Шоба Ранганатан

Шоба Ранганатан
Шоба Ранганатан
Альма-матер	Мадрасский университет ; Индийский технологический институт Мадраса ; Индийский технологический институт Дели
	Научная карьера
Учреждения	Институт физико-химической биологии ; Университет Нового Орлеана ; Колледж Майтрейи ; Университет Джавахарлала Неру ; Сиднейский университет ; Австралийский национальный университет ; Национальный университет Сингапура ; Университет Маккуори
Диссертация	Квантово-химические исследования квадратичных потенциальных функций с использованием метода CNDO/Force и формализма констант соответствия (1983)

Шоба Ранганатан — индийско-австралийский биохимик, профессор биоинформатики в Университете Маккуори . Ее исследования охватывают вычислительную биологию и биоинформатику, аннотацию генома и структурную биоинформатику.

Ранняя жизнь и образование

Шоба родился и вырос в Индии. ^{[ 1 ]} Она изучала химию в Мадрасском университете . ^{[ 1 ]} и в Индийском технологическом институте Мадраса , а затем перешла в Индийский технологический институт Дели для получения докторской степени, где она начала работать в области вычислительной химии. ^{[ 1 ]} Ее аспирантура была посвящена выявлению новых констант атомного скрининга, а докторская – разработке квадратичных потенциальных функций с использованием CNDO/ Force. Затем она перешла в Физико-химический институт биологии. ^{[ 2 ]} за ним последовал Университет Нового Орлеана для постдокторских исследований.

Исследования и карьера

Шоба начала свою академическую карьеру в колледже Майтрейи Делийского университета, где в 1988 году она была назначена заведующей кафедрой химии. Затем она начала свою карьеру в области биоинформатики в Центре биоинформатики Университета Джавахарлала Неру в качестве ученого-информатика. Переехав в Австралию в 1993 году, она работала научным сотрудником в Сиднейском университете , Австралийском национальном университете и в Австралийской национальной службе геномной информации. В 2000 году она переехала в Сингапур, поступив в Национальный университет Сингапура . ^{[ 1 ]} В 2004 году Ранганатан вернулся в Австралию в качестве первого заведующего кафедрой биоинформатики в Университете Маккуори . ^{[ 3 ]}

Исследования Ранганатана охватывают аннотацию генома. транскриптомный и протеомный анализ, структурная биоинформатика, иммуноинформатика и хемоинформатика. Она разработала теоретические методы анализа сращивания и сетевые подходы для крупномасштабного анализа данных. В 2003 году она была избрана первым австралийским директором Международного общества вычислительной биологии . В 2008 году она была назначена директором узла Маккуори Австралийского исследовательского совета . Центра передового опыта в области биоинформатики ^{[ 1 ]}

В 2019 году Ранганатан был главным редактором Elsevier журнала Энциклопедии биоинформатики и вычислительной биологии : ABC of Bioinformatics . ^{[ 4 ]}

Шоба получил Индийскую национальную стипендию для научных талантов (1973–1982), стипендию правительства Франции (1983–1984) и кафедру информатики биоразнообразия ЮНЕСКО (2004–06). Она была избрана научным сотрудником Международного центра теоретической физики Абдуса Салама (1989–1991). В 2018 году она была удостоена награды почетного старшего научного сотрудника Австралийского общества биоинформатики и вычислительной биологии и награды Международного общества вычислительной биологии 2023 года за выдающийся вклад. ^{[ 1 ]}

Избранные публикации

Шивашанкар Х. Нагарадж; Робин Б. Гассер; Шоба Ранганатан (23 мая 2006 г.). «Руководство для автостопщика по анализу меток выраженной последовательности (EST)». Брифинги по биоинформатике . 8 (1): 6–21. дои : 10.1093/BIB/BBL015 . ISSN 1467-5463 . ПМИД 16772268 . Викиданные Q34537805 .
С.Г. Дав; О. Хоэ-Гульдберг ; С. Ранганатан (январь 2001 г.). «Основные цветовые узоры кораллов, строящих рифы, обусловлены семейством GFP-подобных белков». Коралловые рифы . 19 (3): 197–204. дои : 10.1007/PL00006956 . ISSN 0722-4028 . Викиданные Q57441178 .
Марк В. Робинсон; Ранджита Менон; Шейла М. Доннелли; Джон П. Далтон; Шоба Ранганатан (14 мая 2009 г.). «Комплексный транскриптомный и протеомный анализ секретома возбудителя гельминта Fasciola hepatica: белки, связанные с инвазией и инфицированием хозяина-млекопитающего» . Молекулярная и клеточная протеомика . 8 (8): 1891–1907. дои : 10.1074/MCP.M900045-MCP200 . ISSN 1535-9476 . ПМЦ 2722771 . ПМИД 19443417 . Викиданные Q37294418 .

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Фогг, Кристиана Н. (2023). «Выдающийся вклад в премию ISCB 2023 года: Шоба Ранганатан» . Биоинформатика . 39 (Дополнение_1): i3–i4. doi : 10.1093/биоинформатика/btad306 . ПМЦ 10311293 . ПМИД 37387187 . Проверено 10 августа 2023 г.
^ Администрация. «Профессор Шоба Ранганатан» . Университет Маккуори . Проверено 10 августа 2023 г.
^ «PeerJ – Профиль – Шоба Ранганатан» . http://peerj.com . Проверено 10 августа 2023 г.
^ Ранганатан, Шоба; Грибсков, Михаил; Накаи, Кента; Шенбах, Кристиан, ред. (2019). Энциклопедия биоинформатики и вычислительной биологии . Амстердам Бостон Гейдельберг Лондон Нью-Йорк Оксфорд Париж Сан-Диего Сан-Франциско Сингапур Сидней Токио: Elsevier. ISBN 978-0-12-811414-8 .

[:0-1] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Фогг, Кристиана Н. (2023). «Выдающийся вклад в премию ISCB 2023 года: Шоба Ранганатан» . Биоинформатика . 39 (Дополнение_1): i3–i4. doi : 10.1093/биоинформатика/btad306 . ПМЦ 10311293 . ПМИД 37387187 . Проверено 10 августа 2023 г.

[2] Администрация. «Профессор Шоба Ранганатан» . Университет Маккуори . Проверено 10 августа 2023 г.

[3] «PeerJ – Профиль – Шоба Ранганатан» . http://peerj.com . Проверено 10 августа 2023 г.

[4] Ранганатан, Шоба; Грибсков, Михаил; Накаи, Кента; Шенбах, Кристиан, ред. (2019). Энциклопедия биоинформатики и вычислительной биологии . Амстердам Бостон Гейдельберг Лондон Нью-Йорк Оксфорд Париж Сан-Диего Сан-Франциско Сингапур Сидней Токио: Elsevier. ISBN 978-0-12-811414-8 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

Базы данных авторитетного контроля
International	ISNI VIAF WorldCat
National	France BnF data Germany Israel United States Netherlands
Academics	CiNii DBLP Google Scholar ORCID Scopus
People	Trove
Other	IdRef