Распределенная система аннотаций/клиенты
Эта таблица клиентских приложений для Распределенной системы аннотаций была создана в первую очередь для включения в ее родительскую страницу . Родительская страница помещает таблицу в контекст, и вам следует перейти на нее для получения дополнительной информации. Таблица вынесена на отдельную страницу, чтобы при необходимости ее можно было включить .
Таблица следующая
[ редактировать ]Имя | Описание | Ссылки |
---|---|---|
BioJava DAS Клиент | ||
Дасти | Веб-клиент для визуализации информации о характеристиках последовательностей белков с использованием DAS. | [1] [2] |
ДасВью | Серверное приложение Perl. Этот инструмент упоминается в оригинальной публикации DAS, но впоследствии исчез. | |
АнсамбльEMBL | Браузер генома EnsEMBL . Обеспечивает встроенную поддержку DAS. | [3] |
геодезический | Автономное Java-приложение. | [4] |
ИГБ | Интегрированный браузер генома (IGB, произносится «ig-bee») — это приложение, созданное на основе GenoViz SDK и Genometry для визуализации и исследования геномов и соответствующих аннотаций из нескольких источников данных. | [5] |
Джалвью | Редактор и средство просмотра множественного выравнивания последовательностей | [6] |
всегенный | Пользовательский интерфейс основан на интерфейсе EnsEMBL. | [7] [8] |
СИМАП | Матрица сходства белков | [9] [10] [ постоянная мертвая ссылка ] |
СПАЙС | Браузер аннотаций белковых последовательностей и структур. | [11] [12] [13] |
РЕМЕНЬ | Подчеркивание особенностей последовательности в нескольких выравниваниях. Пример вывода: [14] | [15] |
Программа просмотра TIGR DAS | [16] | |
Червячная база | Геномный браузер WormBase. Включает программу просмотра DAS под названием DASView. |