Александр Хоффманн (биолог)

Александр Хоффманн
Александр Хоффманн
Альма-матер	Кембриджский университет , бакалавр ; Университет Рокфеллера , доктор философии ;
Известный	Системная биология
	Научная карьера
Учреждения	Калифорнийский университет, Сан-Диего ; Калифорнийский университет, Лос-Анджелес ;
Докторантура	Роберт Дж. Редер
Другие научные консультанты	Дэвид Балтимор

Александр Хоффманн — немецко - американский биолог. Он является директором Института количественных и вычислительных биологических наук (QCBio) и профессором микробиологии Томаса М. Ашера на кафедре микробиологии, иммунологии и молекулярной генетики (MIMG) Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе (UCLA). Его исследовательский интерес заключается в развитии прогнозного понимания того, как клеточные и молекулярные сети регулируют иммунные реакции. ^{[ 1 ]}

Образование

Хоффманн получил степень бакалавра физики и зоологии в Кембриджском университете в 1988 году, занимаясь исследовательскими проектами под руководством Джона Гердона и Джона Ласки . ^{[ нужна ссылка ]} Он получил докторскую степень. Степень бакалавра биохимии и молекулярной биологии Университета Рокфеллера в 1994 году под руководством Роберта Г. Рёдера . ^{[ 1 ]} Работая с Редером, Хоффманн идентифицировал гены, кодирующие центральный фактор транскрипции TFIID, включая его ДНК-связывающую субъединицу, связывающую субъединицу TATA-бокса. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он также разработал популярную сейчас систему экспрессии His-tag. ^{[ 7 ]} что облегчает очистку рекомбинантных белков. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Карьера

проводил постдокторские исследования Начиная с 1998 года Хоффманн вместе с Дэвидом Балтимором в Массачусетском технологическом институте , сосредоточив внимание на контроле транскрипции ВИЧ. ^{[ 1 ]} а затем в 1998 году переехал из Балтимора в Калифорнийский технологический институт. В Калифорнийском технологическом институте он сосредоточился на транскрипции. ^{[ 10 ]} и сигнальные функции фактора транскрипции иммунного ответа NF-kB , обнаруживая его колебательный контроль. ^{[ 11 ]} Сотрудничая с Андре Левченко, Хоффманн разработал математическую модель, объясняющую молекулярную основу сложного динамического контроля NF-kB. ^{[ 12 ]} Статья, описывающая эту модель, считается основополагающей для области клеточной передачи сигналов.

Хоффманн основал Лабораторию сигнальных систем в Калифорнийском университете в 2003 году. Отличительной чертой его исследований является исследовательский подход в области системной биологии, заключающийся в итеративном математическом моделировании и экспериментальном анализе, а также то, как кинетический и динамический контроль молекулярных процессов придает специфичность клеточным ответам. ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]} В 2009 году он вместе с Джеффом Хэсти и Львом Цимрингом стал соучредителем Института биосхем UCSD. ^{[ 15 ]}

В 2010 году он основал Центр системной биологии в Сан-Диего, получив грант «Центра передового опыта» от Национальных институтов здравоохранения . ^{[ 16 ]} В 2013 году он занял должность в Калифорнийском университете в Лос-Анджелесе , а в 2014 году основал Институт количественных и вычислительных биологических наук (QCBio). ^{[ 17 ]} Он является докладчиком группы биомедицинской математики IBS. ^{[ 18 ]}

Другие роли

Хоффманн работал вместе с Павлом Певзнером в качестве содиректора аспирантуры Калифорнийского университета в области биоинформатики с 2009 по 2013 год, наблюдая за резким расширением и включением системной биологии , биомедицинской информатики и количественной биологии . ^{[ 19 ]}

