Терминатор репликации TUS Family

TUS , также известный как вещество использования термина , является белком, который связывается с последовательностями терминатора и действует как контр- геликаза , когда он вступает в контакт с продвигающей геликазой. [ 2 ] Связанный белок TUS эффективно останавливает движение ДНК -полимеразы . [ 2 ] TUS помогает прекратить репликацию ДНК в прокариотах . [ 2 ]
В E. coli TUS связывается с 10 тесно связанными сайтами, кодируемыми в хромосоме . Каждый сайт состоит из 23 пары базовых. 10 сайтов называются TER -сайтами и обозначены Tera , Terb , ..., Terj . Эти сайты связывания являются асимметричными, так что, когда TUS-ter-комплекс (белок TUS, связанный с сайтом TER), встречается репликационной вилкой из одного направления, комплекс диссоциируется, а репликация продолжается (допускающе). Но при столкновении с другого направления, комплекс TUS-TER обеспечивает гораздо больший кинетический барьер и останавливает репликацию (непермиссивную). Многочисленные сайты TER в хромосоме ориентированы так, что две противоположные вилки репликации оба остановились в желаемой области завершения. [ 3 ]
Bacillus subtilis использует белок терминатора репликации (RTP) вместо tus.
Белковые домены
[ редактировать ]Белок TER содержит два домена. N-концевой домен состоит из альфа-спиралей , бета-листа и трех петлей. С-концевой домен состоит из двух альфа-спиралей и одного бета-листа . [ 4 ]
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- «Взаимодействие белка терминатора репликации Escherichia coli (TUS) с ДНК: модель, полученная из ДНК-связывающих исследований мутантных белков с помощью поверхностного плазмонного резонанса». [ 5 ]
- «Прекращение репликации в Escherichia coli: структура и антигеликазная активность комплекса TUS-TER». [ 6 ]
- «Молекулярная мышечная ткань определяет полярность прекращения репликации ДНК в кишечной палочке». [ 3 ]
- «Выделение и характеристика мутантов TUS, белок остановки репликации Escherichia coli». [ 7 ]
- «Биофизические характеристики TUS, белок остановки репликации Escherichia coli». [ 8 ]
- «Структура белка репликации-концевого белка в комплексе с ДНК». [ 1 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Камада, К.; Horiuchi, T.; Ohsumi, K.; Shimamoto, N.; Морикава К. (1996). «Структура белка репликации-концов, в комплекте с ДНК». Природа . 383 (6601): 598–603. Bibcode : 1996natur.383..598k . doi : 10.1038/383598a0 . PMID 8857533 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в Слончевский, Джоан и Джон Уоткинс. Взращивать. Микробиология: развивающаяся наука. Нью -Йорк: WW Norton &, 2009. Print.
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Mulcair, M.; Schaeffer, P.; Oakley, A.; Крест, H.; Neylon, C.; Hill, T.; Диксон Н. (2006). «Молекулярная мышечная ткань определяет полярность прекращения репликации ДНК в кишечной палочке» . Клетка . 125 (7): 1309–1319. doi : 10.1016/j.cell.2006.04.040 . PMID 16814717 .
- ^ Камада К., Хориучи Т., Осуми К., Шимамото Н., Морикава К. (1996). «Структура белка репликации-концов, в комплекте с ДНК» . Природа . 383 (6601): 598–603. Bibcode : 1996natur.383..598k . doi : 10.1038/383598a0 . PMID 8857533 .
- ^ Нейлон; Браун, SE; Kralicek, av; Майлз, CS; Любовь, Калифорния; Диксон, Н.Е. (2000). «Взаимодействие белка терминатора репликации Escherichia coli (TUS) с ДНК: модель, полученная из ДНК-связывающих исследований мутантных белков с помощью поверхностного плазмонного резонанса» (PDF) . Биохимия . 39 (39): 11989–11999. doi : 10.1021/bi001174w . PMID 11009613 .
- ^ Neylon, C.; Kralicek, av; Хилл, ТМ; Диксон, Н.Е. (2005). «Прекращение репликации в Escherichia coli: структура и антигеликазная активность комплекса TUS-TER» . Микробиология и молекулярная биология обзоры . 69 (3): 501–26. doi : 10.1128/mmbr.69.3.501-526.2005 . PMC 1197808 . PMID 16148308 .
- ^ Skokotas; Wrobleski, M.; Хилл, Т.М. (1994). «Выделение и характеристика мутантов TUS, белка остановки репликации Escherichia coli» . Журнал биологической химии . 269 (32): 20446–20455. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 32013-6 . PMID 8051142 .
- ^ Коскун-ари; Skokotas, A.; Мо, Гр; Хилл, Т.М. (1994). «Биофизические характеристики TUS, белок остановки репликации Escherichia coli» . Журнал биологической химии . 269 (6): 4027–4034. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 41737-6 . PMID 8307958 .