Эдвард Баклер
Эдвард С. Баклер | |
|---|---|
 Эдвард С. Баклер | |
| Рожденный | |
| Национальность | Американский |
| Альма-матер | Университет Миссури |
| Награды | Премия НАН в области пищевых и сельскохозяйственных наук |
| Научная карьера | |
| Поля | Генетика |
| Учреждения | Министерство сельского хозяйства США , Корнельский университет |
| Докторантура | Тимоти Холтсфорд |
Эдвард С. Баклер — генетик растений в Службе сельскохозяйственных исследований Министерства сельского хозяйства США, работает по совместительству в Корнелльском университете. Его работа сосредоточена как на количественной, так и на статистической генетике кукурузы, а также других культур, таких как маниока. Он разработал концепцию картирования вложенных ассоциаций и создал первую популяцию, предназначенную для такого типа количественного генетического анализа. [1] Баклер был избран научным сотрудником Американской ассоциации содействия развитию науки в 2012 году. В 2014 году он был избран членом Национальной академии наук. [2] В 2017 году он получил премию Национальной академии наук в области пищевых продуктов и сельскохозяйственных наук за свою работу по использованию естественного генетического разнообразия для создания сортов кукурузы, в которых витамина А в пятнадцать раз больше, чем в существующих сортах. [3]
Карьера [ править ]
Баклер провел свое детство в Арлингтоне, штат Вирджиния, где его мать работала микробиологом, а отец работал в ВМС США. У него дислексия, и он не читал до второго класса. [4] Он учился в Университете Вирджинии, где специализировался в области биологии и археологии. После окончания учебы он переехал в Университет Миссури, где изучал одомашнивание кукурузы и молекулярную эволюцию под руководством Тимоти Холтсфорда, познакомился со своей женой и получил докторскую степень в 1997 году. Он получил постдок в Университете штата Северная Каролина вместе с Брюсом Вейром и Майклом Пуруггананом. Он присоединился к Министерству сельского хозяйства США в качестве генетика в 1998 году, а с 2003 года работал в Итаке, штат Нью-Йорк, и сотрудничал с Корнелльским университетом. В 2014 году Баклер принимал Билла Гейтса во время визита в Корнелл, связанного с поддержкой Гейтсом разработки улучшенных сортов маниоки . [5]
Сопоставление вложенных ассоциаций [ править ]
Картирование вложенных ассоциаций (NAM) было разработано как подход, позволяющий объединить преимущества картирования связей со структурированными популяциями и картирования ассоциаций с естественными популяциями, одновременно ограничивая их соответствующие недостатки. Баклер начал разработку первоначальной популяции кукурузы для картирования гнездовых ассоциаций в 2002 году, используя двадцать пять инбредных линий кукурузы, отобранных для улавливания как можно большего количества аллелей, присутствующих в этом виде, и скрещивая каждую из них с общим родителем для создания 5000 инбредных линий (по 200 на семью). в конечном итоге было зафиксировано более 100 000 генетических кроссоверов. [6] Лаборатория Баклера выпустила инбредных особей, а также провела первое исследование с их использованием для картирования локусов, контролирующих фенотип (время цветения) в 2009 году. [7] С тех пор популяция использовалась для идентификации генетической архитектуры, контролирующей более 100 признаков всего растения, а также десятки тысяч молекулярных признаков (метаболитов и количества транскриптов генов). После выпуска и успеха популяции NAM кукурузы аналогичные популяции были созданы для количественных генетических исследований риса. [8] соя, пшеница, [9] сорго, [10] ячмень, [11] и канола. [12]
Генотипирование путем секвенирования [ править ]
В 2011 году группа Бакера опубликовала простой протокол использования новой на тот момент технологии высокопроизводительного секвенирования для генотипирования тысяч генетических маркеров у сотен людей. [13] Этот подход генотипирования путем секвенирования получил широкое распространение: первоначальный протокол процитирован более 4000 раз [1] .
