PTS Glucose-Glucoside (GLC) Семейство

Семейство семейства глюкозы глюкозозида (GLC) ( TC# 4.A.1 ) включает в себя носильщиков, специфичных для глюкозы, глюкозамина, N-ацетилглюкозамина и большого разнообразия α- и β-глюкозидов и является частью суперсемейства PTS-GFL SuperFamily Полем

Гомология

Не все носильщики β-глюкозидов находятся в этом классе, так как портер PTS впервые описывается как целлобиозное β-глюкозид носильщика является портером диацетилхитобиозы в семействе LAC . Домены IIA, IIB и IIC всех групповых транслокаторов, перечисленных ниже, явно гомологичны. Эти носильщики (домены IIC) демонстрируют ограниченное сходство последовательности с и гомологичны членам семейства FRU , а меньше с членами семьи LAC. Домены IIC подсемейств глюкозы и глюкозидов столь же далеки друг от друга, как и от семейств FRU, MTL и LAC. Как и для других членов суперсемейства PTS-GFL, домены IIC этих пермистических веществ, вероятно, имеют однородную топологию 10 TMS. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Структура и функция

Трехмерные структуры доменов IIA и IIB of Escherichia coli Glucose Porter были выяснены. Iia ^GLC имеет сложную структуру β-сандвича, пока IIB ^GLC является разделенным αβ-сандвичем с топологией, не связанной с разделенной αβ-сандвичской структурой HPR. Некоторые бактерии имеют много транспортных систем PTS, принадлежащих к разным семьям. Например, растворительный Clostridium acetobutylicum atcc 824 имеет 13 в целом с 6 в семье GLC, 2 в семье FRU, 2 в семье LAC, 1 в семье GAT и 2 в семье человека.

Некоторые из носильщиков PTS в семействе GLC не имеют собственных доменов IIA и вместо этого используют белок глюкозы IIA (IIA ^GLC или CRR). Большинство из этих носильщиков имеют домены B и C, связанные вместе в одной полипептидной цепи. Остаток кистила в домене IIB фосфорилируется прямым переносом фосфорила из IIA ^GLC(его ~ p) или один из его гомологов. Эти носильщики, которым не хватает домена IIA, включают в себя мальтозу, арбутин-салицин-клетобиозы, трегалозу, предполагаемый глюкозид и носильщики сахарозы E. coli. Большинству, но не всем носильщикам других бактерий также не хватает домена IIA.

BGLF состоит из трансмембранного домена, который в дополнение к TMSS содержит большую цитоплазматическую петлю. Согласно Yagur-Kroll et al. Этот цикл, соединяющий TMS 1 с TMS 2, содержит области, которые чередуются между лицами и лицом к лицу и создают канал транслокации сахара. ^{[ 3 ]} Yagur-Kroll et al. Продемонстрируйте пространственную близость между позициями в центре большой петли и местом фосфорилирования, что позволяет предположить, что эти две области объединяются для выполнения фосфотрансфера сахара. ^{[ 3 ]}

Ссылки

^ Нгуен, тайский х.; Йен, Мин-Рен; Баработ, Рави Д.; Saier, Milton H. (2006-01-01). «Топологические прогнозы для интегральных мембранных пермеазах фосфоенолпирувата: система сахара фосфотрансферазы». Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 11 (6): 345–360. doi : 10.1159/000095636 . ISSN 1464-1801 . PMID 17114898 . S2CID 25965070 .
^ Маккой, Джейсон Дж.; Рен, Женнинг; Stanevich, Vitali; Ли, Джумин; Митра, Шармишта; Левин, Елена Дж.; Погет, Себастьен; Быстрый, Матиас; Im, Wonpil (2016-06-07). «Структура переносчика сахара суперсемейства глюкозы дает представление о механизме лифта переноса мембраны» . Структура 24 (6): 956–964. doi : 10.1016/j.str.2016.04.003 . ISSN 1878-4186 . PMC 4899283 . PMID 27161976 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Ягур-Кролл, Шарон; Ido, Ayelet; Amster-Choder, Orna (2009-05-01). «Пространственное расположение бета-глюкозидного транспортера из Escherichia coli» . Журнал бактериологии . 191 (9): 3086–3094. doi : 10.1128/jb.01037-08 . ISSN 1098-5530 . PMC 2681802 . PMID 19251853 .

Внешние ссылки

Семейство глюкозе-глюкозидов PTS (GLC) (база данных классификации Transporter, Lab Group, UCSD)

На момент редактирования в этой статье используется контент из «4.a.1 Семейство PTS глюкозо-глюкозид (GLC)» , которое лицензировано таким образом, что позволяет повторно использовать в соответствии с лицензией Creative Commons Attribution-Sharealik 3.0 , но не под GFDL . Все соответствующие условия должны соблюдаться.

[1] Нгуен, тайский х.; Йен, Мин-Рен; Баработ, Рави Д.; Saier, Milton H. (2006-01-01). «Топологические прогнозы для интегральных мембранных пермеазах фосфоенолпирувата: система сахара фосфотрансферазы». Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 11 (6): 345–360. doi : 10.1159/000095636 . ISSN 1464-1801 . PMID 17114898 . S2CID 25965070 .

[2] Маккой, Джейсон Дж.; Рен, Женнинг; Stanevich, Vitali; Ли, Джумин; Митра, Шармишта; Левин, Елена Дж.; Погет, Себастьен; Быстрый, Матиас; Im, Wonpil (2016-06-07). «Структура переносчика сахара суперсемейства глюкозы дает представление о механизме лифта переноса мембраны» . Структура 24 (6): 956–964. doi : 10.1016/j.str.2016.04.003 . ISSN 1878-4186 . PMC 4899283 . PMID 27161976 .

[:0-3] Jump up to: ^а ^{беременный} Ягур-Кролл, Шарон; Ido, Ayelet; Amster-Choder, Orna (2009-05-01). «Пространственное расположение бета-глюкозидного транспортера из Escherichia coli» . Журнал бактериологии . 191 (9): 3086–3094. doi : 10.1128/jb.01037-08 . ISSN 1098-5530 . PMC 2681802 . PMID 19251853 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]