ClearVolume

ClearVolume ^[1] в реальном времени с открытым исходным кодом, — это библиотека трехмерной визуализации предназначенная для высококлассных объемных световых микроскопов . ClearVolume обеспечивает живую визуализацию данных микроскопа, позволяя биологам немедленно решить, стоит ли визуализировать образец. ClearVolume можно легко интегрировать в существующее программное обеспечение для микроскопов на базе Java , C/C++ , Python или LabVIEW . Он имеет специальный интерфейс для управляющего программного обеспечения MicroManager/OpenSpim/OpenSpin. ClearVolume поддерживает многоканальную потоковую передачу 3D-данных в реальном времени с удаленных микроскопов и использует многопроходный алгоритм рендеринга Фибоначчи, который может обрабатывать большие объемы. Более того, ClearVolume интегрирован в экосистему FiJi / ImageJ2 / KNIME .

См. также

Ссылки

^ Ройер, Лоик А; Вейгерт, Мартин; Гюнтер, Ульрик; Магелли, Никола; Кувшин, Флориан; Сбальцарини, Иво Ф.; Майерс, Юджин В. (2015). «ClearVolume — живая 3D-визуализация с открытым исходным кодом для световой листовой микроскопии» . Природные методы . 12 (6): 480–481. дои : 10.1038/nmeth.3372 . ПМИД 26020498 . S2CID 205423715 .

Внешние ссылки

[1] Веб-сайт проекта ClearVolume с открытым исходным кодом со ссылками на вики, репозитории кода и средства отслеживания проблем.
[2] Страница проекта плагина ClearVolume KNIME.
[3] Страница проекта плагина ClearVolume FiJi.

[ClearVolume2015-1] Ройер, Лоик А; Вейгерт, Мартин; Гюнтер, Ульрик; Магелли, Никола; Кувшин, Флориан; Сбальцарини, Иво Ф.; Майерс, Юджин В. (2015). «ClearVolume — живая 3D-визуализация с открытым исходным кодом для световой листовой микроскопии» . Природные методы . 12 (6): 480–481. дои : 10.1038/nmeth.3372 . ПМИД 26020498 . S2CID 205423715 .

[1]