Цифровая автоматизированная система идентификации

Цифровая автоматизированная система идентификации (DAISY)
Разработчик(и)	Марк А. О'Нил
Стабильная версия	2.1.0 / 1 февраля 2016 г .; 8 лет назад
Написано в	С [ нужна ссылка ]
Операционная система	Линукс
Платформа	ИА-32 x86-64 ARM
Доступно в	Английский
Лицензия	Собственное коммерческое программное обеспечение
Веб-сайт	www .tumblingdice .co .uk /ромашка

Цифровая автоматизированная система идентификации (DAISY) — это автоматизированная система идентификации видов , оптимизированная для быстрого скрининга беспозвоночных (например, насекомых) неспециалистами (например, паратаксономистами ).

Он был разработан доктором Марком О'Нилом в середине 1990-х годов. Развитие поддерживалось финансированием Дарвинской инициативы в 1997 году. ^{[ 1 ]} и ББСРК . ^{[ 2 ]} Права интеллектуальной собственности были приобретены компанией О'Нила Tumbling Dice Ltd в феврале 2000 года. ^{[ 3 ]} в конце Дарвинского проекта, финансируемого грантом . Система подверглась дальнейшему развитию, в результате чего был создан экземпляр, доступный через Интернет и способный практически в реальном времени справляться с группами (например, бражниками ), содержащими несколько сотен таксонов . На серверном оборудовании ПК среднего и высокого класса (например, блейд-сервере ) идентификация группы из 300 таксонов возможна менее чем за секунду. Распараллеливание важнейших кодов классификатора DAISY (с использованием специальной технологии FPGA общего назначения, или технологии программирования графических процессоров такой как CUDA ) даст повышение производительности на порядок. Это означает, что DAISY можно использовать для идентификации в режиме реального времени внутри групп, содержащих тысячи таксонов (например, настоящих мух ).

**Результаты DAISY для выбранных таксонов насекомых**
таксон	тип изображения	структура	обучающие изображения	разновидность	успех(%)
Белизские сфингиды	RGB	крыло	705	58	97
Ксилофаны сп.	RGB	крыло	543	30	99
Паразитические осы	мононуклеоз	крыло	559	47	95
Британские бабочки	RGB	крыло	818	57	98
Британская макромоль	RGB	крыло	744	37	98
Гусеницы	RGB	голова	91	7	93
Гусеницы	RGB	тело	508	10	99
Вредители мягких фруктов	RGB	тело	2634	23	91

**Результаты DAISY для других задач классификации изображений**
описание	тип изображения	структура	обучающие изображения	занятия	успех(%)
Пищевые банки	RGB	этикетка	31	5	100
Промышленные объекты	RGB	неэкспонированный объект	155	14	100
фораминифер Тесты	RGB	неэкспонированный объект	198	8	95
Пыльцевые зерна	RGB	неэкспонированный объект	6601	12	99
Пауки	мононуклеоз	гениталии	102	6	91
Человеческие лица	мононуклеоз	открытое лицо	400	41	99

DAISY использовалась О'Нилом в нескольких исследовательских проектах. ^{[ 4 ]} и других, а также фигурировал в научно-популярных телевизионных и журнальных статьях. Этот проект также стал темой недавней статьи в журнале Science . ^{[ 5 ]}

В 2011 году первая установка DAISY, способная масштабироваться до сотен таксонов, была установлена в Музее естественной истории в Лондоне. Этот сервер предлагал интерфейсы на основе VNC и веб-сервисов и мог переносить трудоемкие операции сопоставления с образцом на NVIDIA графический процессор , запрограммированный с использованием CUDA . Эта установка была способна обеспечить идентификацию видов по набору данных из более чем 300 таксонов менее чем за секунду в многопользовательской среде.

Совсем недавно, под эгидой Innovate UK , DAISY была значительно модифицирована для удовлетворения потребностей разведывательной деятельности в нефтегазовом секторе, в частности биостратиграфии . Созданная в результате система GeoDAISY представляет собой значительный технологический прогресс. Он способен к глубокому обучению , инкапсуляции знаний, интеллектуальному анализу данных на основе шаблонов и поиску контента (на основе изображений) , а также может эффективно обрабатывать обучающие наборы, состоящие из миллионов шаблонов, на обычном оборудовании, используя комбинацию интеллектуального кэширования данных и OpenMP . Более подробную информацию о GeoDAISY и обоснование ее разработки можно найти в виде официальных документов на странице Tumbling Dice LinkedIn .

Показаны примеры изображений, классифицированных с помощью DAISY.

См. также

Лифснап ^{[ 6 ]}
iPlants ^{[ 7 ]}
ПлантНет ^{[ 8 ]}
Растения (программное обеспечение) ^{[ 9 ]}
Плантатор ^{[ 10 ]}
ПриродаВорота ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ «Автоматизация идентификации насекомых для инвентаризации биоразнообразия Коста-Рики» . Дарвиновская инициатива . Дефра . Проверено 15 декабря 2010 г.
^ «Обзор Дейзи» (PDF) . ООО «Амблинг Дайс», 2007 г. Проверено 14 декабря 2010 г.
^ «Маргаритка» . Кувыркающиеся игральные кости . Проверено 14 декабря 2010 г.
^ Уотсон, Анна Т .; О'Нил, Марк А .; Китчинг, Ян Дж. (2003). «Качественное исследование по изучению автоматизированной идентификации живых макрочешуекрылых с использованием цифровой автоматизированной системы идентификации (DAISY)». Систематика и биоразнообразие . 1 : 287–300. дои : 10.1017/S1477200003001208 . S2CID 86265419 .
^ Рид, Сара (2010). «Толкаешь ДЭЙЗИ». Наука . 328 (5986): 1628–1629. дои : 10.1126/science.328.5986.1628 . ПМИД 20576867 .
^ Листоснап
^ iPlants
^ «ПлантНет» . Архивировано из оригинала 18 апреля 2018 г. Проверено 13 апреля 2018 г.
^ Растения
^ Плантификатор
^ ПриродаГейт

Внешние ссылки

[1] «Автоматизация идентификации насекомых для инвентаризации биоразнообразия Коста-Рики» . Дарвиновская инициатива . Дефра . Проверено 15 декабря 2010 г.

[overview-2] «Обзор Дейзи» (PDF) . ООО «Амблинг Дайс», 2007 г. Проверено 14 декабря 2010 г.

[3] «Маргаритка» . Кувыркающиеся игральные кости . Проверено 14 декабря 2010 г.

[4] Уотсон, Анна Т .; О'Нил, Марк А .; Китчинг, Ян Дж. (2003). «Качественное исследование по изучению автоматизированной идентификации живых макрочешуекрылых с использованием цифровой автоматизированной системы идентификации (DAISY)». Систематика и биоразнообразие . 1 : 287–300. дои : 10.1017/S1477200003001208 . S2CID 86265419 .

[5] Рид, Сара (2010). «Толкаешь ДЭЙЗИ». Наука . 328 (5986): 1628–1629. дои : 10.1126/science.328.5986.1628 . ПМИД 20576867 .

[6] Листоснап

[7] Plants

[8] «ПлантНет» . Архивировано из оригинала 18 апреля 2018 г. Проверено 13 апреля 2018 г.

[9] Растения

[10] Плантификатор

[11] ПриродаГейт

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]