Карин А. Гиббс
Карин А. Гиббс | |
---|---|
Рожденный | Спаниш-Таун , Ямайка |
Национальность | Американский |
Альма-матер | Гарвардский университет Стэнфордский университет Вашингтонский университет |
Известный | Исследование самопознания у Proteus mirabilis |
Награды | 100 вдохновляющих чернокожих ученых в Америке по версии CellPress, стипендии Джорджа Мерка, стипендии Фонда Дэвида и Люсиль Паккард |
Научная карьера | |
Поля | Микробиология |
Учреждения | Гарвардский университет Калифорнийский университет, Беркли |
Карин Гиббс — американский микробиолог и иммунолог ямайского происхождения, доцент кафедры биологии растений и микробов Калифорнийского университета в Беркли . Исследования Гиббса объединяют области социомикробиологии и биологии бактериальных клеток, чтобы изучить, как бактериальный патоген Proteus mirabilis , распространенная кишечная бактерия, которая может стать патогенной и вызвать инфекции мочевыводящих путей, идентифицирует себя и чужого. В 2013 году Гиббс и ее команда первыми секвенировали геном P. mirabilis BB2000, модельного организма для изучения самопознания. В аспирантуре Стэнфордского университета Гиббс помог разработать новый инструмент, который позволял визуализировать движение белков бактериальной мембраны в реальном времени. признало Гиббса В 2020 году издание Cell Press одним из 100 лучших вдохновляющих чернокожих ученых Америки.
Ранняя жизнь и образование
[ редактировать ]Гиббс родился на Ямайке . [ 1 ] Когда она была ребенком, ее семья переехала в Балтимор, штат Мэриленд , где она училась в средней и старшей школе. [ 2 ] В старшей школе Гиббс занималась легкой атлетикой, как и ее родители, когда учились в старшей школе. [ 3 ] В дополнение к своим спортивным занятиям Гиббс также использовала исследовательские возможности в старшей школе. Она прошла летнюю исследовательскую стажировку в Университете Вилланова и две летние стажировки в Медицинском научно-исследовательском институте инфекционных заболеваний армии США по изучению вирусов. [ 2 ]
В 1996 году Гиббс получила степень бакалавра в Гарвардском университете, интересовавшись изучением микроорганизмов. [ 4 ] проводил исследования Гиббс специализировался в области биохимических наук и вместе с Роберто Колтером в Гарвардской медицинской школе, изучая биопленки на имплантатах и медицинских устройствах. [ 5 ] Она стала вторым автором статьи, посвященной роли доступности питательных веществ в формировании биопленок. [ 6 ] Она обнаружила, что белок, контролирующий репрессию катаболитов, который регулирует углеродный обмен, необходим для образования биопленок у Pseudomonas aeruginosa. [ 6 ] В дополнение к своим исследованиям Гиббс преподавала естественные науки ученикам начальной и средней школы во время учебы на бакалавриате. [ 2 ]
После окончания Гарварда в 2000 году Гиббс поступила в Стэнфордский университет для обучения в аспирантуре по микробиологии и иммунологии. [ 7 ] Под руководством Джули Териот Гиббс исследовал движение поверхностных белков внутри бактериальных мембран и на поверхностных стенках бактерий. [ 8 ] Во время работы над докторской диссертацией Гиббс сотрудничала с двумя другими лабораториями в Стэнфорде, чтобы разработать новый инструмент для маркировки поверхностных белков бактерий, пока они живы, чтобы обеспечить визуализацию движения белков внутри мембраны на протяжении всего жизненного цикла микробов. [ 5 ] Ее инструмент сегодня используется во многих лабораториях по всему миру. [ 5 ] В ее дипломной работе этот инструмент использовался для изучения динамического распределения LamB, интегрального белка внешней мембраны E. coli, который отвечает за поглощение мальтозы и прикрепление бактериофагов. [ 9 ] Она обнаружила две популяции белка LamB: одну с ограниченной подвижностью, а другую с высокой подвижностью в мембране. [ 9 ]
