3 сделал
 | |
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | идентификация и классификация доменных взаимодействий известной трехмерной структуры . |
| Контакт | |
| Лаборатория | Институт исследований в области биомедицины, Барселона, Испания. |
| Авторы | Амели Штайн |
| Первичное цитирование | Штейн и др. (2011) [1] |
| Дата выпуска | 2010 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | http://3did.irbbarcelona.org |
База данных трехмерных взаимодействующих доменов ( 3did ) — это биологическая база данных , содержащая каталог белок-белковых взаимодействий , для которых известна 3D-структура высокого разрешения. [1] 3did собирает и классифицирует все структурные модели домен-доменных взаимодействий в Банке данных белков , предоставляя молекулярные подробности таких взаимодействий. 3did использует базу данных Pfam для определения положения белковых доменов в белковых структурах. 3did был впервые опубликован в 2005 году. [2] Текущая версия также включает в себя конвейер для обнаружения и аннотирования новых взаимодействий домен-мотив. Для каждого взаимодействия 3did идентифицирует и группирует различные режимы привязки, группируя схожие интерфейсы в «топологии взаимодействия». Поддерживая постоянно обновляемую коллекцию шаблонов структурных взаимодействий на основе доменов, 3did является справочным источником информации для структурной характеристики сетей взаимодействия белков. 3did обновляется каждые шесть месяцев и доступен для массовой загрузки и просмотра на http://3did.irbbarcelona.org . [3]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Штейн, Амели; Сеоль Арно; Элой Патрик (январь 2011 г.). «3did: идентификация и классификация доменных взаимодействий известных трехмерных структур» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных). Англия: D718–23. дои : 10.1093/nar/gkq962 . ПМК 3013799 . ПМИД 20965963 .
- ^ Штейн, А; Рассел, РБ; Элой, П. (2005). «3did: Взаимодействующие белковые домены известной трехмерной структуры» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (Проблема с базой данных): D413–7. дои : 10.1093/nar/gki037 . ПМК 539991 . ПМИД 15608228 .
- ^ Моска, Р; Сеол, А; Штейн, А; Оливелла, Р; Элой, П. (2014). «3did: Каталог доменных взаимодействий известной трехмерной структуры» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Проблема с базой данных): D374–9. дои : 10.1093/nar/gkt887 . ПМК 3965002 . ПМИД 24081580 .
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта биологическим базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |