Разделение сайта
Сайты сегрегации — это позиции, которые демонстрируют различия ( полиморфизмы ) между родственными генами при выравнивании последовательностей (не консервативны ). [ 1 ] Сайты сегрегации включают консервативные , полуконсервативные и неконсервативные мутации.
Доля участков сегрегации внутри гена является важной статистикой в популяционной генетике, поскольку ее можно использовать для оценки частоты мутаций в предположении отсутствия отбора . Например, он используется для расчета Тадзимы D. статистики нейтральной эволюции

Последовательности представляют собой аминокислоты для остатков 120–180 белков. Остатки, консервативные во всех последовательностях, выделены серым цветом. Под белковыми последовательностями находится ключ, обозначающий консервативную последовательность (*), консервативные мутации (:), полуконсервативные мутации (.) и неконсервативные мутации ( ). [ 2 ]
См. также
[ редактировать ]- Сохраненная последовательность
- Ультраконсервативный элемент
- Выравнивание последовательности
- Программное обеспечение для выравнивания последовательностей
- КласталВ
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Фу, YX (октябрь 1995 г.). «Статистические свойства участков сегрегации». Теоретическая популяционная биология . 48 (2): 172–97. дои : 10.1006/tpbi.1995.1025 . ПМИД 7482370 .
- ^ «Кластерный FAQ #Символы» . Кластал . Проверено 8 декабря 2014 г.