После завершения аспирантуры в Стэнфорде в 2005 году Гиббс продолжила постдокторскую работу на кафедре микробиологии Вашингтонского университета в Сиэтле, штат Вашингтон. [ 5 ] Ее наставником был Э. Питер Гринберг, и она начала изучать бактерии Proteus mirabilis, образующие биопленки. [ 5 ] P. mirabilis образует биопленки на мочевых катетерах, что приводит к инфекциям, часто устойчивым ко многим антибиотикам. [ 5 ] Гиббс начала исследовать гены самораспознавания, которые, по ее гипотезе, привели к способности P. mirabilis образовывать четкие границы между клетками разных штаммов. [ 5 ] Изучение способности бактерий определять свое и чужое является очень элементарной формой способности иммунных клеток млекопитающих обнаруживать свое и чужое, и, таким образом, работа Гиббса прольет свет на вопросы, которые касаются человека как человека. а также бактерии. [ 5 ] Таким образом, Гиббс в своем постдоке исследовала набор мутантов P. mirabilis, которые образовывали границы между собой и родительским штаммом, таким образом, эта мутация лишила бактерии возможности эффективно определять свое и чужое. Она сопоставила локусы этих мутаций с локусом из шести генов, который она назвала Ids для идентификации себя. [ 10 ] Позже она обнаружила, что гены Ids транскрибируются как оперон, и определила местонахождение промоторной области оперона. [ 10 ] Когда стаи чужеродных бактерий приближались к популяции P. mirabilis, экспрессия оперона ids увеличивалась. [ 10 ]
Карьера и исследования
[ редактировать ]В 2010 году Гиббс был принят на работу в Гарвардский университет и назначен доцентом кафедры молекулярной и клеточной биологии на кафедре молекулярной и клеточной биологии. [ 11 ] В 2015 году Гиббс получил звание доцента. [ 12 ] Гиббс страстно желала преподавать еще со студенческих лет. [ 5 ] и таким образом преподает два курса в Гарварде: «Микробы» и «Социальное поведение и генетика бактерий». [ 13 ] Гиббс также является главным исследователем Лаборатории Гиббса, где она продолжает изучать социальное поведение бактерии P. mirabilis, уделяя особое внимание тому, как клетки определяют свое и чужое. [ 13 ] Ее лаборатория использует генетические методы, чтобы использовать простоту P. mirabilis для понимания биологических субстратов межклеточной коммуникации, конкуренции и сотрудничества. [ 14 ] Кроме того, Гиббс сотрудничает с междисциплинарными группами Гарварда для изучения механизмов патогенеза P. mirabilis, поскольку он безвреден в кишечнике, но может распространяться в почках и образовывать биопленки на мочевых катетерах, вызывая инфекцию и заболевание. [ 15 ] Гиббс также является редактором журнала eLife в области микробных и инфекционных заболеваний. [ 16 ]
Гиббс был назначен доцентом Калифорнийского университета в Беркли в 2021 году. [ 17 ]
Клеточное самораспознавание против несамостоятельного распознавания
[ редактировать ]В 2013 году Гиббс и ее коллеги из Гарварда первыми секвенировали полный геном штамма BB2000 Proteus mirabilis, который является модельной системой для биологического анализа самопознания. [ 18 ] Затем Гиббс и ее коллеги начали исследовать биологические механизмы самораспознавания у P. mirabilis. [ 19 ] Она обнаружила, что IdsD и IdsE, два белка, экспрессируемые генами оперона Ids, по-видимому, кодируют детерминант штаммоспецифической идентичности P. mirabilis и управляют социальностью внутри штаммов бактерии. [ 19 ] Позже Гиббс и ее команда обнаружили, что белки IdsD и IdsE происходят из разных клеток одного и того же штамма, что обеспечивает связь между клетками одного и того же штамма и указывает на родство. [ 20 ]
Благодаря своему опыту в изучении P. mirabilis, Гиббс также помогла коллегам в своей области, опубликовав методы использования этой бактерии для анализа механизмов, лежащих в основе расширения роя, формирования границ и территориального исключения. [ 21 ]
Награды и почести
[ редактировать ]- 2020 г. Включен в список 100 вдохновляющих чернокожих ученых Америки по версии CellPress. [ 22 ]
- Конкурс Star Family Challenge на перспективные научные исследования 2018 года [ 15 ]
- 2014 Стипендия Джорджа Мерка [ 23 ]
