Институт Дж. Крейга Вентера

32 ° 52'09 "N 117 ° 14'35" W / 32,869107 ° N 117,243037 ° W Институт Дж. Крейга Вентера ( JCVI ) — некоммерческий институт геномики, научно-исследовательский основанный Дж. Крейгом Вентером , доктором философии. в октябре 2006 года. Институт стал результатом объединения четырех организаций: Центра развития геномики, Института геномных исследований (TIGR), Института биологических энергетических альтернатив и Объединенного технологического центра Научного фонда Дж. Крейга Вентера. У него есть предприятия в Роквилле , штат Мэриленд , и Сан-Диего , штат Калифорния . [ нужна ссылка ]
институт изучает социальные Помимо самой геномики, последствия геномики. Исследования института связаны с геномной медициной; экологический геномный анализ; чистая энергия ; синтетическая биология ; и этика, право и экономика. В институте работает более 200 человек, в том числе нобелевский лауреат Гамильтон Смит . В 2022 году он был продан Калифорнийскому университету в Сан-Диего .
История [ править ]
В 2004 году Центр развития геномики (TCAG), Институт биологических энергетических альтернатив (IBEA) и Объединенный технологический центр Института Дж. Крейга Вентера (JTC) были объединены и образовали Институт Дж. Крейга Вентера (JCVI). . [1]
В 1992 году Крейг Вентер работал исследователем в Национальном институте здравоохранения (NIH). В то же время он основал Институт геномных исследований (TIGR) и принимал участие в определении генома человека . [2] [3] [4] Из-за разногласий по поводу управления проектом TIGR был исключен из финансирования НИЗ в 1998 году. [5] [6] Политические, личные и этические конфликты гонки между государственным и частным секторами были заметны. [2] [3] [4] [7] [8] [9] [10] [11] [12] [ чрезмерное цитирование ]
В 1995 году предшественник Института Дж. Крейга Вентера, TIGR, определил последовательность Haemophilus influenzae , Mycoplasmaogenicium и Methanococcus jannaschii . [13] [14] В 1997 году TIGR определил геном Borrelia burgdorferi (вызывающей болезнь Лайма). [15] В 1998 году TIGR секвенировал геном бледной трепонемы (вызывающей сифилис). [16] В 1999 году TIGR опубликовала последовательность радиорезистентного полиэкстремофила Deinococcus radiodurans . [17] TIGR секвенировал и проанализировал более 50 микробных геномов. Компания TIGR разработала программу поиска генов GLIMMER и выравнивания последовательностей программу MUMmer . Во время атак сибирской язвы в 2001 году TIGR работала с Национальным научным фондом и ФБР над секвенированием штамма Bacillus anthracis, используемого в биотеррористических атаках. [18]
В июне 2000 года Вентер основал Центр развития геномики (TCAG), аналитический центр по изучению этики генетики человека и исследований стволовых клеток. [19] [20]
Также в 2002 году Вентер основал Институт биологических энергетических альтернатив (IBEA) для исследования использования микроорганизмов для производства альтернативных видов топлива (например, водорода) и улавливания углекислого газа . [19] IBEA начало геномное секвенирование популяций микроорганизмов из окружающей среды, которые можно было бы использовать. [21] Чтобы обеспечить поддержку этих объектов, Вентер создал Объединенный технологический центр (JTC) Института Дж. Крейга Вентера, который специализировался на высокопроизводительном секвенировании . Чтобы обеспечить административную и финансовую поддержку TIGR, TCAG, IBEA и JTC, Вентер создал некоммерческий Научный фонд Дж. Крейга Вентера (JCVSF) для консолидации деятельности дочерних организаций.
