Инициатива Монарха
Эта статья включает список общих ссылок , но в ней отсутствуют достаточные соответствующие встроенные цитаты . ( февраль 2018 г. ) |
Содержание | |
---|---|
Описание | Биоинформатическая база данных данных о генетических заболеваниях |
Типы данных захвачен | генотип , фенотип , вариант , болезнь , вид |
Организмы | многоклеточные животные |
Контакт | |
Первичное цитирование | Мунгалл и др. 2017 год |
Дата выпуска | 12 июля 2015 г. |
Доступ | |
Веб-сайт | https://monarchinitiative.org |
Инициатива Монарха [ 1 ] — это крупномасштабный веб-ресурс по биоинформатике, ориентированный на использование существующих биомедицинских знаний для связи генотипов с фенотипами и оказания помощи в исследованиях, направленных на борьбу с генетическими заболеваниями . нескольких видов Monarch делает это путем интеграции знаний о генотипах , фенотипах , генетических вариантах и заболеваниях из различных существующих ресурсов биомедицинских данных в централизованную и структурированную базу данных. Хотя этот процесс интеграции традиционно выполнялся вручную фундаментальными исследователями и врачами в индивидуальном порядке, The Monarch Initiative обеспечивает агрегированный и структурированный набор данных и инструментов, которые делают исследование биомедицинских знаний более эффективным и действенным.
Онтология Мондо
[ редактировать ]Онтология Mondo является продуктом Monarch Initiative. Он обеспечивает онтологию заболеваний и расстройств, как редких, так и распространенных. [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Мангалл, Кристофер Дж.; Макмерри, Джули А.; Кёлер, Себастьян; Балхофф, Джеймс П.; Борромео, Чарльз; Браш, Мэтью; Карбон, Сет; Конлин, Том; Данн, Натан (4 января 2017 г.). «Инициатива Монарха: интегративная платформа данных и аналитики, соединяющая фенотипы с генотипами разных видов» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (Д1): Д712–Д722. дои : 10.1093/nar/gkw1128 . ISSN 1362-4962 . ПМК 5210586 . ПМИД 27899636 .
- ^ Шефчек, Кент А; Харрис, Номи Л; Гаргано, Майкл; Матенцоглу, Николас; Унни, Дипак; Браш, Мэтью; Кейт, Дэниел; Конлин, Том; Василевский, Николь; Чжан, Синминь Аарон; Балхофф, Джеймс П.; Бэбб, Ларри; Белло, Сьюзен М; Блау, Ханна; Брэдфорд, Ивонн; Карбон, Сет; Кармоди, Ли; Чан, Лорен Э; Чиприани, Валентина; Кузик, Алейн; Рокка, Мэри Д; Данн, Натан; Эссаид, Шахим; Фей, Петра; Гроув, Крис; Гурдин, Жан-Филипп; Хамош, Ада; Харрис, Мидори; Хельбиг, Инго; Хоатлин, Морин; Иоахимиак, Марцин; Юпп, Саймон; Летт, Кеннет Б; Льюис, Сюзанна Э; Макнамара, Крейг; Пендлингтон, Зои М; Пилигрим, Клэр; Путман, Тим; Раванмер, Вида; Риз, Джастин; Риггс, Эрин; Робб, София; Ронкалья, Паола; Сигер, Джеймс; Сегерделл, Эрик; Симилук, Морган; Шторм, Андреа Л; Таксон, Кортни; Тессен, Энн; Якобсен, Юлиус О.Б.; Макмерри, Джули А; Гроза, Тюдор; Колер, Себастьян; Смедли, Дамиан; Робинсон, Питер Н; Мангалл, Кристофер Дж; Гендель, Мелисса А; Муньос-Торрес, Моника С; Осуми-Сазерленд, Дэвид (8 ноября 2019 г.). «Инициатива «Монарх» в 2019 году: интегративная платформа данных и аналитики, соединяющая фенотипы с генотипами разных видов» . Исследования нуклеиновых кислот . 48 (Д1): Д704–Д715. дои : 10.1093/nar/gkz997 . ПМК 7056945 . ПМИД 31701156 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Информатика генома мыши
- Информационная сеть данио
- База данных WormBase по биологии нематод
- FlyBase
- Международный консорциум по фенотипированию мышей
- База данных феномов мышей
- Онлайн-менделевское наследование у животных
- КлинВар
- Менделевское наследование у человека
- ОРФАНЕТ
- Анализ белков с помощью системы классификации эволюционных связей
- Институт медицинских исследований Кориелла
- База данных сравнительной токсикогеномики
- Онтология фенотипа человека
- Киотская энциклопедия генов и геномов
- MyGene.info
- Национальный центр биотехнологической информации
- БиоГРИД
- Каталог ГВАС
- ЖивотноеQTLdb
- База данных Ensembl автоматически аннотированных геномных данных
- База данных онтологии генов
- Генные обзоры
- Комитет по генной номенклатуре HUGO
- Ресурсные и исследовательские центры по мышам-мутантам
- Reactome — тщательно подобранная база знаний о биологических путях
- Программа недиагностированных заболеваний (UDP)
- НИТЬ