База данных Домин
 | |
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | всеобъемлющий набор известных и прогнозируемых взаимодействий между доменами. |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Национальный институт наук о гигиене окружающей среды , Национальные институты здравоохранения |
| Лаборатория | Системная биология |
| Первичное цитирование | Йеллабойна и др. (2011) [1] |
| Дата выпуска | 2010 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | https://manticore.niehs.nih.gov/domine |
DOMINE — это база данных известных и предсказанных взаимодействий белковых доменов (или взаимодействий домен-домен). [1] Он содержит взаимодействия, наблюдаемые в кристаллических структурах PDB , а также взаимодействия, предсказанные несколькими вычислительными подходами. DOMINE использует профили Pfam HMM для определения доменов белков . База данных DOMINE содержит 26 219 взаимодействий между 5 410 доменами ), включая 6 634 известных взаимодействия, выведенных из структурных данных PDB .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Йеллабойна; и др. (январь 2011 г.). «DOMINE: всеобъемлющий сборник известных и прогнозируемых домен-доменных взаимодействий» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных). Англия: D730-5. дои : 10.1093/нар/gkq1229 . ПМК 3013741 . ПМИД 21113022 .