Caenorhabditis тропический
| Caenorhabditis тропический | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Эукариоты |
| Королевство: | животное |
| Тип: | Нематоды |
| Сорт: | Хромадория |
| Заказ: | Рабдитида |
| Семья: | Рабдитиды |
| Род: | Ценорхабдитис |
| Разновидность: | С. тропический
|
| Биномиальное имя | |
| Caenorhabditis тропический Феликс, Брэндл и Каттер, 2014 г. [ 1 ]
| |
| Синонимы | |
|
Caenorhabditis sp. 11 | |
Caenorhabditis тропический — это вид нематод Caenorhabditis , принадлежащий к Elegans супергруппе и группе Elegans внутри рода. [ 2 ] Это близкий родственник C. wallacei. C.tropicis часто собирают в тропической Южной Америке, на островах Карибского бассейна и на различных островах Индийского и Тихого океанов из гниющих фруктов, цветов и стеблей. C. тропический назывался « C. sp. 11». До 2014 года [ 1 ]
Анатомия
[ редактировать ]Средняя длина тела взрослых гермафродитов и взрослых самцов C.tropicis составила 1378,63 мкм и 992,85 мкм соответственно, в результате чего самцы и гермафродиты C.tropicis в среднем крупнее, чем другие виды-гермафродиты, такие как C. elegans и C. briggsae . [ 3 ]
Форма спикулы
[ редактировать ]Спикулы самцов C. тропического имеют длинную, тонкую, заостренную и простую морфологию, что является общей чертой среди видов Caenorhabditis за пределами супергруппы Elegans (за исключением C. japonica и C. afra ). [ 2 ]
Воспроизведение
[ редактировать ]C. тропический демонстрирует гермафродитный способ размножения. [ 1 ] Подобно C. elegans и C. briggsae , андродиоидные популяции C. тропических состоят из протандрических гермафродитов (кариотип половой хромосомы XX) и самцов X0. Эти три вида не являются ближайшими родственниками друг друга, что подтверждает независимое эволюционное происхождение гермафродитизма и андродиэции . [ 1 ] Самоплодная гермафродитная репродуктивная стратегия этих видов является примером конвергентной эволюции .
Экология
[ редактировать ]C. тропический был впервые обнаружен на острове Реюньон в Индийском океане в 2008 году с последующим сбором в Пуэрто-Рико и на островах Кабо-Верде в Атлантическом океане, во Французской Гвиане и Бразилии в Южной Америке и на Гавайях в Тихом океане. До сих пор образцы C. тропического были отобраны только из тропических регионов. [ 2 ] Это один из наиболее часто собираемых видов Caenorhabditis в природном заповеднике Нураг во Французской Гвиане, где он был выделен как в образцах подстилки, так и из гниющих фруктов и цветов. [ 4 ]
Как и другие виды Caenorhabditis, обитающие во влажных тропических лесах Французской Гвианы, C. тропический обычно встречается среди гниющих цветочных субстратов. Этот вид демонстрирует преимущественную связь с гниющими цветами на более ранних стадиях гниения, о чем свидетельствует уменьшение связи с цветами на более поздних стадиях гниения. [ 4 ]
C. тропический показал межвидовые ассоциации с Nematocida major , внутриклеточным патогеном, который также наблюдался в ассоциации с C. elegans и C. briggsae , двумя другими гермафродитными Caenorhabditis видами нематод . Заражение этими нематодами N. major наблюдалось только в тропических регионах, хотя C. elegans преимущественно встречается в регионах с умеренным климатом. [ 5 ]
Генетика
[ редактировать ]Геном эталонного штамма C. тропического штамма JU1373 состоит примерно из 79,32 миллиона пар оснований и 22 326 генов, кодирующих белки. Эти характеристики генома делают его короче, чем геном C. elegans , который состоит примерно из 100,29 миллионов пар оснований и 20 326 генов, кодирующих белок. [ 6 ] Как и все известные виды Caenorhabditis , геном C. тропического разделен на шесть хромосом (пять аутосом и одна «Х» половая хромосома).
Аутбредная депрессия
[ редактировать ]Как и другие виды Androdioecious Caenorhabditis, C.tropicis демонстрирует депрессию аутбридинга, опосредованную Medeaподобными элементами, что может привести к гибели потомства C.tropicis , что приводит к меньшим размерам популяции. Вероятно, именно поэтому C.tropicis сталкивается с эволюционным кризисом. давление с целью продемонстрировать высокие темпы инбридинга. Скрещивание штаммов C.tropicalis, изолированных из разных мест, приводило к более высокой частоте дефектного потомства по сравнению со скрещиванием штаммов C.tropicis из одного и того же места. [ 7 ] Высокие показатели инбридинга у C. тропических впоследствии привели к значительному снижению геномного разнообразия этого вида по сравнению с другими Caenorhabditis . нематодами [ 8 ] C. тропический , наряду с C. briggsae и C. elegans , два других гермафродитных вида Caenorhabditis демонстрируют на 20-40% меньшие размеры генома по сравнению с гонохорическими или мужско-женскими видами Caenorhabditis . [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д Феликс, Мари-Анн; Брэндл, Кристиан; Каттер, Ашер Д. (11 апреля 2014 г.). «Упрощенная система видовой диагностики Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) с названиями для 15 различных биологических видов» . ПЛОС ОДИН . 9 (4): е94723. Бибкод : 2014PLoSO...994723F . дои : 10.1371/journal.pone.0094723 . ПМЦ 3984244 . ПМИД 24727800 .
