Снпстр
SNPSTR состоящий — это сложный генетический маркер, из одного или нескольких SNP и одного микросателлита (STR). Аутосомные SNPSTR, которые содержат SNP и микросателлит на расстоянии 500 пар оснований друг от друга, были обнаружены в 2002 году. [ 1 ] Совсем недавно была создана база данных , содержащая все SNPSTR в пяти модельных геномах, включая человеческий. [ 2 ]
Использование и важность
[ редактировать ]Широко распространен и растет интерес к генетическим маркерам, пригодным для составления популяционно-генетических выводов о прошлых демографических событиях и для обнаружения эффектов отбора. Однонуклеотидные полиморфизмы ( SNP ) и микросателлиты (или короткие тандемные повторы, STR) получили большое внимание при анализе истории человеческой популяции, хотя они имеют оба недостатка. Таким образом, было высказано предположение, что комбинация этих двух маркеров может привести к лучшим выводам.
См. также
[ редактировать ]- Популяционная генетика
- Биологическая база данных
- База данных частот аллелей STR человека Земли
- СПО-анализ
- Мультиплексная система STR
- Y-STR
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Маунтин Дж.Л., Найт А., Джобин М., Жиньу К., Миллер А., Лин А.А., Андерхилл П.А. SNPSTR: эмпирически полученные, быстро типируемые аутосомные гаплотипы для определения популяционной истории и мутационных процессов. Геном Рез. 2002;12:1766-1772.
- ^ AGRAFIOTI I AND STUMPF MPH (2007) «SNPSTR: база данных сложных микросателлитных-SNP-маркеров» Nucleic Acids Research 35 (выпуск базы данных): 71–75.