Глипиация
Глипирование представляет собой добавление путем ковалентного связывания гликозилфосфатидилинозитолового ( GPI) якоря и является распространенной посттрансляционной модификацией , которая локализует белки на клеточных мембранах. Этот особый вид гликозилирования широко обнаружен на поверхностных гликопротеинах эукариот и некоторых архей . [ 1 ]
Якоря GPI состоят из линкера фосфоэтаноламина, который связывается с С-концом белков-мишеней. Основная структура гликана имеет фосфолипидный хвост, который прикрепляет структуру к мембране.
Как липидная часть хвоста, так и остатки сахаров в гликановом ядре имеют значительные различия. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] демонстрируя огромное функциональное разнообразие, которое включает в себя передачу сигналов, клеточную адгезию и иммунное распознавание. [ 8 ] Якоря GPI также могут расщепляться такими ферментами, как фосфолипаза C, чтобы регулировать локализацию белков, закрепленных на плазматической мембране.
Механизм
[ редактировать ]Подобно гликану-предшественнику, используемому для N-гликозилирования , биосинтез якоря GPI начинается на цитоплазматическом листке ЭР и завершается на люминальной стороне. Во время этого процесса 3-4 Man и различные другие сахара (например, GlcNAc, Gal) встраиваются в молекулу фосфатидилинозитола (PI), встроенную в мембрану, с использованием сахаров, полученных из сахарных нуклеотидов и долихол-P-маннозы снаружи и внутри ЭР. соответственно. Кроме того, 2-3 линкерных остатка фосфоэтаноламина (EtN-P) передаются из фосфатидилэтаноламина в просвет ЭР, чтобы облегчить связывание якоря с белками. [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]
Белки, предназначенные для глипиирования, имеют две сигнальные последовательности:
- N -концевая сигнальная последовательность, которая управляет котрансляционным транспортом в ЭР.
- С -концевая сигнальная последовательность, распознаваемая трансамидазой GPI (GPIT). [8]
GPIT не имеет консенсусной последовательности, но вместо этого распознает мотив C-концевой последовательности, который позволяет ему ковалентно прикреплять якорь GPI к аминокислоте в последовательности. Эта С-концевая последовательность встраивается в мембрану ЭР сразу после трансляции, а затем белок отщепляется от последовательности и прикрепляется к предварительно сформированному якорю GPI. [ 14 ] [ 15 ]
Прогнозирование сайтов глипиирования в белках
[ редактировать ]In silico предсказание сайтов глипиирования может быть выполнено с помощью:
- GPI-SOM: идентификация сигналов GPI-якоря с помощью самоорганизующейся карты Кохонена
- PredGPI: предиктор привязки GPI. Архивировано 13 августа 2014 г. на Wayback Machine.
- big-PI Predictor - Прогноз сайта модификации GPI. Архивировано 21 июля 2020 г. на Wayback Machine.
- FragAnchor: Тандемная система прогнозирования белков, привязанная к GPI (NN + HMM)
- МемТип-2Л
- NetGPI
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Кобаяши Т. и др. (1997)Присутствие GPI-связанного белка(ов) у археобактерии Sulfolobus acidocaldarius, тесно связанной с эукариотами. Биохим Биофиз Акта. 1334, 1-4.
- ^ Носжан О. и др. (1997)Белки GPI млекопитающих: сортировка, размещение в мембранах и функции. Биохим Биофиз Акта. 1331, 153–86.
- ^ Томас JR и др. (1990)Структура, биосинтез и функции гликозилфосфатидилинозитолов . Биохимия. 29, 5413-22.
- ^ Икезава Х. (2002) Белки, заякоренные в гликозилфосфатидилинозитоле (GPI). Биол Фарм Булл. 25, 409-17.
- ^ Брюис И.А. и др. (1995)Структуры гликозил-фосфатидилинозитоловых якорей дипептидазы почечной мембраны свиньи и человека. Комплексные структурные исследования свиного якоря и межвидовое сравнение структур гликанового ядра. J Биол Хим. 270, 22946-56.
- ^ Low MG (1989) Гликозил-фосфатидилинозитол: универсальный якорь для белков клеточной поверхности . ФАСЭБ Дж. 3, 1600-8.
- ^ Low MG и Saltiel AR (1988) Структурные и функциональные роли гликозил-фосфатидилинозитола в мембранах. Наука. 239, 268-75.
- ^ Вайнаускас С. и Менон А.К. (2006) Этаноламинфосфат, связанный с первым маннозным остатком липидов гликозилфосфатидилинозитола (GPI), является основной особенностью структуры GPI, которая распознается трансамидазой GPI человека. J Биол Хим. 281, 38358-64.
- ^ Менон АК и др. (1993)Фосфатидилэтаноламин является донором концевой фосфоэтаноламиновой группы в трипаносомных гликозилфосфатидилинозитолах. ЭМБО Дж. 12, 1907–14.
- ^ Менон АК и др. (1990)Биосинтез гликозил-фосфатидилинозитоловых липидов у Trypanosoma brucei: участие маннозил-фосфорилдолихола в качестве донора маннозы. ЭМБО Дж. 9, 4249-58.
- ^ Менон А.К. и Стивенс В.Л. (1992)Фосфатидилэтаноламин является донором остатка этаноламина, связывающего гликозилфосфатидилинозитоловый якорь с белком. J Биол Хим. 267, 15277-80.
- ^ Орлеан П. (1990)Долихолфосфатманнозосинтаза необходима in vivo для гликозил-фосфатидилинозитолового закрепления мембраны, O-маннозилирования и N-гликозилирования белка в saccharomyces cerevisiae. Мол Клеточная Биол. 10, 5796-805.
- ^ Имхоф И. и др. (2000)Фосфатидилэтаноламин является донором фосфорилэтаноламина, связанного с альфа1,4-связанной маннозой структур GPI дрожжей. Гликобиология. 10, 1271-5.
- ^ Киносита Т. и др. (1995)Нарушение синтеза гликозил-фосфатидилинозитолового якоря и пароксизмальная ночная гемоглобинурия. Адв Иммунол. 60, 57-103.
- ^ Уденфренд С. и Кодукула К. (1995) Как образуются мембранные белки, закрепленные гликозилфосфатидилинозитолом. Анну Рев Биохим. 64, 563-91.