DiaGrid (распределенная вычислительная сеть)

DiaGrid — это крупная распределенная исследовательская вычислительная сеть с несколькими кампусами, использующая систему HTCondor и расположенная в Университете Пердью в Уэст-Лафайете, штат Индиана . В 2012 году в него входило около 43 000 процессоров, обеспечивающих 301 терафлопс вычислительной мощности. DiaGrid получила награду Campus Technology Innovators Award от журнала Campus Technology. ^{[ 1 ]} и награда IDG InfoWorld 100. ^{[ 2 ]} в 2009 году и работал на суперкомпьютерной конференции SC09 в Портленде, штат Орегон, чтобы отработать почти 150 дней вычислительного времени для научных работ. ^{[ 3 ]}

Партнеры

DiaGrid является партнерством с Purdue, Университетом Индианы , Университетом штата Индиана , Университетом Нотр-Дам , Университетом Луисвилля , Университетом Небраски , Университетом Висконсина Purdue's Calumet и North Central , кампусами , а также Университетом Индианы-Университетом Пердью Форт-Уэйн. . Он предназначен для размещения компьютеров в других кампусах по мере присоединения новых членов. Часть пула Purdue, получившая название BoilerGrid, является крупнейшей академической системой такого рода. ^{[ нужна ссылка ]}

Управление

DiaGrid находится в ведении Information Technology at Purdue (ITaP), центральной организации информационных технологий в кампусе Purdue в Вест-Лафайете, и исследовательского вычислительного подразделения ITaP — Центра передовых вычислений Розена, который также управляет кластерными суперкомпьютерами Steele , Coates , Rossmann, Hansen и Carter. . ^{[ нужна ссылка ]}

ХТКондор

С помощью HTCondor , разработанного в Университете Висконсина, DiaGrid собирает и управляет вычислительными циклами простаивающих или недостаточно используемых узлов высокопроизводительных вычислительных кластеров, серверов, компьютеров в университетских кампусах и других лабораториях, а также офисных компьютеров. Всякий раз, когда локальному пользователю или запланированному заданию требуется определенный компьютер, задание HTCondor останавливается и автоматически отправляется на другой узел HTCondor как можно скорее. Хотя эта «оппортунистическая» модель ограничивает возможность параллельной обработки и обмена данными, пул HTCondor может выполнять небольшие последовательные задания, выполняемые в большом количестве циклов за очень короткий промежуток времени. HTCondor — и, как следствие, DiaGrid — предназначен для вычислений с высокой пропускной способностью и отлично подходит для анализа параметров, моделирования Монте-Карло или практически для любого последовательного приложения. Некоторые классы параллельных заданий (главный-рабочий) также можно эффективно запускать через HTCondor. ^{[ нужна ссылка ]}

сеть

Для объединения вычислительных ресурсов, разбросанных по Индиане и Среднему Западу, DiaGrid использует I-Light, высокоскоростную оптоволоконную сеть штата, соединяющую кампусы Индианы друг с другом, Интернет и национальные исследовательские сети, такие как Internet2 и National LambdaRail . DiaGrid предоставляет вычислительные ресурсы исследователям как в Open Science Grid, Национального научного фонда США так и в системе Extreme Science and Engineering Discovery Environment (ранее TeraGrid ). ^{[ нужна ссылка ]}

Использование

DiaGrid и BoilerGrid использовались исследователями из Purdue и других организаций для различных целей. ^{[ 1 ]} такие как визуализация структуры вирусов с разрешением, близким к атомному, ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} моделирование ранних стадий формирования Солнечной системы, прогнозирование надежности электроснабжения Индианы, моделирование распространения загрязнителей воды, определение структуры белковых молекул и выявление миллионов потенциальных новых форм цеолитов , силикатных минералов, широко используемых для катализа химических реакций на планете. промышленного масштаба. ^{[ 6 ]} DiaGrid также используется для разработки методов обработки данных для Большого синоптического обзорного телескопа . В 2011 году Purdue добавила веб-портал для обработки BLAST с помощью DiaGrid.

Внешние ссылки

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Груш, Мэри; Виллано, Мэтт (28 июля 2009 г.). «Награда новаторов в области технологий кампуса 2009: Высокопроизводительные вычисления - Университет Пердью» . Кампусные технологии .
^ «100 лучших ИТ-проектов 2009 года» . InfoWorld, 23 ноября 2009 г. {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
^ «Циклические вычисления и Университет Пердью представят динамически оптимизированный пул Condor на выставке SuperComputing 2009» (пресс-релиз). 13 ноября 2009 г.
^ Цзян, Вэнь; и др. (28 февраля 2008 г.). «Основная структура капсида инфекционного вируса e15, выявленная с помощью электронной криомикроскопии» (PDF) . Природа . 451 (7182): 1130–1134. Бибкод : 2008Natur.451.1130J . дои : 10.1038/nature06665 . ПМИД 18305544 . S2CID 205212346 .
^ Ву, Вэйминь; Цзян, Вэнь (30 апреля 2008 г.). «Кондор в обработке крио-ЭМ изображений» . Архивировано из оригинала 25 июля 2011 года . Проверено 21 января 2010 г.
^ Пофале, Рамдас; Чизмен, Филипп А.; Дим, Майкл В. (2011). «База данных новых цеолитоподобных материалов». Физическая химия Химическая физика . 13 (27): 12407–12412. Бибкод : 2011PCCP...1312407P . дои : 10.1039/C0CP02255A . ПМИД 21423937 .

[ct09-1] Jump up to: ^а ^б Груш, Мэри; Виллано, Мэтт (28 июля 2009 г.). «Награда новаторов в области технологий кампуса 2009: Высокопроизводительные вычисления - Университет Пердью» . Кампусные технологии .

[iw09-2] «100 лучших ИТ-проектов 2009 года» . InfoWorld, 23 ноября 2009 г. {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )

[3] «Циклические вычисления и Университет Пердью представят динамически оптимизированный пул Condor на выставке SuperComputing 2009» (пресс-релиз). 13 ноября 2009 г.

[4] Цзян, Вэнь; и др. (28 февраля 2008 г.). «Основная структура капсида инфекционного вируса e15, выявленная с помощью электронной криомикроскопии» (PDF) . Природа . 451 (7182): 1130–1134. Бибкод : 2008Natur.451.1130J . дои : 10.1038/nature06665 . ПМИД 18305544 . S2CID 205212346 .

[5] Ву, Вэйминь; Цзян, Вэнь (30 апреля 2008 г.). «Кондор в обработке крио-ЭМ изображений» . Архивировано из оригинала 25 июля 2011 года . Проверено 21 января 2010 г.

[zdb-6] Пофале, Рамдас; Чизмен, Филипп А.; Дим, Майкл В. (2011). «База данных новых цеолитоподобных материалов». Физическая химия Химическая физика . 13 (27): 12407–12412. Бибкод : 2011PCCP...1312407P . дои : 10.1039/C0CP02255A . ПМИД 21423937 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]