- 2012 Стипендия Фонда Дэвида и Люсиль Паккард в области науки и техники [ 1 ]
- Ученый, выбранный в 2010 г. на День выдающихся выпускников, Стэнфордский университет [ 2 ]
- 2005 г. Грант Вашингтонского университета на обучение бактериальному патогенезу для постдокторантов [ 24 ]
- Премия профессора Сидни Раффела 2005 г., Стэнфордский университет [ 24 ]
- 2005 г. выбран аспирантом для выступления на церемонии вручения дипломов Стэнфордского университета. [ 3 ]
- 2002 ASM Роберт Д. Уоткинс, аспирант-исследователь по делам меньшинств [ 24 ]
Выберите публикации
[ редактировать ]- Салливан Н.Л., Септер А.Н., Филдс А.Т., Венрен Л.М. и Гиббс К.А.* 2013. Полная последовательность генома штамма BB2000 обнаруживает отличия от эталонного штамма Proteus mirabilis. Объявления о геноме 1 (5). ПМИД 24009111 . [ 13 ]
- Венрен Л.М., Салливан Н.Л., Кардарелли Л., Септер А.Н., Гиббс К.А.* 2013. Два независимых пути самораспознавания у Proteus mirabilis связаны типом VI-зависимого экспорта. mBio 4(4): e00374-13. doi:10.1128/mBio.00374-13. ПМИД 23882014 . [ 13 ]
- Гиббс, К.А., Л.М. Венрен и Е.П. Гринберг (2011) «Экспрессия гена идентичности у Proteus mirabilis». Дж. Бактериол. 193(13): 3286–3292. ПМИД 21551301 . [ 13 ]
- Гиббс К.А., М.Л. Урбановски и Е.П. Гринберг (2008) «Самоидентификация и социальное признание у бактерий». Наука. 321 (5886): 256–259. ПМИД 18621670 .М [ 13 ]
- Гиббс, К.А., Д.Д. Исаак, Дж. Сюй, Р.В. Хендрикс, Т.Дж. Силхави и Дж.А. Териот (2004) «Сложное пространственное распределение и динамика обильного белка внешней мембраны Escherichia coli, LamB». Мол. Микробиол. 53 (6): 1771–1783. ПМИД 15341654 . [ 13 ]
- Харди Дж., К.П. Фрэнсис, М. ДеБоер, П. Чу, К. Гиббс и Ч. Контаг (2004) «Внеклеточная репликация Listeria monocytogenes в желчном пузыре мышей». Наука 303 (5659): 851–853. ПМИД 14764883 . [ 13 ]
- О'Тул Г.А., Гиббс К.А., Хагер П.В., Фиббс П.В. младший, Колтер Р. Глобальный регулятор углеродного метаболизма Crc является компонентом пути передачи сигнала, необходимого для развития биопленки Pseudomonas aeruginosa. J Бактериол. 2000;182(2):425-431. doi:10.1128/jb.182.2.425-431.2000 Чаевые MJ, Гиббс К.А. Биопленки: управление стрессом для управления групповой динамикой. Курр Биол. 2020;30(7):R324-R326. doi:10.1016/j.cub.2020.02.045 [ 25 ]
- Литтл К., Гиббс К.А. Анализ социального поведения Proteus mirabilis на поверхностях. Методы Мол Биол. 2019;2021:45-59. doi:10.1007/978-1-4939-9601-8_6 [ 25 ]
- Саак CC, Гиббс К.А. Белок самоидентификации IdsD передается между клетками в роящихся колониях Proteus mirabilis. J Бактериол. 2016;198(24):3278-3286. Опубликовано 18 ноября 2016 г. doi:10.1128/JB.00402-16. [ 25 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б «Карин Гиббс из Гарвардского университета выиграла стипендию Фонда Паккарда» . Журнал чернокожих в высшем образовании . 25 октября 2012 г. Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ Jump up to: а б с д Салливан, Кэтлин Дж. (5 мая 2010 г.). «Выпускники-ученые поощряют следующее поколение продолжать жизнь в академических кругах» . Стэнфордский университет . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ Jump up to: а б «Информационный бюллетень декана» (PDF) . med.stanford.edu . 13 июня 2005 года . Проверено 17 июня 2020 г.
- ^ «Докладчик – Биология инфекций в эпоху микробиома» . www.cell-symposia.com . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я «МИКРОБНЫЙ ЗАХВАТ ЗЕМЛИ! – Гарвардский университет – Кафедра молекулярной и клеточной биологии» . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ Jump up to: а б О'Тул, Джорджия; Гиббс, Калифорния; Хагер, П.В.; Фиббс, ПВ; Колтер, Р. (январь 2000 г.). «Глобальный регулятор углеродного метаболизма Crc является компонентом пути передачи сигнала, необходимого для развития биопленок Pseudomonas aeruginosa» . Журнал бактериологии . 182 (2): 425–431. дои : 10.1128/jb.182.2.425-431.2000 . ISSN 0021-9193 . ПМК 94292 . ПМИД 10629189 .