Инструменты для разведения [ править ]
Исследовательская группа Баклера также разработала TASSEL, набор программных инструментов для обнаружения и расчета SNP, а также проведения полногеномного анализа ассоциаций с использованием обобщенных линейных моделей и смешанных линейных моделей. Инструмент был разработан с целью обеспечить возможность работы в рамках ограничений памяти и процессора среднего ноутбука, что позволит использовать его ученым и селекционерам по всему миру и в развивающихся странах. Статья, описывающая этот программный пакет, цитировалась более 3400 раз. [14]
Ссылки [ править ]
- ^ Воосен, Пол (21 декабря 2009 г.). «Тихая биотехнологическая революция, преобразующая сельскохозяйственные культуры» . Нью-Йорк Таймс .
- ^ «Эдвард Баклер» . www.nasonline.org .
- ^ «Эдвард Баклер» . www.nasonline.org .
- ^ «Эдвард Баклер» . кукуруза-разнообразие .
- ^ Гейтс, Билл. «Любовная жизнь растений» . Gatesnotes.com .
- ^ Ю, Дж., Холланд, Дж.Б., МакМаллен, доктор медицинских наук, и Баклер, Э.С. (2008). Генетический дизайн и статистическая сила картирования вложенных ассоциаций кукурузы. Генетика, 178(1), 539-551.
- ^ Баклер, Э.С., Холланд, Дж.Б., Брэдбери, П.Дж., Ачарья, CB, Браун, П.Дж., Браун, К., ... и Гудман, М.М. (2009). Генетическая архитектура времени цветения кукурузы. Наука, 325(5941), 714-718. дои: https://doi.org/10.1126/science.1174276
- ^ Фрагосо, Калифорния, Морено, М., Ван, З., Хеффельфингер, К., Арбелаес, Л.Дж., Агирре, Дж.А., ... и Деллапорта, С.Л. (2017). Генетическая архитектура популяции рисовых гнездовых ассоциаций, картирующей популяцию. G3: Гены, геномы, генетика, 7 (6), 1913–1926 гг. doi: https://doi.org/10.1534/g3.117.041608
- ^ Винген, Л.У., Уэст, К., Леверингтон-Уэйт, М., Коллиер, С., Орфорд, С., Горам, Р., ... и Эдвардс, К.Дж. (2017). Разнообразие генома местных сортов пшеницы. Генетика, 205 (4), 1657–1676. дои: https://doi.org/10.1534/genetics.116.194688
- ^ Буше, С., Олатойе, М.О., Марла, С.Р., Перумал, Р., Тессо, Т., Ю, Дж., ... и Моррис, Г.П. (2017). Расширение возможностей для анализа адаптивных признаков глобального разнообразия сорго с использованием популяции, картирующей вложенные ассоциации. Генетика, 206(2), 573-585. дои: https://doi.org/10.1534/genetics.116.198499
- ^ Маурер А., Драба В., Цзян Ю., Шнайтманн Ф., Шарма Р., Шуман Э., ... и Пиллен К. (2015). Моделирование генетической архитектуры контроля времени цветения ячменя посредством картирования вложенных ассоциаций. Геномика BMC, 16(1), 290 doi: https://doi.org/10.1186/s12864-015-1459-7
- ^ Ху, Дж., Го, К., Ван, Б., Е, Дж., Лю, М., Ву, З., ... и Лю, К. (2018). Генетические свойства популяции картирования гнездовых ассоциаций, созданной с использованием полуозимого и ярового рапса. Границы в науке о растениях, 9, 1740 г.: https://doi.org/10.3389/fpls.2018.01740
- ^ Элшир, Р.Дж., Глаубиц, Дж.К., Сан, К., Польша, Дж.А., Кавамото, К., Баклер, Э.С., и Митчелл, С.Э. (2011). Надежный и простой подход генотипирования путем секвенирования (GBS) для видов с высоким разнообразием. ПЛОС ОДИН, 6(5) дои: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0019379
- ^ Брэдбери, П.Дж., Чжан, З., Крун, Д.Э., Касстивенс, Т.М., Рамдосс, Ю., и Баклер, Э.С. (2007). TASSEL: программное обеспечение для картирования ассоциаций сложных признаков в различных образцах. Биоинформатика, 23(19), 2633-2635 doi: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm308
| Базы данных авторитетного контроля : академики |
|---|
