МолИДЭ
 | Эта статья включает список литературы , связанную литературу или внешние ссылки , но ее источники остаются неясными, поскольку в ней отсутствуют встроенные цитаты . ( Октябрь 2011 г. ) |
разработанная группой Данбрека в Онкологическом центре Фокс-Чейз , MolIDE, представляет собой программу с открытым исходным кодом кроссплатформенную для сравнительного моделирования белковых структур . MolIDE действует как графический пользовательский интерфейс для решения общих задач, связанных с прогнозированием белковых структур на основе известных гомологичных структур . Он реализует наиболее часто используемые шаги, связанные с моделированием: прогнозирование вторичной структуры , многораундное выравнивание псибластов, вспомогательное редактирование выравнивания (интеграция средства просмотра шаблонов и прогнозирования вторичной структуры), замена боковой цепи и построение цикла.
Ссылки
[ редактировать ]- Ван, Цян; Канутеску, Адриан А; Данбрэк, Роланд Л. (2008). «SCWRL и MolIDE: Компьютерные программы для прогнозирования конформации боковой цепи и моделирования гомологии» . Протоколы природы . 3 (12): 1832–47. дои : 10.1038/nprot.2008.184 . ПМК 2682191 . ПМИД 18989261 .
- Канутеску, А.А.; Данбрэк, РЛ (2005). «MollDE: фреймворк для моделирования гомологии, с которым можно работать» . Биоинформатика . 21 (12): 2914–6. doi : 10.1093/биоинформатика/bti438 . ПМИД 15845657 .