Мягкая гниль Enterobacteriaceae (SRE) малые РНК
Мягкая гниль Enterobacteriaceae ( SRE ) (охватывающая роды Erwinia , Pectobacterium , Dickeya и ) представляет собой повсеместные некротрофные бактериальные Pantoea патогены, поражающие большое количество различных видов растений по всему миру, включая экономически важные культуры. [ 1 ] [ 2 ]
Когда они живут в почве за пределами своих растений-хозяев, они голодают и вынуждены адаптироваться к этим новым условиям. С помощью анализа секвенирования РНК и in silico предсказания мРНК 137 малых РНК- кандидатов были идентифицированы у Pectobacterium atrosepticum в условиях голодания. Это предполагает, что мРНК играют роль в адаптивном ответе бактерий. Экспрессия 9 новых мРНК-кандидатов была подтверждена с помощью RT-PCR. К ним относятся антисмысловые РНК и области UTR . [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Причард, Лейтон; Гловер, Рэйчел Х.; Хамфрис, Соня; Эльфинстон, Джон Г.; Тот, Ян К. (17 декабря 2015 г.). «Геномика и таксономия в диагностике продовольственной безопасности: возбудители мягкогниющих энтеробактерий растений». Аналитические методы . 8 (1): 12–24. дои : 10.1039/C5AY02550H . ISSN 1759-9679 .
- ^ Чарковски, Эми О .; Линд, Дженна; Рубио-Салазар, Исаэль (01 января 2014 г.). «Геномика растительно-ассоциированных бактерий: мягкая гниль Enterobacteriaceae». Ин Гросс, Деннис К.; Лишайники-Парк, Энн; Коле, Читтаранджан (ред.). Геномика растительно-ассоциированных бактерий . Гейдельберг: Springer Berlin Heidelberg. стр. 37–58. дои : 10.1007/978-3-642-55378-3_2 . ISBN 978-3-642-55377-6 .
- ^ Квенда, Стэнфорд; Горшков Владимир; Рамеш, Аади Мулам; Найду, Санушка; Рубаготти, Энрико; Берч, Пол Р.Дж.; Молелеки, Люси Н. (12 января 2016 г.). «Обнаружение и профилирование малых РНК, реагирующих на стрессовые условия, у растительного патогена Pectobacterium atrosepticum» . БМК Геномика . 17:47 . дои : 10.1186/s12864-016-2376-0 . ISSN 1471-2164 . ПМК 4710047 . ПМИД 26753530 .