Кенархей
Кенархей | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | Архея |
Королевство: | Протеоархеота |
Супертип: | ТАК группа |
Тип: | Термопротеота |
Сорт: | неопределенное место |
Заказ: | Ценархеальные |
Семья: | Ценархеевые |
Род: | Кенархей Престон, Ву, Молински и Де Лонг, 1996 г. [1] |
Разновидность: | С. симбиозум |
Биномиальное имя | |
Ценархеум симбиозный Престон, Ву, Молински и Де Лонг, 1996 г. [1] |
Ценархеум монотипический род архей . семейства Ценархеевые — [2] Морские археи Cenarchaeum symbiosum являются психрофильными и обитают в морских губках. [3] Cenarchaeum symbiosum первоначально был обнаружен как основной симбиотический микроорганизм, обитающий внутри (он является эндосимбионтом ) губки Axinella mexicana . [3] Он повсеместно обнаружен в Мировом океане в более низких концентрациях, а в некоторых родах морских губок он является одним из наиболее распространенных представителей микробиома. Последовательность и разнообразие его генома были подробно исследованы с целью обнаружения уникальных продуктов метаболизма и его роли в активности по окислению аммиака.
Геном
[ редактировать ]Длина генома C. symbiosum оценивается в 2,02 миллиона пар оснований с прогнозируемым количеством генов 2011 года. [4]
Экология
[ редактировать ]Cenarchaeum symbiosum — психрофильный организм, способный выживать и размножаться при низких температурах, обычно в пределах 7–19 градусов Цельсия. C. symbiosum имеет симбиотические отношения с некоторыми видами губок, обычно обитающими на глубине 10–20 метров, обычно недалеко от Калифорнии.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б « Ценархеум Престон, Ву, Молински и Де Лонг, 1996» . Глобальный информационный фонд по биоразнообразию . Проверено 28 апреля 2024 г.
- ^ См . веб-страницу NCBI , посвященную Кенархею . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.
- ^ Jump up to: а б Престон СМ, Ву КЮ, Молински Т.Ф., Де Лонг Э.Ф. (1996). «Психрофильный кренархеон обитает в морской губке: Cenarchaeum symbiosum gen. nov., sp. nov» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (13): 6241–6246. Бибкод : 1996PNAS...93.6241P . дои : 10.1073/pnas.93.13.6241 . ПМК 39006 . ПМИД 8692799 .
- ^ «Cenarchaeum symbiosum (Cenarchaeum symbiosum) Геномный браузерный шлюз» . Геномный браузерный шлюз . Проверено 25 мая 2011 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Амин, Шейди А; Моффетт, Джеймс В.; Мартенс-Хаббена, Вильм; Жако, Джереми Э; Хан, Ян; Девол, Аллан; Ингаллс, Анитра Э; Шталь, Дэвид А; Армбруст, Восточная Вирджиния (ноябрь 2013 г.). «Потребность в меди археи, окисляющей аммиак, Nitrosopumilus maritimus SCM1 и значение нитрификации в морской среде». Лимнология и океанография . 58 (6): 2037–2045. Бибкод : 2013LimOc..58.2037A . дои : 10.4319/lo.2013.58.6.2037 . S2CID 86826960 .
- Гарсия-Бонилья Э., Брандао ПФБ, Перес Т., Хунка Х. (2018), «Стабильный и обогащенный Cenarchaeum symbiosum и некультивируемые бетапротеобактерии HF1 в микробиоме средиземноморской губки Haliclona fulva (Demospongiae: Haplosclerida)» , Микробная экология , 77 , Springer Science and Business Media LLC: 25–36, номер номера : 10.1007/s00248-018-1201-5 , PMID 29766224
- Халлам, Стивен Дж; Константинидис, Константинос Т; Патнэм, Ник; Шлепер, Криста; Ватанабэ, Ёичи; Сугахара, Дзюнъити; Престон, Кристина; де ла Торре, Хосе; Ричардсон, Пол М; Делонг, Эдвард (28 ноября 2006 г.). «Геномный анализ некультивируемого морского кренархеота Cenarchaeum symbiosum» . Труды Национальной академии наук . 103 (48): 18296–18301. Бибкод : 2006PNAS..10318296H . дои : 10.1073/pnas.0608549103 . ПМЦ 1643844 . ПМИД 17114289 .
- Цинь В., Чжэн Ю., Чжао Ф., Ван Ю., Уракава Х., Мартенс-Хаббена В., Лю Х., Хуан Х., Чжан Х., Накагава Т. ., Менде, Д.Р., Боллманн, А., Ван, Б., Чжан, Ю., Амин, С.А., Нильсен, Дж.Л., Мори, К., Такахаши, Р., Вирджиния Армбруст, Э., Винклер, М.- К.Х., Делонг, Э.Ф., Ли, М., Ли, П.-Х., Чжоу, Дж., Чжан, К., Чжан, Т., Шталь, Д.А., Ингаллс, А.Е. (2020), «Альтернативные стратегии питательных веществ Карта сбора и сохранения энергии в биогеографии морских архей, окисляющих аммиак» , The ISME Journal , 14 (10), Oxford University Press (OUP): 2595–2609, Bibcode : 2020ISMEJ..14.2595Q , doi : 10.1038/s41396- 020-0710-7 , PMID 32636492
- Шлепер, Криста; Суонсон, Рональд В.; Матур, Эрик Дж.; Делонг, Эдвард Ф. (декабрь 1997 г.). «Характеристика ДНК-полимеразы некультивируемой психрофильной археи Cenarchaeum symbiosum» . Журнал бактериологии . 179 (24): 7803–7811. дои : 10.1128/jb.179.24.7803-7811.1997 . ЧВК 179745 . ПМИД 9401041 .
- Свон, Брэндон К.; Мартинес-Гарсия, Мануэль; Чаффин, Марк Д.; Моррисон, Хилари Г.; Филд, Эрин К.; Поултон, Николь Дж.; Масланд, Э. Дэшил П.; Харрис, Кристофер С.; Щирба, Александр; Чейн, Патрик С.Г.; Корень, Сергей; Войке, Таня; Степанаускас, Рамунас; и др. (17 апреля 2014 г.). «Геномное и метаболическое разнообразие морских Thaumarchaeota I группы в мезопелагии двух субтропических круговоротов» . ПЛОС ОДИН . 9 (4): е95380. Бибкод : 2014PLoSO...995380S . дои : 10.1371/journal.pone.0095380 . ПМЦ 3990693 . ПМИД 24743558 .
- Алвес, Р. Дж. Э., Минь, Б. К., Урих, Т., Хэселер, А. фон, Шлепер, К. (2018), «Объединение глобальной филогении и распределения в окружающей среде архей, окисляющих аммиак, на основе генов amoA» , Nature Communications , 9 , Springer Science and Business Media LLC: 1517, Bibcode : 2018NatCo...9.1517A , doi : 10.1038/s41467-018-03861-1 , PMC 5904100 , PMID 29666365