В 2007 году институт опубликовал первый диплоидный геном человека, то есть геном одного человека (Дж. Крейга Вентера), в котором были секвенированы оба набора хромосом. [22] В 2010 году институт определил геном Mycoplasma mycoides длиной 1,08 миллиона пар оснований , который затем был встроен в клетку, чтобы создать первую клетку с полностью синтетическим геномом. [23]
В апреле 2022 года Вентер продал объект в Ла-Хойе Калифорнийскому университету в Сан-Диего за 25 миллионов долларов. Университет, который уже имеет очень сильную программу по геномике, надеется поглотить большую часть профессорско-преподавательского состава института и его текущие исследовательские гранты. Вентер продолжит возглавлять отдельную некоммерческую исследовательскую группу, также известную как Институт Дж. Крейга Вентера. [24]
См. также [ править ]
- Искусственная клетка
- Институт геномных исследований
- Глобальная экспедиция по отбору проб океана
- Лабораторная микоплазма
- Синтетические микоиды
Ссылки [ править ]
- ^ «Дж. Крейг Вентер объявляет об объединении трех исследовательских организаций в одну новую некоммерческую организацию — Институт Дж. Крейга Вентера» (пресс-релиз). Институт Дж. Крейга Вентера. 29 сентября 2004 года . Проверено 20 марта 2012 г.
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Шрив, Джеймс (2004). Геномная война: как Крейг Вентер пытался уловить код жизни и спасти мир . Кнопф. ISBN 0375406298 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Салстон, Джон (2002). Общая нить: история науки, политики, этики и генома человека . Джозеф Генри Пресс. ISBN 0309084091 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «Гонка проекта генома человека» . Центр биомолекулярной науки и техники, Калифорнийский университет в Санта-Крус . Проверено 20 марта 2012 г.
- ^ Прюитт, Ким Д. (1998). «WebWise: Путеводитель по веб-сайту Института геномных исследований» . Геномные исследования . 8 (10): 1000–1004. дои : 10.1101/гр.8.10.1000 . ПМИД 9799788 . Проверено 20 марта 2012 г.
- ^ Пенниси, Э. (1998). «ПРОЕКТ ГЕНОМА ЧЕЛОВЕКА: Запланированное ускорение секвенирования генома, но план постоянно меняется». Наука . 281 (5374): 148–149. дои : 10.1126/science.281.5374.148 . ПМИД 9687268 . S2CID 40799090 .
- ^ Гузнер, Меррилл (19 декабря 2001 г.). «Патентование жизни» . Американский проспект . Проверено 20 марта 2012 г.
- ^ МакЭлхени, Виктор К. (2010). Рисование карты жизни: проект «Геном человека изнутри» . Основные книги. ISBN 978-0465043330 .
- ^ Вентер, Дж. Крейг (2007). Расшифрованная жизнь: Мой геном: Моя жизнь . Викинг взрослый. ISBN 978-0670063581 .
- ^ Рабинов, Пол; Дэн-Коэн, Талия (2004). Машина, создающая будущее: Биотехнологические хроники . Издательство Принстонского университета. ISBN 0691126143 .
- ^ Шрив, Джеймс (август 2004 г.). «Эпическое путешествие Крейга Вентера, чтобы переопределить происхождение видов» . Проводной . Том. 12, нет. 8 . Проверено 20 марта 2012 г.
- ^ Уэйд, Николас (27 июня 2000 г.). «Двойные ориентиры для Ватсона: спираль и геном» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 20 марта 2012 г.
- ^ Фрейзер, СМ ; Гокейн, доктор медицинских наук; Уайт, О.; Адамс, доктор медицины; Клейтон, РА; Флейшманн, РД; Балт, CJ; Керлаваж, Арканзас; Саттон, Г.; Келли, Дж. М.; Фричман, Дж.Л.; Вайдман, Дж. Ф.; Малый, КВ; Сандаски, М.; Фурманн, Дж.; Нгуен, Д.; Аттербек, ТР; Саудек, Д.М.; Филлипс, Калифорния; Меррик, Дж. М.; Могила, Ж.-Ф.; Догерти, бакалавр; Ботт, К.Ф.; Ху, П.-Ц.; Люсье, ТС; Петерсон, С.Н.; Смит, ХО; Хатчисон III, Калифорния; Вентер, Дж. К. (1995). «Минимальный набор генов Mycoplasmagentium». Наука . 270 (5235): 397–403. Бибкод : 1995Sci...270..397F . дои : 10.1126/science.270.5235.397 . ПМИД 7569993 . S2CID 29825758 .
