Марианна Фроммер
Марианна Фроммер (FAA) — австралийский генетик. Она родилась в Гонконге и получила образование в Сиднейском университете – степень бакалавра наук (с отличием) в 1969 году и степень доктора философии в 1976 году. Она наиболее известна разработкой протокола для картирования метилирования ДНК посредством бисульфитного геномного секвенирования .
Карьера
[ редактировать ]В начале своей карьеры Фроммер исследовала молекулярную биологию «сателлитных ДНК» в геноме человека. Она и ее коллега Джейн Проссер показали, что все классические спутники представляют собой простые повторяющиеся последовательности, богатые A+T. [ 1 ] Другим важным результатом стала идентификация последовательности Alu (SINE) как части повторяющейся единицы в Сателлите 1, тем самым показав, что SINEs могут быть высокоповторяющимся компонентом центромерного гетерохроматина. [ 2 ]
Затем Фроммер определил хромосомное расположение основных повторов простой последовательности, разработав новый метод нерадиоактивного мечения, основанный на включении бромдезоксиуридина в одноцепочечные зонды. [ 3 ] Метод был использован для очень точной локализации сателлитных повторов. Это исследование привело к наблюдению закономерностей метилирования динуклеотидов CpG в секвенированной геномной повторяющейся ДНК. [ нужна ссылка ]
В 1984 году Фроммер провел учебный отпуск в лаборатории Адриана Берда и принял участие в описании так называемых островков HTF (HpaII Tiny Fragments) в геномах млекопитающих. [ 4 ] Она и ее аспирантка Маргарет Гардинер-Гарден смогли идентифицировать эти геномные компоненты только по характеристикам последовательности ДНК, без предварительного знания статуса метилирования, и дали им название «CpG-островки». [ 5 ] Они показали, что CpG-островки являются отличительной чертой геномов позвоночных и что CpG-островки связаны с генами. Они показали, что большинство нервных и нейроэндокринных генов связаны с CpG-островками и, следовательно, предположили, что CpG-островки способствуют регулируемой транскрипции из нейральных предшественников и развитию нервной ткани у ранних эмбрионов. [ 6 ]
В 1998 году Фроммер понял, что можно амплифицировать продукты реакции дезаминирования ДНК и различать метилированные и неметилированные молекулы с помощью дидезокси-секвенирования. [ 7 ] Протокол Фроммера дал четкий положительный результат остатков метилцитозина. ПЦР-продукты бисульфитных реакций можно секвенировать напрямую для измерения степени метилирования в любом сайте CpG в популяции молекул ДНК. Особая сила метода заключалась в том, что клонирование и секвенирование продуктов ПЦР давали закономерности метилирования или «карты» отдельных молекул ДНК. [ 8 ] [ 9 ]
Фроммер и ее коллеги также разработали мощную модельную систему для изучения молекулярной биологии поведенческих характеристик и эволюционных процессов с использованием местных австралийских плодовых мух. [ 10 ] [ 11 ]
Награды
[ редактировать ]Фроммер был избран членом Австралийской академии наук в 2010 году. [ 12 ] Два периода своей карьеры она работала неполный рабочий день.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Фроммер М., Проссер Дж., Ткачук Д., Рейснер А.Х. и Винсент ПК (1982). Простые повторяющиеся последовательности в сателлитной ДНК человека. Нуклеиновые кислоты Рез. 10: 547-563.
- ^ Фроммер М., Проссер Дж. и Винсент ПК (1984). Последовательности человека-сателлита I включают мужскую специфичную тандемно повторяющуюся единицу размером 2,47 т.п.н., содержащую одного члена семейства Alu на повтор. Нуклеиновые кислоты Рез. 12:2887-2900.
- ^ Фроммер М., Пол К. и Винсент ПК (1988). Локализация последовательностей сателлитной ДНК на метафазных хромосомах человека с помощью зондов, меченных бромдезоксиуридином. Хромосома 97: 11-18.
- ^ Бёрд А., Таггарт М., Фроммер М., Миллер О.Дж. и Маклауд Д. (1985). Фракция генома мыши, происходящая из островков неметилированной ДНК, богатой CpG. Ячейка 40: 91-99.
- ^ Гардинер-Гарден, М. и Фроммер, М. (1987). CpG-островки в геномах позвоночных. Дж. Мол. Биол. 196: 261-282.
- ^ Гардинер-Гарден, М. и Фроммер, М. (1994). Транскрипты и CpG-островки, связанные с геном проопиомеланокортина и другими генами, экспрессируемыми в нейронах. Дж. Мол. Эндокринол. 12: 365-382.
- ^ Фроммер М., Макдональд Л.Е., Миллар Д.С., Коллис С.М., Ватт Ф., Григг Г.В., Моллой П.Л. и Пол К.Л. (1992). Протокол геномного секвенирования, позволяющий выявить остатки 5-метилцитозина в отдельных цепях ДНК. Учеб. Натл. акад. наук. США 89: 1827–1831.
- ^ Кларк, С. Дж., Харрисон, Дж., Пол, К. Л. и Фроммер, М. (1994). Высокочувствительное картирование метилированных цитозинов. Нуклеиновые кислоты Рез. 22: 2990-2997.
- ^ Кларк, С.Дж., Стэтхэм, А., Стирзакер, К., Моллой, П.Л. и Фроммер, М. (2006). Метилирование ДНК: модификация и анализ бисульфита. Протоколы природы 1: 2353-2364.
- ^ Ан, X., Уилкс, К., Бастиан, Ю., Морроу, Дж. Л., Фроммер, М. и Рафаэль, К. А. (2002). Ген периода у двух видов тефритидных плодовых мух, различающихся по брачному поведению. Насекомое Мол. Биол. 11: 419-430.
- ^ Гилкрист, А.С., Ширман, DCA, Фроммер, М., Рафаэль, К.А., Дешпанде, Н.П., Уилкинс, М.Р., Шервин, В.Б. и Свед, Дж.А. (представлено). Проект генома вредителя тефритидной плодовой мухи Bactrocera tryoni: ресурсы для геномного анализа гибридизирующихся видов.
- ^ «Марианна Фроммер» . Австралийская академия наук . Проверено 21 января 2024 г.
| Международный | |
|---|---|
| Национальный | |
| Люди | |
