 20 : 33–42.

[2] Мишталь, Я; Цурута, С; Штрабель, Т; Овре, Б; Дрюэ, Т; Ли, Д.Х. (2002). BLUPF90 и связанные с ним программы (BGF90) . 7-й Всемирный конгресс по генетике, применяемой в животноводстве. Монпелье, Франция.

[3] Агилар, я; Мишталь, Я; Цурута, С; Легарра, А; Ван, Х (2014). PREGSF90 – POSTGSF90: Вычислительные инструменты для реализации одноэтапной геномной селекции и полногеномной ассоциации с негенотипированными особями в программах BLUPF90 (PDF) . 10-й Всемирный конгресс по генетике, применяемой в животноводстве. Американское общество зоотехники, Шампейн, Иллинойс.

[4] ttp://nce.ads.uga.edu/software/

[5] ttp://nce.ads.uga.edu/wiki/doku.php?id=start

[6] ttps://famuvie.github.io/breedR/

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]