Поспивироиды
Поспивироиды | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вироид |
Семья: | Поспивироиды |
Роды | |
Поспивироиды [ 1 ] представляют собой семейство incertae sedis оцРНК- вироидов , состоящее из 5 родов и 39 видов , включая первый обнаруженный вироид, PSTVd , который является частью рода Pospiviroid . [ 2 ] Их вторичная структура является ключом к их биологической активности . Классификация этого семейства основана на различиях в консервативной последовательности центральной области. [ 3 ] Репликация Pospiviroidae происходит асимметричным образом с помощью РНК-полимеразы , РНКазы и РНК-лигазы клетки-хозяина . Его хозяевами являются растения , особенно двудольные и некоторые однодольные .
Геном
[ редактировать ]Представители семейства Pospiviroidae имеют кольцевую оцРНК длиной 246–375 нт. Они принимают палочковидные или квазипалочковидные конформации, содержащие центральную консервативную область (CCR) и терминальную консервативную шпильку (TCH) или терминальную консервативную область (TCR). Геном вироидов не кодирует никаких белков. [ 4 ]
Репликация
[ редактировать ]Этот раздел может быть слишком техническим для понимания большинства читателей . ( Август 2023 г. ) |
Его репликация является ядерной и опосредована ДНК-зависимой РНК-полимеразой II, которая перенаправляется на использование матриц РНК посредством асимметричного механизма катящегося круга РНК-РНК. Молекулы циркРНК (+) полярности (по соглашению наиболее распространенная цепь in vivo ) неоднократно транскрибируются в олигомерные комплементарные (-) РНК. Такие интермедиаты служат матрицами для генерации олигомерных (+) РНК, расщепляемых ферментом хозяина класса РНКазы III. Концы полученных линейных мономеров лигируются . ДНК-лигазой хозяина 1 с образованием зрелой кольцевой вироидной РНК [ 4 ]
Таксономия
[ редактировать ]- Вироид плода яблочной ямочки
- Вироид кожи шрама Apple
- Апскавироид aclsvd
- Апскавироид cvd-VII
- DVD с апскавироидом
- Апскавироид глвд
- Апскавироид lvd
- Апскавироид plvd-I
- Апскавироид пвд
- Апскавироид пвд-2
- Вироид австралийской виноградной лозы
- Вироид погнутого листа цитрусовых
- Вироид, затмевающий цитрусовые
- Citrus viroid V
- Цитрусовый вироид VI
- Вироид желтой пятнистости виноградной лозы 1
- Вироид желтых пятен виноградной лозы 2
- Вироид грушевого волдыря
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Серьезно, Ф; Оуэнс, РА; Ли, Сан-Франциско; Матучек, Дж; Паллас, В; Рэндлс, Дж.В.; Сано, Т; Верховен, JTJ; Видалакис, Г; Флорес, Р; Консорциум отчетов ICTV (17 декабря 2020 г.). «Профиль таксономии вируса ICTV: Pospiviroidae » . Журнал общей вирусологии . 102 (2). дои : 10.1099/jgv.0.001543 . ПМЦ 8116940 . ПМИД 33331814 .
- ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2022 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2023 года . Проверено 20 августа 2023 г.
- ^ "ICTV Report Pospiviroidae" .
- ^ Jump up to: а б Франческо Ди Серио, Роберт А. Оуэнс, Ши-Фанг Ли, Матушек Дж., Паллас В., Джон В. Рэндлс, Сано Т., Якобус Т. Дж. Верховен, Видалакис Г., Флорес Р. (2020). «Профиль таксономии вируса ICTV: Pospiviroidae » . Джей Ген Вирол . 102 (2): 001543. doi : 10.1099/jgv.0.001543 . ПМЦ 8116940 . ПМИД 33331814 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- ICTV Report: Pospiviroidae
- Веб-архив – обширная информация о поспивириоидах и вироидах.