Хоффманн работал над улучшением равенства в возможностях образования. Он руководил образовательными программами в Калифорнийском технологическом институте (Молодые ученые в области инженерных наук, ^{[ 20 ]} Летний институт первокурсников ^{[ 21 ]}), и работал в UCSD в комитете по равенству, разнообразию и инклюзивности, а также в качестве председателя Совета канцлера по разнообразию, уделяя особое внимание практикам набора и удержания студентов и преподавателей, а также институциональным изменениям.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с «Александр Гофман» . Лаборатория сигнальных систем Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе . Проверено 4 ноября 2022 г.
^ Хоффманн А., Хорикоши М., Ван К.К., Шредер С., Вейл П.А., Рёдер Р.Г. 1990. Клонирование гена TFIID Schizosaccharomyces pombe обнаруживает сильную консервативность функциональных доменов, присутствующих в TFIID Saccharomyces cerevisiae. Гены и развитие 4, стр. 1141–1148.
^ Хоффманн А., Синн Э., Ямамото Т., Ван Дж., Рой А., Хорикоши М., Редер Р.Г. 1990. Высококонсервативный основной домен и уникальный N-конец с предполагаемыми регуляторными мотивами в человеческий фактор ТАТА (TFIID). Природа 346, №6282, стр.387-390.
^ Гаш, А., Хоффманн, А., Хорикоши, М., Рёдер, Р.Г., Чуа, Нью-Хэмпшир, 1990. Arabidopsis thaliana содержит два гена TFIID. Природа 346, №6282, стр.390-394.
^ Хоффманн, А., Чанг, К.-М., Эльгешлегер, Т., Берли, С.К., Накатани, Ю., Редер, Р.Г. 1996 Структура, подобная октамеру гистонов, в TFIID. Природа 380, №6572, стр. 356-359.
^ Хоффманн, А., Олгешлегер, Т., Рёдер, Р.Г. 1997. Рассмотрение механизмов транскрипционного контроля: повторяют ли комплексы TFIID-ядерный промотор промоторные функции, подобные нуклеосомам? Учеб. Натл. акад. наук. США 94, стр. 8928-8935.
^ Хоффманн А. и Рёдер Р.Г. 1991. Очистка меченных гистобелком белков в неденатурирующих условиях предлагает удобный метод исследования взаимодействия белков. Исследования нуклеиновых кислот 19, № 22, стр. 6337-6338.
^ Николов, Д.Б., Ху, С.-Х., Лин, Дж., Гаш, А., Хоффманн, А., Хорикоши, М., Чуа, Н.-Х., Редер, Р.Г., Берли, С.К. 1992. Кристаллическая структура белка, связывающего ТАТА-бокс TFIID. Природа 360, стр. 40–46.
^ Се, X.-L., Кокубо, Т., Коэн, С., Мирза, У.А., Хоффманн, А., Чейт, Б.Т., Редер, Р.Г., Накатани, Ю., Берли, С.К. 1996. Структурное сходство между TAF и гетеротетрамерное ядро октамера гистонов. Природа 380, № 6572, стр. 316-322.
^ Хоффманн, А., Люнг, Т.Х., Балтимор, Д. 2003. Генетический анализ факторов транскрипции NF-kB/Rel выявляет молекулярные специфичности. ЭМБО Дж., 22, стр. 5530-9.
^ Хоффманн, А., Балтимор, Д. 2006. Схема передачи сигналов NF-kB. Иммунологические обзоры, 210, стр. 171-186. ПМИД 16623771
^ Хоффманн А., Левченко А., Скотт М., Балтимор Д. 2002. Сигнальный модуль NF-B/IB: временной контроль и селективная активация генов. Наука, 298, стр. 1241–1245.
^ Бехар, М., Хоффманн, А. Временные коды внутриклеточных сигналов, 2010 г. Текущее мнение в области генетики и развития, 20, стр. 684–693. ПМИД 20956081 , ПМК 2982931
^ Басак, С., Бехар, М., Хоффманн, А. 2012. Уроки математического моделирования пути NFκB. Иммунологические обзоры, 246, стр. 221-38. ПМИД 22435558 , ПМК 3343698
^ «Создание Института биосхем (BCI) как организованного исследовательского подразделения в Калифорнийском университете в Сан-Диего» . adminrecords.ucsd.edu . Проверено 1 декабря 2023 г.
^ «Центр системной биологии Сан-Диего» . Проверено 1 декабря 2023 г.
^ «Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе создает новый институт количественных и вычислительных биологических наук» . Геномная сеть . Проверено 1 декабря 2023 г.
^ «Александр Гофман» . Группа биомедицинской математики . Проверено 27 июля 2024 г.
^ Хоффманн, Александр; Певзнер, Павел; Субраманиам, Шанкар. «Программа последипломной подготовки по биоинформатике» . Проверено 1 декабря 2023 г.
^ «Молодые ученые в области техники и науки» . Архивировано из оригинала 9 февраля 2015 г. Проверено 10 октября 2018 г.
^ «Программы - Центр разнообразия Калифорнийского технологического института» . Архивировано из оригинала 29 ноября 2014 г. Проверено 4 октября 2014 г.

[Bio-1] Jump up to: ^а ^б ^с «Александр Гофман» . Лаборатория сигнальных систем Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе . Проверено 4 ноября 2022 г.

