✖


Jump to content

Барт Депланке

    Add links
    Барт Депланке
    Депланке в 2017 году
    Рожденный ( 1975-08-21 ) 21 августа 1975 г. (48 лет)
    Национальность бельгийский
    Академическое образование
    Альма-матер Гентский университет
    Университет Иллинойса в Урбана-Шампейн
    Академическая работа
    Учреждения Федеральная политехническая школа Лозанны
    Гарвардская медицинская школа
    Медицинская школа Массачусетского университета в Чан
    Веб-сайт депланкелаб .epfl .ч

    Барт Депланке (родился 21 августа 1975 г.) — бельгийский биоинженер и исследователь. Он является профессором Федеральной политехнической школы Лозанны , где возглавляет лабораторию системной биологии и генетики. [1]

    Карьера

    [ редактировать ]

    Депланке изучал биохимическую инженерию в Гентском университете и получил степень магистра наук в 1998 году. В 2002 году он получил докторскую степень по иммунобиологии в Университете Иллинойса в Урбана-Шампейн за исследования взаимодействия кишечных микроорганизмов и врожденного иммунитета. [2] [3] [4] Затем он продолжил постдокторские исследования в лабораториях Марка Видала ( Гарвардская медицинская школа ) и Мэриан Уолхаут ( Массачусетский университет ), где он разработал высокопроизводительный подход скрининга взаимодействия белка и ДНК и работал над выяснением генетических регуляторных сетей многоклеточных животных. [5] [6] В 2007 году он основал собственную лабораторию в Федеральной политехнической школе Лозанны , где он последовательно получил звание доцента в 2014 году и профессора в 2020 году. В настоящее время он является там заместителем декана по инновациям. [1] Он является соучредителем научной сети «Юные европейские исследователи дрозофилы» (JEDI). [7] С 2013 года Депланке является руководителем группы Швейцарского института биоинформатики. [8]

    Исследовать

    [ редактировать ]

    Лаборатория Барта Депланке разрабатывает инструменты микрофлюидики, высокопроизводительного секвенирования и геномики отдельных клеток для изучения происхождения, разнообразия и функций стромальных клеток в жировых тканях , а также для лучшего понимания того, как геномные вариации могут влиять на молекулярное и организменное разнообразие. Особое внимание уделяется метаболическим фенотипам. [1] [9] В частности, Депланке использует адипогенез в качестве модельной системы, чтобы лучше понять регуляторные сети, управляющие клеточной дифференцировкой, уделяя особое внимание роли факторов транскрипции. [10] [11] и корегуляторы транскрипции. [12]

    Используя транскриптомику отдельных клеток, команда Депланке обнаружила ранее неизвестные клетки, регулирующие адипогенез ( Aregs ), которые наделены способностью подавлять адипогенез . Это открытие может иметь важное значение для лечения хронических метаболических нарушений, таких как ожирение или диабет 2 типа. . [13] [14] Лаборатория Депланке также способствовала пониманию того, что некодирующие генетические варианты оказывают более широкое влияние на молекулярное и организменное разнообразие, чем ожидалось ранее, тем самым вводя концепцию вариабельных модулей хроматина (VCM). [15] [16] [17]

    Совместно с лабораторией Труди Маккей Депланке и его коллеги охарактеризовали генетическую справочную группу дрозофилы с целью повысить надежность исследований взаимосвязи генотипа и фенотипа. [18] [19] позволяя выяснить важные генетические принципы, лежащие в основе изменений иммунокомпетентности кишечника. [20] [21] [22]

    Инновации

    [ редактировать ]

    В 2011 году Депланке стал соучредителем Genohm, компании, поставляющей программные продукты и услуги для управления большими данными для фармацевтических и научно-исследовательских лабораторий, которая была приобретена Agilent в мае 2018 года. [23] [24]

    В 2020 году он стал соучредителем Althea Genomics, компании, специализирующейся на создании высокопроизводительной транскриптомики, доступной для академических проектов, функционализации биобанков и платформ для скрининга лекарств. [25] [26]

