Jump to content

Обобщенное выравнивание дерева

В вычислительной обобщенное филогенетике выравнивание деревьев — это проблема создания множественного выравнивания последовательностей и филогенетического дерева для набора последовательностей одновременно, а не по отдельности. [1]

Формально обобщенное выравнивание деревьев представляет собой следующую задачу оптимизации.

Ввод : набор и функция редактирования расстояния между последовательностями,

Результат : Дерево. лист с меткой и помечены последовательностями во внутренних узлах, так что минимизируется, где расстояние редактирования между конечными точками . [2]

Обратите внимание, что это отличается от выравнивания дерева , где дерево предоставляется в качестве входных данных.

  1. ^ Швиковский, Бенно; Вингрон, Мартин (1997). «Эвристика отложенного пути для обобщенной задачи выравнивания дерева». Журнал вычислительной биологии . 4 (3): 415–431. дои : 10.1089/cmb.1997.4.415 . ISSN   1066-5277 . ПМИД   9278068 .
  2. ^ Шринивас Алуру (21 декабря 2005 г.). Справочник по вычислительной молекулярной биологии . ЦРК Пресс. стр. 19–26. ISBN  978-1-4200-3627-5 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: c9af4eecfb54ed5defb569c798656bbe__1576020900
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/c9/be/c9af4eecfb54ed5defb569c798656bbe.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Generalized tree alignment - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)