Интеролог

Интеролог — это консервативное взаимодействие между парой белков , имеющих взаимодействующие гомологи в другом организме. Этот термин был введен в статье 2000 года Уолхаутом и др. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Пример

Предположим, что A и B — два разных взаимодействующих белка человека, а A’ и B’ — два разных взаимодействующих белка собаки. Тогда взаимодействие между А и В является интерологом взаимодействия между А' и В', если выполняются все следующие условия:

А является гомологом А'. (Гомологи белков имеют сходные аминокислотные последовательности и происходят от общей предковой последовательности).
B является гомологом B'.
А и Б взаимодействуют.
А' и Б' взаимодействуют.

Таким образом, интерологи представляют собой гомологичные пары белковых взаимодействий у разных организмов.

См. также

Ссылки

^ Уолхаут, Эй Джей; Сорделла, Р.; Лу, Х.; Хартли, Дж.Л.; Темпл, ГФ; Браш, Массачусетс; Тьерри-Миг, Н.; Видаль, М. (2000). «Картирование взаимодействия белков у C. Elegans с использованием белков, участвующих в развитии вульвы». Наука . 287 (5450): 116–122. Бибкод : 2000Sci...287..116W . дои : 10.1126/science.287.5450.116 . ПМИД 10615043 .
^ Ю, Х.; Ласкомб, Нью-Мексико; Лу, ХХ; Чжу, X.; Ся, Ю.; Хан, доктор юридических наук; Бертен, Н.; Чунг, С.; Видаль, М.; Герштейн, М. (2004). «Перенос аннотаций между геномами: белок-белковые интерологи и белок-регулоги ДНК» . Геномные исследования . 14 (6): 1107–1118. дои : 10.1101/гр.1774904 . ПМЦ 419789 . ПМИД 15173116 .

Ю, Х.; Ласкомб, Нью-Мексико; Лу, ХХ; Чжу, X.; Ся, Ю.; Хан, доктор юридических наук; Бертен, Н.; Чунг, С.; Видаль, М.; Герштейн, М. (2004). «Перенос аннотаций между геномами: белок-белковые интерологи и белок-регулоги ДНК» . Геномные исследования . 14 (6): 1107–1118. дои : 10.1101/гр.1774904 . ПМЦ 419789 . ПМИД 15173116 .
Кеммер, Д.; Хуанг, Ю.; Шах, СП; Лим, Дж.; Брамм, Дж.; Юэнь, ММ; Линг, Дж.; Сюй, Т.; Вассерман, WW; Уэллетт, БФ (2005). «Улисс — приложение для проецирования молекулярных взаимодействий между видами» . Геномная биология . 6 (12): Р106. дои : 10.1186/gb-2005-6-12-r106 . ПМК 1414088 . ПМИД 16356269 .
Уайлс, AM; Додерер, М.; Руан, Дж.; Гу, ТТ; Рави, Д.; Блэкман, Б.; Бишоп, Эй Джей (2010). «Построение и анализ сетей белковых интерактомов путем межвидового сравнения» . Системная биология BMC . 4:36 . дои : 10.1186/1752-0509-4-36 . ПМЦ 2859380 . ПМИД 20353594 .

Внешние ссылки

Interactome.org : сайт-портал Interactome.
Interactomics.org : портал Интерактомики.
[1] : Сайт прогнозирования межвидового взаимодействия.

Эта статья, посвященная биоинформатике, незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Уолхаут, Эй Джей; Сорделла, Р.; Лу, Х.; Хартли, Дж.Л.; Темпл, ГФ; Браш, Массачусетс; Тьерри-Миг, Н.; Видаль, М. (2000). «Картирование взаимодействия белков у C. Elegans с использованием белков, участвующих в развитии вульвы». Наука . 287 (5450): 116–122. Бибкод : 2000Sci...287..116W . дои : 10.1126/science.287.5450.116 . ПМИД 10615043 .

[2] Ю, Х.; Ласкомб, Нью-Мексико; Лу, ХХ; Чжу, X.; Ся, Ю.; Хан, доктор юридических наук; Бертен, Н.; Чунг, С.; Видаль, М.; Герштейн, М. (2004). «Перенос аннотаций между геномами: белок-белковые интерологи и белок-регулоги ДНК» . Геномные исследования . 14 (6): 1107–1118. дои : 10.1101/гр.1774904 . ПМЦ 419789 . ПМИД 15173116 .

[ 1 ]

[ 2 ]