Теллур ионной устойчивость
Семейство ионов теллуриума (TERC) ( TC# 2.A.109 ) является частью суперсемейства экспортера лизина (LYSE) . Репрезентативный список белков, принадлежащих к семейству TERC, можно найти в базе данных классификации Transporter . [ 1 ]
Перевод
[ редактировать ]Семейство TERC ( PFAM 03741 ) включает в себя белок E.coli Terc ( TC# 2.A.109.1.1 ), который был вовлечен в устойчивость к теллуриуму. [ 2 ] Предполагается, что он катализирует отток ионов теллуриума. [ 2 ] [ 3 ] TERC кодируется плазмидой PTE53 из клинического изолята E. coli. Он имеет 346 амино ацильных остатков (AAS) и 9 предполагаемых трансмембранных сегментов (TMS) с большой гидрофильной петлей между TMS 5 и 6. [ 2 ]
Гомолог в Arabidopsis thaliana ( TC# 9.A.30.2.1 ) может функционировать в биогенизах протилакоидной мембраны во время раннего развития хлоропластов. [ 4 ] Он имеет 384 AAS и 7-8 предполагаемых TMS. В E. coli Terc образует мембранную комплекс с Terb, а также DCTA, PSPA, HSLU и RPLK. Комплекс Terb/Terc может связывать различные функциональные модули с биохимической активностью транспорта C4-дикарбоксилата, реакцией внутренней мембраны (регуляторный комплекс белка фагора), активность АТФазы/шаперона и протеосинтез. [ 5 ] Это может быть частью системы реагирования на напряжение металла. [ 6 ] Совместное существование TERC и TERE, но не TERF коррелирует с устойчивостью к теллуриту, когда анализировали несколько сотен бактериальных штаммов. [ 7 ]
Функция
[ редактировать ]Реакция, предложенная для катализирована TERC, составляет:
ионы теллуриума (в) → ионы теллуриума (Out).
Смотрите также
[ редактировать ]Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Тейлор, Де (1999). «Бактериальная резистентность к теллуриту». Тенденции в микробиологии . 7 (3): 111–115. doi : 10.1016/s0966-842x (99) 01454-7 . PMID 10203839 .
- Казанов, MD; Vitreschak, Ag; Гелфанд, MS (2007). «Изобилие и функциональное разнообразие рибосвитч в микробных сообществах» . BMC Genomics . 8 : 347. DOI : 10.1186/1471-2164-8-347 . PMC 2211319 . PMID 17908319 .
- Kwon, KC; Чо, MH (2008). «Удаление гена-хлоропласта-локализованного гена Atterc у Arabidopsis thaliana приводит к потере тилакоидной мембраны и к летальности рассады» . Растение J. 55 (3): 428–442. doi : 10.1111/j.1365-313X.2008.03523.x . PMID 18429937 .
- Мейер, мм; Хаммонд, MC; Salinas, y.; Рот, А.; Sudarsan, N.; Breaker, RR (2011). «Проблемы идентификации лиганда для кандидатов на рибосвич» . РНК биол . 8 (1): 5–10. doi : 10.4161/rna.8.1.13865 . PMC 3142362 . PMID 21317561 .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «2.A.109 Семейство ионов Теллуриума (TERC)» . База данных классификации Transporter . Получено 2016-02-26 .
- ^ Jump up to: а беременный в Burian, J.; TU, N.; Kl'ucár, L.; Guller, L.; Ллойд-Джонс, Г.; Stuchlík, S.; Fejdi, P.; Siekel, P.; Turna, J. (1998-01-01). «Клонирование in vivo и in vitro и характеристика фенотипа детерминанта резистентности теллурит, предоставляемой плазмидой PTE53 клинического изолята Escherichia coli». Folia Microbiologica . 43 (6): 589–599. doi : 10.1007/bf02816374 . ISSN 0015-5632 . PMID 10069007 . S2CID 44237747 .
- ^ Kormutakova, R.; Klucar, L.; Turna, J. (2000-06-01). «Анализ последовательности ДНК детерминант резистентности к теллуритам из клинического штамма Escherichia coli и идентификации важных генов». Биометалы . 13 (2): 135–139. doi : 10.1023/a: 1009272122989 . ISSN 0966-0844 . PMID 11016400 . S2CID 22672098 .
- ^ Квон, Кван-Чул; Чо, Мион Хаенг (2008-08-01). «Удаление гена-хлоропласта-локализованного гена Atterc у Arabidopsis thaliana приводит к потере тилакоидной мембраны и к летальности рассады» . Заводский журнал . 55 (3): 428–442. doi : 10.1111/j.1365-313X.2008.03523.x . ISSN 1365-313X . PMID 18429937 .
- ^ Turkovicova, L.; Smidak, R.; Юнг, Г.; Turna, J.; Lubec, G.; Aradska, J. (2016-01-09). «Протеомный анализ TERC Interactome: новые связи с устойчивостью и патогенности теллурита». Журнал протеомики . 136 : 167–73. doi : 10.1016/j.jprot.2016.01.003 . ISSN 1876-7737 . PMID 26778143 .
- ^ Анантараман, Вивек; Iyer, Lakshminarayan M.; Aravind, L. (2012-10-30). «ТЕР-зависимые системы реакции на стресс: новые пути, связанные с чувствительным к металлу, производство нуклеозидного метаболита и обработка ДНК» . Молекулярные биосистемы . 8 (12): 3142–3165. doi : 10.1039/c2mb25239b . ISSN 1742-2051 . PMC 4104200 . PMID 23044854 .
- ^ ОРТ, Доротея; Гриф, Катарина; Диерич, Манфред П.; Вюрцнер, Рейнхард (2007-03-01). «Изменчивость устойчивости теллурита и кластера генов TER среди токсинов Shiga, продуцирующей Escherichia coli, выделенную от людей, животных и пищи» . Исследования в области микробиологии . 158 (2): 105–111. doi : 10.1016/j.resmic.2006.10.007 . ISSN 0923-2508 . PMID 17317110 .