    Отличия

    [ редактировать ]

    В 2005 году Депланке получил Премию молодого исследователя Питера Ридса от Американского общества наук о питании за свою работу по влиянию генетических факторов в ответ на бактериальные инфекции. [27]

    В 2017 году он был избран в Национальный исследовательский совет Швейцарского национального научного фонда . [28]

    Ссылки

    [ редактировать ]
    1. ^ Jump up to: а б с «Лаборатория Барта Депланке в EPFL» . Проверено 2 сентября 2020 г.
    2. ^ Депланке, Барт; Гаскинс, Х. Рекс (2003). «Сероводород индуцирует независимое от сыворотки вступление в клеточный цикл в нетрансформированных эпителиальных клетках кишечника крыс» . Журнал ФАСЭБ . 17 (10): 1310–1312. doi : 10.1096/fj.02-0883fje . ISSN   1530-6860 . ПМИД   12738807 . S2CID   14505067 .
    3. ^ Депланке, Барт; Видаль, Оливье; Ганессанкер, Дешани; Донован, Шэрон М.; Маки, Родерик И.; Гаскинс, Х. Рекс (1 ноября 2002 г.). «Селективный рост муколитических бактерий, включая Clostridium perfringens, в модели полного парентерального питания новорожденных поросят» . Американский журнал клинического питания . 76 (5): 1117–1125. дои : 10.1093/ajcn/76.5.1117 . ISSN   0002-9165 . ПМИД   12399288 .
    4. ^ Депланке, Барт; Гаскинс, Х. Рекс (1 июня 2001 г.). «Микробная модуляция врожденной защиты: бокаловидные клетки и слой слизи кишечника» . Американский журнал клинического питания . 73 (6): 1131С–1141С. дои : 10.1093/ajcn/73.6.1131S . ISSN   0002-9165 . ПМИД   11393191 .
    5. ^ Депланке, Барт; Дюпюи, Дени; Видаль, Марк; Уолхаут, Альберта Дж. М. (15 октября 2004 г.). «Совместимая с шлюзом одногибридная система дрожжей» . Геномные исследования . 14 (10б): 2093–2101. дои : 10.1101/гр.2445504 . ISSN   1088-9051 . ПМК   528925 . ПМИД   15489331 .
    6. ^ Депланке, Барт; Мухопадхьяй, Арнаб; Ао, Ваньюань; Элева, Ахмед М.; Гроув, Кристиан А.; Мартинес, Наталья Дж.; Секерра, Рейнальдо; Дусетт-Стамм, Линн; Рис-Хойс, Джон С.; Хоуп, Ян А.; Тиссенбаум, Хайди А. (13 июня 2006 г.). «Геноцентрированная сеть взаимодействия белка и ДНК C. elegans» . Клетка . 125 (6): 1193–1205. дои : 10.1016/j.cell.2006.04.038 . ISSN   0092-8674 . ПМИД   16777607 . S2CID   6485745 .
    7. ^ Маркс, Вивьен (01 марта 2017 г.). «Барт Депланке» . Природные методы . 14 (3): 211. doi : 10.1038/nmeth.4188 . ISSN   1548-7105 . S2CID   45038650 .
    8. ^ Флегель, Сильви. «Депланке Барт» . www.sib.swiss . Проверено 2 сентября 2020 г.
    9. ^ «Динамики – НРРН» . Nuclearreceptorresearchnetwork.org . Проверено 2 сентября 2020 г.
    10. ^ Губельманн, Карин; Швали, Петра С; Рагхав, Сунил К; Рёдер, Ева; Делесса, Тенань; Кильманн, Эльке; Васак, Себастьян М; Корсинотти, Андреа; Удин, Жиль; Холкомб, Вибке; Рудофски, Готфрид (27 августа 2014 г.). Тонтоноз, Питер (ред.). «Идентификация транскрипционного фактора ZEB1 как центрального компонента регуляторной сети адипогенных генов» . электронная жизнь . 3 : e03346. дои : 10.7554/eLife.03346 . ISSN   2050-084X . ПМЦ   4359378 . ПМИД   25163748 .