[2] Хоффманн А., Хорикоши М., Ван К.К., Шредер С., Вейл П.А., Рёдер Р.Г. 1990. Клонирование гена TFIID Schizosaccharomyces pombe обнаруживает сильную консервативность функциональных доменов, присутствующих в TFIID Saccharomyces cerevisiae. Гены и развитие 4, стр. 1141–1148.

[3] Хоффманн А., Синн Э., Ямамото Т., Ван Дж., Рой А., Хорикоши М., Редер Р.Г. 1990. Высококонсервативный основной домен и уникальный N-конец с предполагаемыми регуляторными мотивами в человеческий фактор ТАТА (TFIID). Природа 346, №6282, стр.387-390.

[4] Гаш, А., Хоффманн, А., Хорикоши, М., Рёдер, Р.Г., Чуа, Нью-Хэмпшир, 1990. Arabidopsis thaliana содержит два гена TFIID. Природа 346, №6282, стр.390-394.

[5] Хоффманн, А., Чанг, К.-М., Эльгешлегер, Т., Берли, С.К., Накатани, Ю., Редер, Р.Г. 1996 Структура, подобная октамеру гистонов, в TFIID. Природа 380, №6572, стр. 356-359.

[6] Хоффманн, А., Олгешлегер, Т., Рёдер, Р.Г. 1997. Рассмотрение механизмов транскрипционного контроля: повторяют ли комплексы TFIID-ядерный промотор промоторные функции, подобные нуклеосомам? Учеб. Натл. акад. наук. США 94, стр. 8928-8935.

[7] Хоффманн А. и Рёдер Р.Г. 1991. Очистка меченных гистобелком белков в неденатурирующих условиях предлагает удобный метод исследования взаимодействия белков. Исследования нуклеиновых кислот 19, № 22, стр. 6337-6338.

[8] Николов, Д.Б., Ху, С.-Х., Лин, Дж., Гаш, А., Хоффманн, А., Хорикоши, М., Чуа, Н.-Х., Редер, Р.Г., Берли, С.К. 1992. Кристаллическая структура белка, связывающего ТАТА-бокс TFIID. Природа 360, стр. 40–46.

[9] Се, X.-L., Кокубо, Т., Коэн, С., Мирза, У.А., Хоффманн, А., Чейт, Б.Т., Редер, Р.Г., Накатани, Ю., Берли, С.К. 1996. Структурное сходство между TAF и гетеротетрамерное ядро октамера гистонов. Природа 380, № 6572, стр. 316-322.

[10] Хоффманн, А., Люнг, Т.Х., Балтимор, Д. 2003. Генетический анализ факторов транскрипции NF-kB/Rel выявляет молекулярные специфичности. ЭМБО Дж., 22, стр. 5530-9.

[11] Хоффманн, А., Балтимор, Д. 2006. Схема передачи сигналов NF-kB. Иммунологические обзоры, 210, стр. 171-186. ПМИД 16623771

[12] Хоффманн А., Левченко А., Скотт М., Балтимор Д. 2002. Сигнальный модуль NF-B/IB: временной контроль и селективная активация генов. Наука, 298, стр. 1241–1245.

[13] Бехар, М., Хоффманн, А. Временные коды внутриклеточных сигналов, 2010 г. Текущее мнение в области генетики и развития, 20, стр. 684–693. ПМИД 20956081 , ПМК 2982931

[14] Басак, С., Бехар, М., Хоффманн, А. 2012. Уроки математического моделирования пути NFκB. Иммунологические обзоры, 246, стр. 221-38. ПМИД 22435558 , ПМК 3343698

[15] «Создание Института биосхем (BCI) как организованного исследовательского подразделения в Калифорнийском университете в Сан-Диего» . adminrecords.ucsd.edu . Проверено 1 декабря 2023 г.

[16] «Центр системной биологии Сан-Диего» . Проверено 1 декабря 2023 г.

[17] «Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе создает новый институт количественных и вычислительных биологических наук» . Геномная сеть . Проверено 1 декабря 2023 г.

[18] «Александр Гофман» . Группа биомедицинской математики . Проверено 27 июля 2024 г.

[19] Хоффманн, Александр; Певзнер, Павел; Субраманиам, Шанкар. «Программа последипломной подготовки по биоинформатике» . Проверено 1 декабря 2023 г.

[20] «Молодые ученые в области техники и науки» . Архивировано из оригинала 9 февраля 2015 г. Проверено 10 октября 2018 г.

[21] «Программы - Центр разнообразия Калифорнийского технологического института» . Архивировано из оригинала 29 ноября 2014 г. Проверено 4 октября 2014 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]