- ^ «Карин А. Гиббс | Мысли вслух | Университет Брауна» . www.brown.edu . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ «Час кофе с профессором Карин Гиббс | Гарвардский университет — Высшая школа искусств и наук» . gsas.harvard.edu . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ Jump up to: а б Гиббс, Карин А.; Исаак, Дэниел Д.; Сюй, Цзюнь; Хендрикс, Роджер В.; Силхави, Томас Дж.; Териот, Джули А. (сентябрь 2004 г.). «Сложное пространственное распределение и динамика широко распространенного белка внешней мембраны Escherichia coli, LamB» . Молекулярная микробиология . 53 (6): 1771–1783. дои : 10.1111/j.1365-2958.2004.04242.x . ISSN 0950-382X . ПМИД 15341654 . S2CID 18956353 .
- ^ Jump up to: а б с Гиббс, Карин А.; Урбановский, Марк Л.; Гринберг, Э. Питер (11 июля 2008 г.). «Генетические детерминанты самоидентификации и социального признания у бактерий» . Наука . 321 (5886): 256–259. Бибкод : 2008Sci...321..256G . дои : 10.1126/science.1160033 . ISSN 0036-8075 . ПМК 2567286 . ПМИД 18621670 .
- ^ «КАРИН ГИББС ВЫИГРЫВАЕТ ЖЕЛАННУЮ СТИПЕНДИЮ PACKARD FOUNDATION» . Гарвардский университет – факультет молекулярной и клеточной биологии . 19 октября 2012 г. Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ ОРЦИД. «Карин Гиббс (0000-0002-1246-6401)» . orcid.org . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час «Карин Гиббс» . Гарвардский университет – факультет молекулярной и клеточной биологии . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ "Дом" . сайты.google.com . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ Jump up to: а б «Гиббс награжден звездным семейным конкурсом за многообещающее финансирование научных исследований» . Гарвардский университет – факультет молекулярной и клеточной биологии . 20 апреля 2018 г. Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ «Редакция отдела микробиологии и инфекционных болезней» . электронная жизнь . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ «Восемь женщин-преподавателей, которые берутся за новые задания» . Отчет «Женщины в академических кругах» . 4 февраля 2021 г. Проверено 28 августа 2023 г.
- ^ Салливан, Нора Л.; Септер, Алесия Н.; Филдс, Эндрю Т.; Венрен, Лариса М.; Гиббс, Карин А. (5 сентября 2013 г.). «Полная последовательность генома штамма Proteus mirabilis BB2000 выявляет отличия от эталонного штамма P. mirabilis» . Геномные объявления . 1 (5). doi : 10.1128/genomeA.00024-13 . ISSN 2169-8287 . ПМК 3764406 . ПМИД 24009111 .
- ^ Jump up to: а б Кардарелли, Лия; Саак, Кристина; Гиббс, Карин А. (9 июня 2015 г.). «Два белка образуют гетеромерный бактериальный комплекс самораспознавания, в котором переменные субдомены определяют аллель-ограниченное связывание» . мБио . 6 (3): e00251. дои : 10.1128/mBio.00251-15 . ISSN 2150-7511 . ПМЦ 4471559 . ПМИД 26060269 .
- ^ Саак, Кристина С.; Гиббс, Карин А. (15 декабря 2016 г.). «Белок самоидентификации IdsD передается между клетками в роящихся колониях Proteus mirabilis» . Журнал бактериологии . 198 (24): 3278–3286. дои : 10.1128/JB.00402-16 . ISSN 1098-5530 . ПМК 5116931 . ПМИД 27672195 .
- ^ Литтл, Кристин; Гиббс, Карин А. (2019). «Анализ социального поведения Proteus mirabilis на поверхностях» . Протей мирабилис . Методы молекулярной биологии. Том. 2021. стр. 45–59. дои : 10.1007/978-1-4939-9601-8_6 . ISBN 978-1-4939-9600-1 . ISSN 1940-6029 . ПМИД 31309495 . S2CID 196811022 .
- ^ Хинтон, Антентор О. младший «100 вдохновляющих чернокожих ученых в Америке» . Crosstalk.cell.com . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ «СТИПЕНДИИ MERCK ПРОДВИНУТ ИССЛЕДОВАНИЯ ПОЧЕТНИКОВ ГИББСА И ДСУЗЫ» . mcbpublic.unix.fas.harvard.edu . 12 марта 2014 года . Проверено 17 июня 2020 г.
- ^ Jump up to: а б с «Динамики» . nsaws2015.weebly.com . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ Jump up to: а б с «Гиббс К.А.[Автор] - Результаты поиска» . ПабМед . Проверено 18 июня 2020 г.
- Живые люди
- Преподаватели Гарвардского университета
- Американские микробиологи
- Американцы ямайского происхождения
- Выпускники медицинского факультета Стэнфордского университета
- Выпускники Гарвардского колледжа
- Американские женщины-биологи
- Американские женщины-ученые
- Американские женщины-учёные XXI века
- Женщины-микробиологи