Джон Мариони
Джон Мариони | |
|---|---|
| Альма-матер | Кембриджский университет |
| Научная карьера | |
| Поля | Вычислительная биология Генетика человека одноклеточная биология |
| Учреждения | Чикагский университет Кембриджский университет |
| Диссертация | Статистические методы для экспериментов с arrayCGH и изменением числа копий [ 1 ] (2007) |
| Докторантура | Симон Таваре |
Джон Мариони — старший вице-президент и руководитель отдела вычислений в компании Genentech Research and Early Development (gRED) в Южном Сан-Франциско. [ 2 ] Ранее он был руководителем исследований в Европейском институте биоинформатики и занимал должности в Институте Уэлкома Сэнгера и Кембриджском институте исследований рака Великобритании в Кембриджском университете . [ 3 ] Он — компьютерный биолог, известный своими исследованиями статистических и вычислительных методов анализа данных геномики, в частности биологии отдельных клеток и эволюционной геномики. Он продолжает быть сопредседателем рабочей группы по анализу Атласа клеток человека . [ 4 ]
Исследования и карьера
[ редактировать ]Мариони провел влиятельные исследования в области транскриптомики целых тканей и отдельных клеток . [ 5 ] Он получил докторскую степень по прикладной математике в Кембриджском университете в 2008 году. Он провел постдокторантуру в Чикагском университете под руководством Мэтью Стивенса . [ 6 ] [ 7 ]
Мариони известен как «новатор в статистическом анализе закономерностей экспрессии генов в отдельных клетках, что привело к радикальному сдвигу парадигмы в области транскриптомики». [ 8 ]
Награды и почести
[ редактировать ]- Blavatnik Awards Молодым ученым 2021 Финалист премии Соединенного Королевства [ 8 ]
- Избранный член Колледжа Святого Эдмунда, Кембридж (2016 г.)
- Премия Джона Уишарта в области статистики, присуждаемая Статистической лабораторией Кембриджского университета (2004 г.)
Выберите публикации
[ редактировать ]- Р. Аргелагет, С. Дж. Кларк, Х. Мохаммед и др., Дж. К. Мариони, В. Рейк. Мультиомное профилирование гаструляции мышей при разрешении отдельных клеток. Природа . doi:10.1038/s41586-019-1825-8
- Л. Хагверди, АТЛ Лун, МД Морган, Дж. К. Мариони. Пакетные эффекты в данных секвенирования одноклеточной РНК корректируются путем сопоставления взаимных ближайших соседей. Природная биотехнология . doi:10.1038/nbt.4091
- Б. Пиджуан-Сала, Дж. А. Гриффитс, С. Гибентиф и др., Дж. К. Мариони, Б. Геттгенс. Одноклеточная молекулярная карта гаструляции и раннего органогенеза мыши. Природа . doi:10.1038/s41586-019-0933-9
- Т. Лохофф, С. Газанфар, А. Миссарова, Н. Кулена, Н. Пирсон, Дж. А. Гриффитс, Э. С. Бардо, К. Л. Энг, RCV Тайзер, Р. Аргелагет, К. Гибентиф, С. Шринивас, Дж. Бриско, Б. Д. Симонс, А. К. Хаджантонакис, Б. Геттгенс, В. Рейк , Дж. Николс, Л. Кай, Дж. К. Мариони. Интеграция пространственных и одноклеточных транскриптомных данных проясняет органогенез мышей. Природная биотехнология . doi:10.1038/s41587-021-01006-2
- Р. Аргелаге, АСЕ Куомо, О Стегле, Х. К. Мариони. Вычислительные принципы и проблемы интеграции одноклеточных данных. Природная биотехнология . doi:10.1038/s41587-021-00895-7 .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Джон Мариони» . Проект математической генеалогии . Проверено 5 января 2022 г.
- ^ Институт европейской биоинформатики EMBL. «Джон Мариони, посетитель | Люди | Европейский институт биоинформатики EMBL» . www.ebi.ac.uk. Проверено 12 августа 2024 г.
- ^ «Мариони Групп» . Исследования рака, Великобритания, Кембриджский институт . Проверено 5 января 2022 г.
- ^ «Рабочие группы по Атласу клеток человека» . www.humancellatlas.org . Проверено 5 января 2022 г.
- ^ «Публикации Джона Мариони, проиндексированные Google Scholar» . ученый.google.com . Проверено 5 января 2022 г.
- ^ Институт европейской биоинформатики EMBL. «Джон Мариони, посетитель | Люди | Европейский институт биоинформатики EMBL» . www.ebi.ac.uk. Проверено 7 декабря 2023 г.
- ^ Клеточные симпозиумы | Спикер | Джон Мариони, Европейский институт биоинформатики EMBL, Великобритания
- ^ Jump up to: а б «Финалист премии Великобритании 2021 года» . blavatnikawards.org . Проверено 5 января 2022 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Публикации Джона Мариони, проиндексированные Google Scholar
| Международный | |
|---|---|
| Национальный | |
| академики | |