- ^ Jump up to: а б с Кионтке, Карин С; Феликс, Мари-Анн; Эйлион, Майкл; Рокман, Мэтью V; Брэндл, Кристиан; Пениго, Жан-Батист; Фитч, Дэвид Х.А. (2011). «Филогения и молекулярные штрих-коды Caenorhabditis с многочисленными новыми видами из гниющих фруктов» . Эволюционная биология BMC . 11 (1): 339. дои : 10.1186/1471-2148-11-339 . ПМЦ 3277298 . ПМИД 22103856 . S2CID 3170363 .
- ^ Виэль, Энн; Каллемейн-Торре, Николас; Гимонд, Клотильда; Пулле, Навсикая; Грей, Джереми С.; Каттер, Ашер Д.; Брэндл, Кристиан (ноябрь 2016 г.). «Конвергентная эволюция гигантизма сперматозоидов и причины изменчивости размеров сперматозоидов у нематод Caenorhabditis» (PDF) . Эволюция . 70 (11): 2485–2503. дои : 10.1111/evo.13043 . ПМИД 27565121 . S2CID 16937726 .
- ^ Jump up to: а б Феррари, Селин; Салле, Ромен; Каллемейн-Торре, Николя; Джовелин, Ричард; Каттер, Ашер Д.; Брэндл, Кристиан (декабрь 2017 г.). «Колонизация эфемерной среды обитания и неотропическое видовое богатство нематод Caenorhabditis» . БМК Экология . 17 (1): 43. дои : 10.1186/s12898-017-0150-z . ПМК 5738176 . ПМИД 29258487 .
- ^ Чжан, Гаотянь; Саксе, Мартин; Прево, Мари-Кристин; Луаллен, Роберт Дж.; Тромель, Эмили Р.; Феликс, Мари-Анн (12 декабря 2016 г.). «Большая коллекция новых микроспоридий, заражающих нематоды, и их разнообразные взаимодействия с Caenorhabditis elegans и другими родственными нематодами» . ПЛОС Патогены . 12 (12): e1006093. дои : 10.1371/journal.ppat.1006093 . ПМК 5179134 . ПМИД 27942022 .
- ^ Слос, Дитер; Судхаус, Уолтер; Стивенс, Льюис; Берт, Вим; Блакстер, Марк (23 февраля 2017 г.). «Caenorhabditis monodelphis sp. n.: определение морфологии стебля и геномики рода Caenorhabditis» (PDF) . БМК Зоология . 2 (1): 4. дои : 10.1186/s40850-017-0013-2 . S2CID 20541147 . ПроКвест 2348204867 .
- ^ Бен-Давид, Эяль; Плиота, Пенелопа; Уиден, Соня А.; Корешова, Алевтина; Лемус-Вергара, Цицики; Верпуховский, Филипп; Мандали, Шридхар; Брэндл, Кристиан; Бурга, Алехандро; Кругляк Леонид (март 2021 г.). «Повсеместные эгоистичные элементы токсина-противоядия у видов Caenorhabditis» . Современная биология . 31 (5): 990–1001.e5. дои : 10.1016/j.cub.2020.12.013 . ПМИД 33417886 . S2CID 230972352 .
- ^ Ноубл, Люк М; Юэнь, Джон; Стивенс, Льюис; Мойя, Николас; Персо, Риад; Москателли, Марк; Джексон, Жаклин Л; Чжан, Гаотянь; Читракар, Роджин; Боуг, Л. Райан; Брэндл, Кристиан; Андерсен, Эрик С; Зайдель, Ханна С; Рокман, Мэтью V (11 января 2021 г.). «Самолюбие — самый безопасный секс для Caenorhabditis тропического» . электронная жизнь . 10 : е62587. дои : 10.7554/elife.62587 . ПМЦ 7853720 . ПМИД 33427200 .
- ^ Берд, Дэвид МакК.; Блакстер, Марк Л.; Маккартер, Джеймс П.; Митрева, Македонка; Штернберг, Пол В.; Томас, В. Келли (декабрь 2005 г.). «Белая книга по сравнительной геномике нематод» . Журнал нематологии . 37 (4): 408–416. ПМК 2620993 . ПМИД 19262884 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта Rhabditida статья о круглых червях незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |