ДНКДинамо
| Разработчик(и) | ООО «БлюТракторСофтваре» |
|---|---|
| Операционная система | Mac OS X, Windows, Linux |
| Платформа | Ява |
| Тип | Биоинформатика |
| Лицензия | коммерческий |
| Веб-сайт | bluetractorsoftware.co.uk |
DNADynamo — это коммерческий пакет программного обеспечения для анализа последовательностей ДНК, разработанный Blue Tractor Software Ltd. [1] который работает в Microsoft Windows , Mac OS X и Linux [2] Его используют молекулярные биологи. [3] для анализа последовательностей ДНК и белков. Бесплатная демо-версия доступна на сайте разработчиков программного обеспечения.
Функции
[ редактировать ]DNADynamo — это пакет общего назначения для анализа последовательностей ДНК и белков, который может выполнять большинство функций, требуемых стандартной исследовательской лабораторией молекулярной биологии.
- Просмотр, редактирование и аннотирование последовательностей ДНК и белков
- Сборка контигов и редактирование хроматограмм , включая сравнение с эталонной последовательностью для выявления мутаций.
- Выравнивание глобальной последовательности с помощью ClustalW и MUSCLE и редактирование.
- Выберите и перетащите Редактирование выравнивания последовательностей для ручного выравнивания ДНК и белка
- Анализ сайтов ограничений - для просмотра мест срезания ограничений в таблицах, а также на линейных и круговых картах.
- Инструмент субклонирования для сборки конструкций с использованием Restriction Sites или сборки Gibson .
- Моделирование в агарозном геле .
- Поиск в базе данных в Интернете. Поиск в общедоступных базах данных в NCBI, таких как Genbank и UniProt .
- Онлайн- поиск BLAST .
- Анализ белка, включая оценку молекулярной массы, коэффициента вымирания и pI.
- Дизайн праймера для ПЦР , включая интерфейс к Primer3
- Просмотр 3D-структуры через интерфейс Jmol
История
[ редактировать ]DNADynamo разрабатывается с 2004 года компанией BlueTractorSoftware Ltd, компанией по разработке программного обеспечения, базирующейся в Северном Уэльсе, Великобритания. [4]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ "Дом" . bluetractorsoftware.co.uk .
- ^ «Системные требования для запуска DNADynamo» .
- ^ Цитаты из Google Scholar
- ^ «О компании Blue Tractor Software Ltd» .