- ^ Балт, CJ; Уайт, О.; Олсен, Дж.Дж.; Чжоу, Л.; Флейшманн, РД; Саттон, Дж.Г.; Блейк, Дж.А.; Фицджеральд, LM; Клейтон, РА; Гокейн, доктор медицинских наук; Керлаваж, Арканзас; Догерти, бакалавр; Могила, Ж.-Ф.; Адамс, доктор медицины; Райх, CI; Овербек, Р.; Киркнесс, Э.Ф.; Вайншток, КГ; Меррик, Дж. М.; Глодек, А.; Скотт, Дж.Л.; Геохаген, НСМ; Вентер, Дж. Ф.; Фурманн, Дж.Л.; Нгуен, Д.; Аттербек, ТР; Келли, Дж. М.; Петерсон, доктор медицинских наук; Садоу, П.В.; Ханна, MC (1996). «Полная последовательность генома метаногенного архея Methanococcus jannaschii». Наука . 273 (5278): 1058–1073. Бибкод : 1996Sci...273.1058B . дои : 10.1126/science.273.5278.1058 . ПМИД 8688087 . S2CID 41481616 .
- ^ Фрейзер, СМ ; Касьенс, С.; Хуанг, ВМ; Саттон, Дж.Г.; Клейтон, Р.; Латигра, Р.; Уайт, О.; Кетчум, Калифорния; Додсон, Р.; Хикки, ЕК; Гвинн, М.; Догерти, Б.; Могила, JF; Флейшманн, РД; Ричардсон, Д.; Петерсон, Дж.; Керлаваж, Арканзас; Квакенбуш, Дж.; Зальцберг, С.; Хэнсон, М.; Ван Вугт, Р.; Палмер, Н.; Адамс, доктор медицины; Гокейн, Дж.; Вайдман, Дж.; Аттербек, Т.; Уотти, Л.; Макдональд, Л.; Артяч, П.; Боуман, К. (1997). «Геномная последовательность спирохеты болезни Лайма, Borrelia burgdorferi» . Природа . 390 (6660): 580–586. Бибкод : 1997Natur.390..580F . дои : 10.1038/37551 . ПМИД 9403685 . S2CID 4388492 .
- ^ Фрейзер, СМ ; Норрис, С.Дж.; Вайншток, генеральный директор; Уайт, О.; Саттон, Дж.Г.; Додсон, Р.; Гвинн, М.; Хикки, ЕК; Клейтон, Р.; Кетчум, Калифорния; Содергрен, Э.; Хардхэм, Дж. М.; Маклеод, член парламента; Зальцберг, С.; Петерсон, Дж.; Халак, Х.; Ричардсон, Д.; Хауэлл, Дж. К.; Чидамбарам, М.; Аттербек, Т.; Макдональд, Л.; Артяч, П.; Боуман, К.; Коттон, Мэриленд; Фуджи, К.; Гарланд, С.; Хэтч, Б.; Хорст, К.; Робертс, К.; Сандаски, М. (1998). «Полная последовательность генома бледной трепонемы, спирохеты сифилиса». Наука . 281 (5375): 375–388. Бибкод : 1998Sci...281..375F . дои : 10.1126/science.281.5375.375 . ПМИД 9665876 .