    11. ^ Чен, Ванце; Швали, Петра К.; Панкевич Евгения Владимировна; Губельманн, Карин; Рагхав, Сунил К.; Дайнезе, Риккардо; Кассано, Марко; Имбо, Майкл; Чан, Сок Мин; Рассел, Джули; Делесса, Тенань (18 апреля 2019 г.). «ZFP30 способствует адипогенезу посредством KAP1-опосредованной активации энхансера Pparg2, полученного из ретротранспозона» . Природные коммуникации . 10 (1): 1809. Бибкод : 2019NatCo..10.1809C . дои : 10.1038/s41467-019-09803-9 . ISSN   2041-1723 . ПМК   6472429 . ПМИД   31000713 .
    12. ^ Рагхав, Сунил К.; Васак, Себастьян М.; Криер, Ирина; Губельманн, Карин; Исакова, Алина; Миккельсен, Тарьей С.; Депланке, Барт (11 мая 2012 г.). «Интегративная геномика идентифицирует корепрессор SMRT как хранителя адипогенеза посредством факторов транскрипции C/EBPβ и KAISO» . Молекулярная клетка . 46 (3): 335–350. doi : 10.1016/j.molcel.2012.03.017 . ISSN   1097-2765 . ПМИД   22521691 .
    13. ^ Дови, Дана (21 июня 2018 г.). «Ученые, возможно, придумали, как не дать людям толстеть» . Newsweek . Проверено 2 сентября 2020 г.
    14. ^ Швали, Петра К.; Донг, Хуа; Захара, Магда; Рассел, Джули; Альперн, Дэниел; Акчиче, Нассила; Капрара, Кристиан; Сунь, Вэньфэй; Шлаудрафф, Кай-Уве; Солдати, Джанни; Вольфрум, Кристиан (июль 2018 г.). «Популяция стромальных клеток, которая ингибирует адипогенез в жировых отложениях млекопитающих» . Природа . 559 (7712): 103–108. Бибкод : 2018Natur.559..103S . дои : 10.1038/s41586-018-0226-8 . ISSN   1476-4687 . ПМИД   29925944 . S2CID   49348518 .
    15. ^ Килпинен, Хелена; Васак, Себастьян М.; Гшвинд, Андреас Р.; Рагхав, Сунил К.; Витвицкий, Роберт М.; Ориоли, Андреа; Мильявакка, Евгения; Видеркер, Михаэль; Гутьеррес-Арселус, Мария; Панусис, Николаос И.; Юровский, Алиса (08.11.2013). «Координированные эффекты изменения последовательностей на связывание ДНК, структуру хроматина и транскрипцию» . Наука . 342 (6159): 744–747. Бибкод : 2013Sci...342..744K . дои : 10.1126/science.1242463 . ISSN   1095-9203 . ПМК   5502466 . ПМИД   24136355 .
    16. ^ Васак, Себастьян М.; Делано, Оливье; Гшвинд, Андреас Р.; Килпинен, Хелена; Рагхав, Сунил К.; Витвицкий, Роберт М.; Ориоли, Андреа; Видеркер, Михаэль; Панусис, Николаос И.; Юровский, Алиса; Романо-Палумбо, Лусиана (27 августа 2015 г.). «Популяционная изменчивость и генетический контроль модульной архитектуры хроматина у человека» . Клетка . 162 (5): 1039–1050. дои : 10.1016/j.cell.2015.08.001 . ISSN   0092-8674 . ПМИД   26300124 . S2CID   16537629 .
    17. ^ Депланке, Барт; Альперн, Дэниел; Гардо, Винсент (28 июля 2016 г.). «Генетика вариаций связывания ДНК с фактором транскрипции» . Клетка . 166 (3): 538–554. дои : 10.1016/j.cell.2016.07.012 . ISSN   0092-8674 . ПМИД   27471964 . S2CID   8237138 .
    18. ^ Хуан, Вэнь; Массурас, Андреас; Иноуэ, Ютака; Пайффер, Джейсон; Рамия, Микель; Тарон, Аарон М.; Турлапати, Лаванья; Зихнер, Томас; Чжу, Дяньхуэй; Лайман, Ричард Ф.; Магвайр, Майкл М. (01 июля 2014 г.). «Естественные вариации в архитектуре генома среди 205 линий Drosophila melanogaster Genetic Reference Panel» . Геномные исследования . 24 (7): 1193–1208. дои : 10.1101/гр.171546.113 . ISSN   1088-9051 . ПМК   4079974 . ПМИД   24714809 .
