Келли ZnS

Келли $Z_{nS}$ — это тестовая статистика , которую можно использовать для проверки генетической области на наличие отклонений от нейтральной модели , основанную на квадратичной корреляции аллельной идентичности между локусами.

Подробности

Данные локусы $i$ и $j$, $D_{ij}$ Неравновесие по сцеплению между этими локусами обозначается как

$D_{ij}=p_{ij}-p_{i}p_{j}$

где $p_{ij}$ - частота альтернативного аллеля в i и j, встречающегося одновременно, и $p_{i}$ и $p_{j}$ частота альтернативного аллеля в $i$ и $j$ соответственно.

стандартизированной мерой этого является $\delta _{ij}$ квадрат корреляции аллельной идентичности между локусами $i$ и $j$

$\delta _{ij}={\frac {D_{ij}^{2}}{p_{i}(1-p_{i})p_{j}(1-p_{j})}}$

Где $Z_{nS}$ средние значения $\delta _{ij}$ по всем парным комбинациям между S-локусами.

$Z_{nS}={\frac {2}{S(S-1)}}\sum _{i=1}^{S-1}\sum _{j=i+1}^{S}\delta _{ij}$

Использование

Надутый $Z_{nS}$ баллы указывают на отклонение от нейтральной модели и могут использоваться как потенциальный признак предыдущего выбора.