- ^ Уайт, О.; Эйзен, Дж.; Гейдельберг, Дж.; Хики, Э.; Петерсон, Дж.; Додсон, Р.; Хафт, Д.; Гвинн, М.; Нельсон, В.; Ричардсон, ДЛ; Моффат, Канзас; Цинь, Х.; Цзян, Л.; Памфил, В.; Кросби, М.; Шен, М.; Ваматеван, Джей-Джей; Лам, П.; Макдональд, Л.; Аттербек, Т.; Залевский, К.; Макарова К.С.; Аравинд, Л.; Дейли, MJ; Минтон, КВ; Флейшманн, РД; Кетчум, Калифорния; Нельсон, Кентукки; Зальцберг, С.; Смит, Х.О. (1999). «Последовательность генома радиорезистентной бактерии Deinococcus radiodurans R1» . Наука . 286 (5444): 1571–1577. дои : 10.1126/science.286.5444.1571 . ПМЦ 4147723 . ПМИД 10567266 .
- ^ Читай, ТД; Зальцберг, С.; Поп, М.; Шамуэй, М.; Умаям, Л.; Цзян, Л.; Хольцаппл, Э.; Буш, Дж.; Смит, К.; Шупп, Дж. М.; Соломон, Д.; Кейм, П.; Фрейзер, CM (2002). «Сравнительное секвенирование генома для открытия новых полиморфизмов у Bacillus anthracis» . Наука . 296 (5575): 2028–2033. Бибкод : 2002Sci...296.2028R . дои : 10.1126/science.1071837 . ПМИД 12004073 . S2CID 15470665 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «Следующий шаг геномного гиганта» . Призма Техник . Проверено 20 марта 2012 г.
- ^ «Сеть новостей генома» . Проверено 20 марта 2012 г.
- ^ Смит, ХО; Фридман, Р; Вентер, Дж. Крейг (лето 2003 г.). «Биологические решения возобновляемой энергетики» . Мост . 33 (2) . Проверено 20 марта 2012 г.
- ^ Леви, С.; Саттон, Г.; Нг, ПК; Фейк, Л.; Халперн, Алабама; Валенц, БП; Аксельрод, Н.; Хуанг, Дж.; Киркнесс, Э.Ф.; Денисов Г.; Лин, Ю.; Макдональд-младший; Панг, AWC; Шаго, М.; Стоквелл, ТБ; Циамури, А.; Бафна, В.; Бансал, В.; Кравиц, SA; Бусам, Д.А.; Бисон, Кентукки; Макинтош, Калифорния; Ремингтон, Калифорния; Абриль, Дж. Ф.; Гилл, Дж.; Борман, Дж.; Роджерс, Ю.Х.; Фрейзер, Мэн; Шерер, SW; Штраусберг, Р.Л. (2007). «Диплоидная последовательность генома отдельного человека» . ПЛОС Биология . 5 (10): е254. doi : 10.1371/journal.pbio.0050254 . ЧВК 1964779 . ПМИД 17803354 .
- ^ Гибсон, Д.; Гласс, Дж.; Лартиг, К.; Носков В.; Чуанг, Р.; Альжир, М.; Бендерс, Г.; Монтегю, М.; Ма, Л.; Муди, ММ; Мерриман, К.; Ваши, С.; Кришнакумар, Р.; Асад-Гарсия, Н.; Эндрюс-Пфанкох, К.; Денисова Е.А.; Янг, Л.; Ци, З.-Ц.; Сигалл-Шапиро, TH; Калви, Швейцария; Пармар, ПП; Хатчисон, Калифорния, Калифорния; Смит, ХО; Вентер, Дж. К. (2010). «Создание бактериальной клетки, контролируемой химически синтезированным геномом». Наука . 329 (5987): 52–56. Бибкод : 2010Sci...329...52G . дои : 10.1126/science.1190719 . ПМИД 20488990 .
- ^ Роббинс, Гэри (27 апреля 2022 г.). «Генетик Крейг Вентер продает свой исследовательский центр в Ла-Хойе Калифорнийскому университету в Сан-Диего за 25 миллионов долларов» . Сан-Диего Юнион Трибьюн . Проверено 28 апреля 2022 г.