Вирус Орсе
| Вирус Орсе | |
|---|---|
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Китриновирикота |
| Сорт: | Магсавирицетес |
| Заказ: | Нодамувиралес |
| Семья: | Нодавирусиды |
| Вирус: | Вирус Орсе
|
Вирус Орсе представляет собой одноцепочечный РНК-вирус с положительным смыслом , который инфицирует нематод Caenorhabditis elegans . Он похож на нодавирусы (семейство Nodaviridae ), но еще не классифицирован официально. [ 1 ]
Вирус Орсе имеет геном (+)оцРНК, состоящий из двух сегментов, называемых РНК1 и РНК2. Сегмент РНК1 кодирует РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRP) из 982 аминокислот. [ 2 ] Сегмент РНК2 имеет две открытые рамки считывания (ORF), которые кодируют капсидный белок и неструктурный белок с неизвестной функцией. [ 2 ] Вирус состоит из двух структурных доменов: оболочки (S) и выступающего (P) домена.
Вирус Орсе был обнаружен в 2011 году у нематод Caenorhabditis elegans в гниющих фруктах в Орсе , Франция. Незадолго до открытия были разработаны стандартизированные методы выделения нематод в дикой природе. С помощью этих методов были обнаружены нематоды Caenorhabditis briggsae и C. elegans , у которых наблюдались аномалии в кишечнике, такие как обширные извилины апикального края кишечника. [ 3 ] Лизат зараженных нематод добавляли к здоровым нематодам, что приводило к заражению. Поскольку для лизата использовался фильтр, пропускающий только вирусные частицы, это позволило предположить, что причиной кишечных нарушений был именно вирус. Электронная микроскопия, показывающая вирусные частицы, подтвердила роль вируса. [ 3 ]
При заражении восприимчивой нематодой вирусные частицы преимущественно локализуются в клетках кишечника. [ 4 ] Небольшая структура вируса Орсе, его сходство с хорошо изученными нодавирусами и его тропизм к кишечным клеткам C. elegans , а также отсутствие инфекционности для человека делают вирус Орсе полезным вирусом для изучения взаимодействий вирус-хозяин.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Вирус Орсе . Вирусно-хостовая БД
- ^ Jump up to: а б Гуо, Ю. Р. и др., Кристаллическая структура вируса, инфицирующего нематод. Труды Национальной академии наук , 2014. 111(35): с. 12781–12786.
- ^ Jump up to: а б Феликс, М.-А. и др., Естественная и экспериментальная инфекция нематод Caenorhabditis новыми вирусами, родственными нодавирусам . ПЛоС Биол , 2011. 9(1): с. е1000586.
- ^ Франц, CJ и др., Вирусы Орсе, Сантейя и Ле Блана в первую очередь поражают клетки кишечника нематод Caenorhabditis . Вирусология , 2014. 448: с. 255–264.