МАВИД
 | Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( март 2020 г. ) |
| Разработчик(и) | Николас Брэй ( Калифорнийский университет в Беркли ), Лиор Пэчтер ( Калифорнийский университет в Беркли ) |
|---|---|
| Стабильная версия | 2.0.4
|
| Операционная система | UNIX , Linux , Mac |
| Тип | Инструмент биоинформатики |
| Лицензия | Открытый исходный код |
| Веб-сайт | МАВИД скачать |
MAVID — это программа выравнивания множественных последовательностей, подходящая для выравнивания большого количества последовательностей ДНК. [ 1 ] [ 2 ] Последовательности могут представлять собой небольшие митохондриальные геномы или большие геномные области длиной до мегабаз. Последняя версия — 2.0.4.
Программу можно использовать через веб-сервер MAVID или как отдельную программу, которую можно установить вместе с исходным кодом.
Ввод/вывод
[ редактировать ]Эта программа принимает последовательности в формате FASTA .
Выходной формат включает в себя: формат FASTA , Clustal , PHYLIP .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дьюи, Колин Н. (2007), «Согласование нескольких целых геномов с помощью Меркатора и MAVID», в книге Бергмана, Николаса Х. (ред.), Сравнительная геномика , методы молекулярной биологии, том. 395, Humana Press, стр. 221–235, номер документа : 10.1007/978-1-59745-514-5_14 , ISBN. 978-1-58829-693-1 , PMID 17993677
- ^ Брей, Николас; Пахтер, Лиор (1 июля 2003 г.). «Сервер множественного выравнивания MAVID» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (13): 3525–3526. дои : 10.1093/нар/gkg623 . ISSN 0305-1048 . ПМК 169029 . ПМИД 12824358 .
- Брей, Н.; Пахтер, Л. (2004), «MAVID: Ограниченное наследственное выравнивание множественных последовательностей», Genome Research , 14 (4): 693–699, arXiv : q-bio/0311018 , doi : 10.1101/gr.1960404 , PMC 383315 , ПМИД 15060012 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]  | Эта статья, посвященная биоинформатике, незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |