Нудикс -гидролаза
| Нудикс | |||
|---|---|---|---|
 Структура MT-Adprase, нудикс-гидролаза из Mycobacterium tuberculosis | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Нудикс | ||
| Pfam | PF00293 | ||
| PFAM клан | CL0261 | ||
| Эко | 221.4.1 | ||
| InterPro | IPR000086 | ||
| |||
| Nudix-подобный | |||
|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура пирофосфатазы NADH (1790429) из Escherichia coli K12 при 2,20 A Resolution | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Nudix-подобный | ||
| Pfam | PF09296 | ||
| PFAM клан | CL0261 | ||
| InterPro | IPR015375 | ||
| Краткое содержание | 1vk6 / scope / supfam | ||
| |||
Nudix -гидролазы представляют собой суперсемейство гидролитических ферментов, способных расщеплять Nu -Cleoside Diposhates , связанные с X (любые части), отсюда и их имя. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] Реакция дает нуклеозидный монофосфат (NMP) плюс XP. Субстраты, гидролизированные нудиксными ферментами, составляют широкий спектр органических пирофосфатов, включая ди- и трифосфаты нуклеозидов, динуклеозид и полифосфаты дифосфоинозитол, нуклеотидные сахары и крышки РНК, с различными градусами субстратной специфичности. [ 3 ] Ферменты суперсемейства Nudix встречаются во всех типах организмов, включая эукариоты, бактерии и археи. [ 3 ]
Есть два компонента в семействе Nudix: так называемая складка Nudix бета-листа с альфа-спиралями с каждой стороны и мотив Nudix, который содержит каталитические и металлические аминокислоты . Мотивом Nudix является gxxxxxxxxxxxxreuxeexgu, где u изолецин, лейцин или валин, а x - любая аминокислота. Это образует короткую спираль, которая (обычно) содержит каталитические аминокислоты. Гидролазы Nudix включают DCP2 комплекса декорации , дифхосфатазу ADP-рибозы , Mutt, Adprase, AP4A-гидролазы, RPPH и многие другие. [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Bessman MJ, Frick DN, O'handley SF (октябрь 1996 г.). «Белки матта или гидролазы« Нудикс », семейство универсальных, широко распределенных,« ферменты на уборке » . Дж. Биол. Химический 271 (41): 25059–62. doi : 10.1074/jbc.271.41.25059 . PMID 8810257 .
- ^ Mildvan AS, Xia Z, Azurmendi HF, et al. (Январь 2005 г.). «Структуры и механизмы нудикс -гидролаз». Архи Биохимия. Биофиз . 433 (1): 129–43. doi : 10.1016/j.abb.2004.08.017 . PMID 15581572 .
- ^ Jump up to: а беременный в McLennan AG (январь 2006 г.). «Суперсемейство нудикс -гидролазы» . Клетка. Мол Life Sci . 63 (2): 123–43. doi : 10.1007/s00018-005-5386-7 . PMC 11136074 . PMID 16378245 . S2CID 30202446 .
- ^ Carreras-Pigvert, Jordi; Зитник, Маринка; Джемт, Энн-Софи; Картер, Меган; Unterlass, Джудит Э.; Hallström, Björn; Loseva, Olga; Карем, Чжир; Кальдерон-Монтаньо, Хосе Мануэль; Линдског, Сесилия; Edqvist, Per-Henrik (2017-11-16). «В комплексном упущении, биохимическое и биологическое профилирование семейства нудикс -гидролаз» . Природная связь . 8 (1): 1541. Bibcode : 2017natco ... 8.1541c . Doi : 10.1038/s41467-017-01642-w . ISSN 2041-1723 . PMC 5688067 . PMID 29142246 .
- ^ Милдван, как; Xia, Z.; Азурменди, HF; Сарасват, В.; Леглер, премьер -министр; Массия, Массачусетс; Габелли, SB; Бьянка, Массачусетс; и др. (2005). «Структуры и механизмы нудикс -гидролаз». Архивы биохимии и биофизики . 433 (1): 129–143. doi : 10.1016/j.abb.2004.08.017 . PMID 15581572 .