    19. ^ Беверс, Роул П.Дж.; Литовченко Мария; Капопулу, Адамандиа; Браман, Вирджиния С.; Робинсон, Мэтью Р.; Ауверкс, Йохан; Холлис, Брайан; Депланке, Барт (декабрь 2019 г.). «Митохондриальные гаплотипы влияют на метаболические фенотипы в Справочной генетической панели дрозофилы» . Природный метаболизм . 1 (12): 1226–1242. дои : 10.1038/s42255-019-0147-3 . ISSN   2522-5812 . ПМИД   32694676 . S2CID   209162535 .
    20. ^ Бу Сулейман, Марун С.; Осман, Дэни; Массурас, Андреас; Хоффманн, Ари А.; Леметр, Бруно; Депланке, Барт (27 июля 2015 г.). «Генетические, молекулярные и физиологические основы вариаций иммунокомпетентности кишечника дрозофилы» . Природные коммуникации . 6 (1): 7829. Бибкод : 2015NatCo...6.7829B . дои : 10.1038/ncomms8829 . ISSN   2041-1723 . ПМЦ   4525169 . ПМИД   26213329 .
    21. ^ Фрошо, Майкл В.; Бу Сулейман, Марун; Гардо, Винсент; Дайнезе, Риккардо; Холлис, Брайан; Литовченко Мария; Браман, Вирджиния С.; Андреани, Томмазо; Осман, Дэни; Депланке, Барт (17 января 2020 г.). «цис-регуляторные вариации модулируют восприимчивость к кишечным инфекциям в генетической эталонной панели дрозофилы» . Геномная биология . 21 (1): 6. дои : 10.1186/s13059-019-1912-z . ISSN   1474-760X . ПМК   6966807 . ПМИД   31948474 .
    22. ^ Бу Сулейман, Марун; Фрошо, Майкл Винсент; Андреани, Томмазо; Осман, Дэни; Гиго, Родерик; Депланке, Барт (17 января 2020 г.). «Кишечная инфекция вызывает опосредованную Жаворонками задержку интронов на 5'-конце генов дрозофилы» . Геномная биология . 21 (1): 4. дои : 10.1186/s13059-019-1918-6 . ISSN   1474-760X . ПМК   6966827 . ПМИД   31948480 .
    23. ^ «Agilent завершает приобретение компании Genohm» . www.agilent.com . Проверено 23 февраля 2021 г.
    24. ^ «Барт Депланке (руководитель)» . ЭНГПАТИЯ . Проверено 23 февраля 2021 г.
    25. ^ Хичкок, Имоджен (19 января 2021 г.). «Составление карты будущего открытия лекарств с помощью анализа экспрессии генов» . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
    26. ^ «Алитея Дженомикс С.А.» . www.venturekick.ch . Проверено 23 февраля 2021 г.
    27. ^ «Награды и похвалы ASNS» (PDF) . Питание сегодня . 40 : 98. Июнь 2005.
    28. ^ «Исследовательский совет SNSF: избрано шесть новых членов – SNF» . www.snf.ch. ​Проверено 2 сентября 2020 г.
    [ редактировать ]
    Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Bart_Deplancke&oldid=1216040520"
    Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
    Arc.Ask3.Ru
    Номер скриншота №: 03a10560cb7c08a81e6347e52891b6f8__1711637040
    URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/03/f8/03a10560cb7c08a81e6347e52891b6f8.html
    Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
    Bart Deplancke - Wikipedia
    Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)