Гетеротахия
Гетеротахия относится к изменениям скорости эволюции, специфичной для линии, с течением времени. В области молекулярной эволюции принцип гетеротахии гласит, что скорость замены участков в гене может меняться со временем. [ 1 ] Было высказано предположение, что позиции, которые показывают изменение скорости замещения с течением времени (то есть гетеротахозные сайты), являются хорошими индикаторами функциональной дивергенции. Однако оказывается, что гетеротахия представляет собой гораздо более общий процесс, поскольку большинство вариабельных участков гомологичных белков без признаков функционального сдвига являются гетеротахическими.
Гипотеза коварионов представляет собой специфическую форму гетеротахии. В некоторых исследованиях были предложены модели функциональной дивергенции, которые также являются гетеротахическими. Кроме того, некоторые модели смеси , которые явно не учитывают сдвиг скоростей, но разделы сайтов, развивающиеся с разными относительными скоростями замещения в разных линиях, математически гетеротахичны.
Неучет гетеротахии в филогенетических реконструкциях может привести к построению неправильных филогенетических деревьев . Таким образом, Чжун и др. (2011) говорят, что гетеротахия является одной из причин изменчивости реконструкций происхождения гнетофитов . [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Лопес П., Казане Д., Филипп Х. (январь 2002 г.). «Гетеротахия, важный процесс эволюции белка» . Мол. Биол. Эвол . 19 (1): 1–7. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003973 . ПМИД 11752184 .
- ^ Чжун, Боцзянь; Оливер Дойш; Вадим Владимирович Горемыкин; Дэвид Пенни; Патрик Дж. Биггс; Робин А. Атертон; Светлана Владимировна Никифорова; Питер Джеймс Локхарт (2011). «Систематическая ошибка в филогеномике семенных растений» . Геномная биология и эволюция . 3 : 1340–1348. дои : 10.1093/gbe/evr105 . ПМЦ 3237385 . ПМИД 22016337 .