БакМет
| Содержание | |
|---|---|
| Типы данных захвачен | устойчивости к противомикробным препаратам Гены и фенотипы |
| Организмы | Бактерии |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Университет Гетеборга |
| Первичное цитирование | ПМИД 24304895 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | бакмет |
| URL-адрес загрузки | Скачать |
| Разнообразный | |
| Добавить в закладки сущности | да |
BacMet — это база данных по устойчивости к противомикробным препаратам . Он отслеживает бактериальные гены , которые обеспечивают устойчивость к антибактериальным биоцидам и металлам . [1]
BacMet состоит из двух внутренних баз данных. Одна представляет собой базу данных генов, курируемую вручную, с экспериментально подтвержденной функцией устойчивости, а другая база данных рассматривает прогнозируемые гены устойчивости. Данные первого собраны из NCBI, а аннотации взяты из UniProt и Gene Ontology. [2] BacMet предоставляет информацию об устойчивых генах, их последовательностях и молекулярных функциях.
В базе данных содержится более 700 подтвержденных генов и более 150 000 предсказанных генов, которые организованы по молекулярным функциям и устойчивым фенотипам. По состоянию на май 2021 г. [update]BacMet последний раз обновлялся в марте 2018 года и базируется в Гетеборгском университете в Швеции.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Пал, К.; Бенгтссон-Пальме, Дж.; Ренсинг, К.; Кристианссон, Э.; Ларссон, генеральный директор (2014). «BacMet: база данных генов устойчивости к антибактериальным биоцидам и металлам» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Проблема с базой данных) (Проблема с базой данных): D737–D743. дои : 10.1093/нар/gkt1252 . ПМЦ 3965030 . ПМИД 24304895 .
- ^ Блейк, Дж.А.; и др. (2013). «Аннотации и ресурсы онтологии генов» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (Проблема с базой данных) (Проблема с базой данных): D530–D535. дои : 10.1093/nar/gks1050 . ПМК 3531070 . ПМИД 23161678 .