Т-образный рычаг
Т -плечо или Т-петля представляет собой специализированную область молекулы тРНК , которая действует как специальный сайт узнавания рибосомы для формирования комплекса тРНК-рибосома во время трансляции белка биосинтеза или (биология) .
Т-образный рычаг состоит из двух компонентов; Т-образный стержень и Т-образная петля.
- Т-образный стебель состоит из серии парных нуклеотидов, обычно 5 пар, но иногда всего 1 или целых 6. [ 1 ] [ 2 ]
- Т-петлю также часто называют плечом TΨC из-за присутствия остатков риботимидина (T/m5U), псевдоуридина и цитидина . Он складывается в уникальный структурный элемент, состоящий из сложенных друг на друга оснований в развороте, который теперь называется «мотивом Т-образной петли». [ 3 ]
- У архей m5U заменен на N1-метилпсевдуридин (m1Ψ). Считается, что модификация m5U/m1Ψ в положении 54 увеличивает структурную стабильность. [ 4 ]
Организмы с Т-петлей, лишенной тРНК, демонстрируют гораздо более низкий уровень аминоацилирования и связывания EF-Tu , чем организмы, имеющие нативную тРНК. [ нужна ссылка ]
Мотив Т-петли был идентифицирован как повсеместный структурный элемент в ряде некодирующих РНК. [ 3 ] По крайней мере, еще один экземпляр Т-петли, обнаруженный в рРНК, также несет модификацию m5U. [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ланг, Б. Франц; Лавров, Денис; Бек, Наташа; Штейнберг, Сергей В. (2012). «Структура митохондриальной тРНК, идентичность и эволюция генетического кода». В Буллервелле, Чарльз Э. (ред.). Генетика органелл . Берлин: Шпрингер. стр. 431–474. дои : 10.1007/978-3-642-22380-8_17 . ISBN 9783642223792 .
- ^ Дирхаймер, Г.; Кейт, Г.; Дюма, П.; Вестхоф, Э. (1995). «Первичная, вторичная и третичная структуры тРНК». Ин Зёлль, Дитер; РаджБхандари, Уттам (ред.). тРНК: структура, биосинтез и функции . Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. стр. 93–126. дои : 10.1128/9781555818333.ch8 . ISBN 9781555810733 .
- ^ Jump up to: а б Чан, CW; Четнани, Б; Мондрагон, А. (сентябрь 2013 г.). «Структура и функция структурного мотива Т-петли в некодирующих РНК» . Междисциплинарные обзоры Wiley. РНК . 4 (5): 507–22. дои : 10.1002/wrna.1175 . ПМЦ 3748142 . ПМИД 23754657 .
- ^ Вурм Дж.П., Гриз М., Бахр У., Хелд М., Хекель А., Карас М. и др. (март 2012 г.). «Идентификация фермента, ответственного за N1-метилирование псевдоуридина 54 в тРНК архей» . РНК . 18 (3): 412–420. дои : 10.1261/rna.028498.111 . ПМК 3285930 . ПМИД 22274954 .
Напротив, у большинства архей это положение занято другим гипермодифицированным нуклеотидом — изостерическим N1-метилированным псевдоуридином.
- ^ Пауэлл, Калифорния; Минчук, М. (апрель 2020 г.). «TRMT2B отвечает за m(5)U-метилирование тРНК и рРНК в митохондриях человека» . Биология РНК . 17 (4): 451–462. дои : 10.1080/15476286.2020.1712544 . ПМЦ 7237155 . ПМИД 31948311 .